Forum: Recherche d'ORF

[ Return to forums ]
Messages Readers Subject
14 Feb 2024 18:41 Rapha L3_BBMCG_Limoges2024
1
10 Recherche d'ORF
12 Feb 2024 16:57 merlishhh L3_BBMCG_Limoges2024
2
25 ORF finding
27 Nov 2023 15:00 R_Delage Rennes_M2_2023
1
9 ORF Finder for reverse sequence (with SMS)
27 Nov 2023 15:00 D_Roy Rennes_M2_2023
1
8 SMS ORfinder for reverse sequence
27 Nov 2023 14:53 AntoineMD Rennes_M2_2023
1
9 1 ORF found frame 3 direct
27 Nov 2023 14:50 AntoineMD Rennes_M2_2023
1
6 No ORFs were found
13 Nov 2023 14:12 Cate L3-PGF-CTES-2023-24
2
24 Choix d'ORF
10 Nov 2023 11:02 MPAULINE L3-PGF-CTES-2023-24
2
26 ORF complet ou non
3 Nov 2023 15:25 Snow L3-PGF-CTES-2023-24
2
19 Deux ORF potentiel
27 Oct 2023 14:36 Yael L3-PGF-CTES-2023-24
3
42 ORF faux positif
26 Oct 2023 19:35 P_Hingamp_PGF23 L3-PGF-2023
1
14 Nomenclature éclatée au sol des gènes accessoires...
24 Oct 2023 11:31 P-DaLo UCA_23_24
1
23 ORF22
24 Oct 2023 11:30 P-DaLo UCA_23_24
1
13 ORF2
24 Oct 2023 11:28 P-DaLo UCA_23_24
1
6 ORF2
22 Oct 2023 18:38 Yael L3-PGF-CTES-2023-24
2
24 nombre maximal d'ORF
10 Oct 2023 19:12 Spoon L3-PGF-CTES-2023-24
2
32 ORFs
29 May 2023 17:06 princesses WutAMU2023
1
12 Modifier la classification de ORF2
13 Apr 2023 15:07 Printemps2023 L3-PGF-CTES-2023
4
36 statut 3' incomplet
30 Mar 2023 20:05 Varly L3-PGF-CTES-2023
2
22 ORf
12 Mar 2023 19:35 noapardo L3-PGF-CTES-2023
4
56 Choix d'ORF
27 Feb 2023 18:33 noapardo L3-PGF-CTES-2023
2
34 Determiner les ORF individuellement
21 Feb 2023 19:24 retenodus L3-PGF-CTES-2023
3
52 ORF non complet / classification
30 Jan 2023 10:27 Veronica L3-PGF-CTES-2023
3
54 ORFs sans homologue sur Swiss Prot
30 Jan 2023 10:18 Veronica L3-PGF-CTES-2023
3
66 Choix ORFs
16 Oct 2022 19:47 Lesboss BioCell2022
1
42 diagramme orf
5 Oct 2022 15:17 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
2
36 Gènes absents
15 Apr 2022 15:43 miyuka Bioch2022
4
40 Choix de l'ORF KNOWN
14 Apr 2022 15:34 AshleyRusso L3-PGF-CTES-2021
2
29 ORF codant ? Pertinent pour annotation ?
11 Apr 2022 15:32 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021
3
45 choix de l'ORF
9 Apr 2022 13:57 mongeoussada Bioch2022
4
60 ORF complet ou incomplet
2 Apr 2022 18:00 Faiznaleann Bioch2022
1
12 choix de l'ORF
31 Mar 2022 14:13 Emilie20 L3-PGF-CTES-2021
2
34 Recherche Faux Positif
30 Mar 2022 14:16 MaeBinaud L3-PGF-CTES-2021
5
116 ORF complet ou non
11 Mar 2022 18:40 AgatheB L3-PGF-CTES-2021
7
148 Erreur codon stop
9 Mar 2022 10:41 MarinePapot L3-PGF-CTES-2021
6
121 fin ORF
6 Mar 2022 14:20 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021
5
95 questions sur sequence + diagramme
22 Apr 2021 11:59 MUTABAZI Brazza21
1
7 ORF
13 Apr 2021 14:33 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
4
74 Codon stop
11 Apr 2021 16:43 esther L3-PGF-CTES-2020
4
42 POYPEPTIDE SIZE
1 Apr 2021 15:09 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
4
84 Homologues
23 Mar 2021 21:31 Hope L3-PGF-CTES-2020
2
58 Choix de l'orf
22 Mar 2021 12:05 AlexTom L3-PGF-CTES-2020
5
78 Problème de résultat comparatif sur ORF SMS et NCBI
21 Mar 2021 17:05 lea19 L3-PGF-CTES-2020
2
38 compréhension des pourcentages d'identités
21 Mar 2021 15:27 AlexTom L3-PGF-CTES-2020
3
46 NCBI utilisation
21 Mar 2021 14:49 Julien051 L3-PGF-CTES-2020
4
92 <50% d'identité et hypothetic protein
21 Mar 2021 10:58 Julien051 L3-PGF-CTES-2020
4
87 Codon STOP dans la séquence.
20 Mar 2021 16:14 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
5
82 Fonction
19 Mar 2021 0:47 AnaisE L3-PGF-CTES-2020
3
40 (Quand) faut-il indiquer le "vrai" start de l'ORF ?
