Forum "Recherche d'ORF"

Thread subject: Poids Moleculaire

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Poids Moleculaire
ouno
20 Mar 2020 12:02
Non evaluated contribution

Bonjour, 

Concernant le PM de notre ORF, est ce à nous de le calculer ou on le trouve directement sur ORFinder du site NCBI?

B_Wirth_20
20 Mar 2020 13:28
Game master

Bonjour,

cf règles du jeu :

Masse moléculaire

Si l'ORF est complet (codon initiation->STOP), alors calculez la masse moléculaire théorique du polypetide correspondant à cet ORF en utilisant par exemple:

==> vous avez un lien vers la suite SMS, dans laquelle vous trouverez un outil pour faire ce calcul.

Bon travail,

BW

Yassine
20 Mar 2020 14:27
Non evaluated contribution

Bonjour, 

Et si l'ORF n'est pas complet en 5' ou en 3', on ne calcule donc pas son PM ?

Cordialement

B_Wirth_20
21 Mar 2020 9:16
Game master

Bonjour,

C'est cela, si ORF incomplet, le calcul n'est pas nécessaire.

Le poids moléculaire calculé est déjà une approximation. Si votre ORF est incomplet, la protéine putative correspondante est incomplète, cela n'a donc pas de sens de calculer un PM qui ne sera pas représentatif du PM de la protéine correspondante.

Bon travail,

BW