Bonjour , 

je suis assez perplexe et perdue vis à vis de certains résultats . 
en effet dans cette séquence je trouve deux ORFs codants l un sur le brin anti sens et l autre sur le brin sens . Et il est difficile pour moi de choisir avec certitude quel ORFs analyser. . 
Personnellement j'aurai choisi l'ORF7 car celui ci est un peu plus grand et il est suivit d'un ORf novel . 
 

Sur quoi-dois je m appuyer pour choisir entre les deux ORFs? 

en vous remerciant par avance , 

bien cordialement.
 

Veronica 

Bonjour Veronica,

Merci d’avoir posté vos questions sur le forum. Je constate avec joie que vous êtes plusieurs à avoir commencé le travail.

Les deux ORFs connus sont assez longs, donc à priori vous pouvez choisir n’importe lequel si leurs meilleurs hits ont <95%.
Vous pouvez tester les deux (fonction, choix le groupe taxonomique, construction de l’arbre) rapidement, sans rédiger vos analyses. Vous pouvez choisir le plus facile ou le plus intéressant.

Attention, l’ORF que vous avez affiché comme NOVEL est chevauchant avec l’ORF1. Peut-il être codant ?

Bon travail,
Emese Meglecz

Bonjour , 

Merci pour vos réponses. 
et effectivement je n avais pas pensé à regarder les ORFs du brin direct pour cette ORF. Comme  elle suivait un ORF codant il était pour moi logique qu elle soit Novel. 
 

Je vais donc rectifier cela ,

Cordialement

Veronica