18 Mar 2021 10:15 ElisaM L3-PGF-CTES-2020
9
155 Choix ORF
18 Mar 2021 9:22 aminaza L3-PGF-CTES-2020
7
87 OFR
16 Mar 2021 21:59 AnaisE L3-PGF-CTES-2020
4
64 ORF complet ou incomplet ? Position du dernier nucléotide.
16 Mar 2021 10:27 Meglecz20CTES L3-PGF-CTES-2020
1
15 Choix de l’outil ORFinder
5 Mar 2021 11:23 Fatima L3-PGF-CTES-2020
4
59 ORF Finder results
5 Mar 2021 11:05 pierre_gerenton BISM21
2
38 ORF sans codon d'initiation
5 Mar 2021 11:03 Fatima L3-PGF-CTES-2020
3
40 ORF Finder results
4 Mar 2021 16:59 sterna L3-PGF-CTES-2020
2
36 ORF KNOWN ou NOVEL
4 Jan 2021 15:41 Meglecz20CTES L3-PGF-CTES-2020
6
92 test
21 Dec 2020 16:55 Team_IUT UCA_20_21
1
33 ORF
26 Nov 2020 17:07 Emistien UCA_20_21
1
58 ORFs
18 Nov 2020 15:54 NoelGrafenstein M1_Orsay_2020
2
23 Chevauchement alors que même fonctions chez homologue ?
12 Nov 2020 14:43 ammarweng M1_Orsay_2020
2
20 Nombre différent de résultats dans la recherche d'ORF avec SMS et NCBI
4 Nov 2020 19:09 NoelGrafenstein M1_Orsay_2020
2
24 Question
4 Nov 2020 17:14 BOUTAMAGAN M1_Orsay_2020
1
16 Résultat première recherche d'ORF
4 Nov 2020 16:27 sana-jiaying M1_Orsay_2020
3
48 Recherche d'ORF
18 Oct 2020 12:36 ChaDev Master-Mer-2020
12
168 Analyse des résultats
23 Aug 2020 12:18 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
5
100 Résultats bruts
14 Aug 2020 8:51 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
6
12 Bonjour Mme Meclecz, Je souhaiterai vous identifier des séquences ORF
14 Aug 2020 8:44 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
2
4 Bonjour Mme Meclecz,
16 Apr 2020 17:43 AgnesB L3-PGF-CTES-2019
5
52 Taux dimilarité>90% mais protéine hypothétique
16 Apr 2020 17:34 AgnesB L3-PGF-CTES-2019
6
76 Pas de codon START
20 Mar 2020 12:02 ouno Bioch2020
4
85 Poids Moleculaire
20 Nov 2019 12:44 anloiret UCA_19_20
1
45 1ère analyse
23 Oct 2019 12:45 carand0224 UCA_19_20
1
47 1ère analyse
23 Oct 2019 9:02 Mars UCA_19_20
1
47 ORFFinder
15 Apr 2019 10:04 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
54 Choix final
14 Apr 2019 20:40 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
30 Cas particulier
11 Apr 2019 11:25 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
28 Nombre à virgule
9 Apr 2019 13:42 sheina L3-PGF-CTES-2018
9
142 plus explications
9 Apr 2019 13:41 sheina L3-PGF-CTES-2018
1
13 plus explications
8 Apr 2019 21:56 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
48 Ai-je bien compris?
8 Apr 2019 15:06 DebB L3-PGF-CTES-2018
2
24 Message ERROR
6 Apr 2019 19:41 Leacauchois18 L3-PGF-CTES-2018
2
31 l'ORF contient un codon STOP
5 Apr 2019 13:58 DJABER-HOU L3-PGF-CTES-2018
3
46 Lecture du séquençage indirect
17 Mar 2019 14:52 teamNN Bioch2019
1
31 problème ORF Novel ou ORF Faux positif
18 Oct 2018 10:17 matali2018 UCA_2018
2
124 Recherche ORF
18 Oct 2018 10:17 matali2018 UCA_2018
1
57 Recherche ORF
26 Apr 2018 12:52 Rosonp Bioch2018
3
39 INTERPRO problème - sélection de séquences
20 Mar 2018 15:24 Rosonp Bioch2018
4
148 Choix de l'ORF, codon d'initiation
14 Feb 2018 19:29 GRP1_HEURTEL BISM2018
4
140 Quels ORFs à mettre dans le tableau d'illustration
6 Nov 2017 16:10 Anonymous01 BioCell2017
2
102 Erreur de copier/coller
14 May 2017 19:19 ClaraSophie Bioch2017
2
35 Cours Annotation Génome
28 Feb 2017 13:56 lasserve_aitou UCA_2016
1
74 ORF FINDER
31 Jan 2017 16:19 ClaraSophie Bioch2017
3
211 Search of ORF
3 Nov 2016 11:53 Bio3 BioCell2016
4
84 2 OFR avec des homologues
18 Nov 2015 14:46 lun BioCell2015
2
29 problème d'ORF
24 Oct 2015 14:53 JuSzLuCi BioCell2015
4
122 ORF en sens indirecte prennant la totalité de la séquence.
10 Apr 2015 19:45 M_LIinot OBI
3
54 ORF bizares ;)
30 Mar 2015 18:05 tuxx Bioch2015
1
13 Question
5 Nov 2014 17:38 genouxcagneux BioCell2014
2
37 Recherche d'ORF avec atg, gtg, ctg, ttg
5 Oct 2014 9:38 MarvinOstagh BioCell2014
2
82 choix de L'ORF
11 May 2012 10:33 SoMe Biochimie 2012
5
90 Choix de l'ORF
10 Apr 2012 17:37 jash AMIG
5
95 Séquence non codante mais grand ORF
29 Feb 2012 19:47 win_mel Biochimie 2012
3
81 Choix de l'ORF
22 Apr 2011 1:36 bach Biochimie 2011
2
25 Taille de l'orf
7 Apr 2011 10:39 matir Biochimie 2011
1
18 choix ORF!
6 Apr 2011 18:01 matir Biochimie 2011
5
86 choix d'ORF
4 Apr 2011 0:21 reneejenni Biochimie 2011
2
30 Correction de l'ORF sélectionné lors de la première annotation
25 Mar 2011 15:56 BrothTeam Biochimie 2011
2
33 Long ORF, mais pas d'homologues
1 Mar 2011 10:49 reneejenni Biochimie 2011
7
341 Analyse de résultats sur les ORF signicatifs ou insignifiants
1 Mar 2011 8:21 gp2PESENTI Biochimie 2011
2
48 Traduction par l\'annotathon surprenante
16 Feb 2011 22:20 BrothTeam Biochimie 2011
2
42 Filtre ORF Finder NCBI
15 Feb 2011 22:11 reneejenni Biochimie 2011
2
63 Problême avec "any codon" par rapport à la grille d'évaluation
13 Feb 2011 11:19 matir Biochimie 2011
8
194 peut on utiliser Expasy pour chercher les ORF?
8 Feb 2011 19:00 meljess Biochimie 2011
2
65 Détermination des ORF
8 Feb 2011 12:50 BrothTeam Biochimie 2011
2
39 "Pas de superposition d'ORF possibles"...
7 Feb 2011 21:06 BrothTeam Biochimie 2011
5
125 ORF sur plusieurs cadres
7 Feb 2011 16:14 omarissem Biochimie 2011
4
111 ORF Finder ne trouve ni stop ni start
4 Feb 2011 17:23 BrothTeam Biochimie 2011
16
699 [ Warning ] 3' incomplete: following codon is not a STOP
4 Feb 2011 17:00 BrothTeam Biochimie 2011
6
143 Résultats différents avec les 2 types d'ORF finder -> ??
17 Dec 2010 12:00 MELO BioCell2010
2
40 SMS DNASTAT
4 May 2010 12:43 a20700687 Biochimie 2010
2
36 choix de l'ORF
2 May 2010 16:45 luminien Biochimie 2010
2
36 problème d'interprétation de la position de l'ATG
1 May 2010 20:48 luminien Biochimie 2010
2
17 étude à refaire avec codon atg
18 Apr 2010 20:10 marineoral Biochimie 2010
4
126 recherche d'ATG
8 Apr 2010 13:17 oralbre Biochimie 2010
4
89 ATG
19 Mar 2010 23:23 christhea Biochimie 2010
3
109 poids moleculaires
10 Mar 2010 22:16 dragonballz Biochimie 2010
4
172 Problème au niveau de la recherche d'ORF
2 Dec 2009 11:47 famar BioCell2009
2
57 pas de domaines protéiques
18 Nov 2009 12:13 ipbm BioCell2009
2
42 Nombreux codons stop sur l'ORF.
10 Nov 2009 17:36 NAME BioCell2009
2
56 codon STOP
29 Apr 2009 14:46 CALAMARS Biochimie 2009
2
36 problem pour définir l'orf
29 Apr 2009 14:38 mayanes Biochimie 2009
2
29 problème dans le choix de l'ORF
2 Apr 2009 8:56 warrios Biologie 2009
1
33 recherche ORF sens indirect cadre lecture1,2,3
31 Mar 2009 15:47 Adrien2 Biochimie 2009
3
161 ORF finder : fonctionnement
10 Mar 2009 15:37 lbfm Biochimie 2009
2
58 choix d'ORF
5 Mar 2009 12:10 catnat Biochimie 2009
4
141 ORF sans codon d'initiation et sans codon stop
17 Dec 2008 15:23 chalia BioCell2008
2
48 Poids moléculaire
15 Dec 2008 18:15 ci_co BioCell2008
4
84 Problème pour dénombrer des aa manquants !
28 Mar 2008 21:38 bioinfo Biochimie 2008
3
93 correction
26 Mar 2008 11:21 meilu Biochimie 2008
2
69 Début D'ORF sans codon d'initiation
1 Dec 2007 16:43 TAMT BioCell 2007
2
144 ORF...???
30 Nov 2007 17:31 djcorse BioCell 2007
5
150 ORF contient des codon(s) STOP (*)!
29 Nov 2007 10:05 vitalic BioCell 2007
5
215 CODON STOP DANS ORF
24 Nov 2007 15:00 NikOri BioCell 2007
2
60 Problème de choix d'ORF : 2 ORF pertinentes !
23 Nov 2007 14:57 cheikh BioCell 2007
4
122 any codon ou ATG
22 Nov 2007 20:59 original BioCell 2007
2
67 annotation 1
8 Nov 2007 0:14 emilu BioCell 2007
2
62 pertinence orf
29 Oct 2007 16:02 cheikh BioCell 2007
4
127 CODON STOP
17 Oct 2007 18:24 luluemmy BioCell 2007
3
93 recherche d'orf avec sms
10 Jun 2007 15:58 azerty13 Accès Libre
1
19 recherche d'ORF
23 May 2007 9:29 gwe ESIL biotech
1
9 ORF_GP19890.1
23 May 2007 9:24 hel ESIL biotech
2
21 ORF_CX19900
8 Apr 2007 17:33 mtadjdet Biochimie 2007
1
23 codon stop!
8 Apr 2007 17:32 mtadjdet Biochimie 2007
2
34 codon stop!