Forum: Alignement multiple: CLUSTALW

Messages Lecteurs Sujet 23 Nov 2023 20:33 Cate L3-PGF-CTES-2023-24 3 15 Arbre 23 Nov 2023 17:09 avigail L3-PGF-CTES-2023-24 7 70 phylogénie 9 Nov 2023 21:31 Yael L3-PGF-CTES-2023-24 7 72 séquences qui commencent en amont de mon ORF 29 May 2023 10:14 wuhan_killers WutAMU2023 2 26 Changer le nombre d'INDELS. 12 May 2023 0:28 Varly L3-PGF-CTES-2023 2 12 Nombres de séquences 28 Apr 2023 17:11 B_Wirth_23 Bioch2023 1 7 Trouver les résidus importants pour la fonction/activité de notre famille de protéines 14 Apr 2023 16:14 Printemps2023 L3-PGF-CTES-2023 1 11 ORF beaucoup plus court que les homologues 14 Apr 2023 13:57 Quentacio Bioch2023 2 27 Construction de l'arbre 31 Mar 2023 13:21 noapardo L3-PGF-CTES-2023 6 68 Choix de groupe d'étude 17 Mar 2023 0:28 AMIRA L3-PGF-CTES-2023 4 32 Choix des groupes extérieurs 3 Mar 2023 22:27 AMIRA L3-PGF-CTES-2023 4 54 Choix de groupe d'étude 2 Mar 2023 9:39 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023 4 64 resultats alignements multiples 28 Feb 2023 10:46 LEVY L3-PGF-CTES-2023 6 87 choisir des séquences 28 Apr 2022 11:41 B_Wirth_22 Bioch2022 1 13 Nombre d'aa manquants aux extrémités : /Blast et /clustalW 21 Apr 2022 15:08 SofiaOuarriche L3-PGF-CTES-2021 2 28 annalyse de l'orf 13 Apr 2022 11:32 soleneA L3-PGF-CTES-2021 2 31 Nombre de gap internes 12 Apr 2022 18:34 Anna L3-PGF-CTES-2021 4 55 Pourcentage identité faible dans l'alignement 5 Apr 2022 14:35 MaeBinaud L3-PGF-CTES-2021 4 88 Choix du groupe d'étude et du groupe extérieur 1 Apr 2022 17:13 maellejarnoux L3-PGF-CTES-2021 5 80 Choix du groupe d'étude 20 Oct 2021 10:28 Benameur L3-PGF-2021 2 36 SITE D INSERTION FCS 20 Oct 2021 10:17 Rahma L3-PGF-2021 2 29 FCS 19 Oct 2021 21:02 Soline1 L3-PGF-2021 2 28 MSA insertion FCS 19 Oct 2021 20:47 CHANGKE L3-PGF-2021 1 14 FCS dans certains CoV 19 Oct 2021 19:08 Lucas17 L3-PGF-2021 1 15 FCS 19 Oct 2021 17:20 JulietteR L3-PGF-2021 1 16 MSA de RdRP 19 Oct 2021 16:16 manonmtz30 L3-PGF-2021 1 19 MSA de RdRP sous format Gblocks montrant conversation des acides aminés 18 Oct 2021 23:57 thibaultbrunet L3-PGF-2021 1 16 MSA de RdRp illustrant les acides aminées conservées 18 Oct 2021 23:20 manonmtz30 L3-PGF-2021 2 31 MSA de spike montrant l'insertion de FCS dans SC2 18 Oct 2021 15:04 Ma-thilde L3-PGF-2021 2 33 Problème d'alignement multiple 18 Oct 2021 15:04 Ma-thilde L3-PGF-2021 1 10 Problème d'alignement multiple 17 Oct 2021 23:21 camr L3-PGF-2021 1 10 MSA de spike qui montre l'insertion de FCS dans SC2 17 Oct 2021 22:41 BulavkaOlha1 L3-PGF-2021 1 8 MSA de Spike avec observation d'insertion d'un FCS dans SC2 17 Oct 2021 22:39 antoinedewitte L3-PGF-2021 2 25 MSA de RdRp avec observation d'une très forte conservation des aa 17 Oct 2021 20:13 Chloe_llk L3-PGF-2021 1 11 MSA de spike avec observation d'insertion d'un FCS dans SC2 17 Oct 2021 19:07 JulietteR L3-PGF-2021 1 12 FCS dans SC2 17 Oct 2021 15:12 antoinedewitte L3-PGF-2021 1 14 MSA de Spike avec observation du FCS dans SC2 16 Oct 2021 18:32 thibaultbrunet L3-PGF-2021 1 12 MSA de spike avec observation d'insertion d'un FCS dans SC2 18 May 2021 11:58 Belmont L3-PGF-CTES-2020 1 9 Potentiel piste 14 May 2021 12:45 Belmont L3-PGF-CTES-2020 2 19 C-terminal 22 Apr 2021 11:15 rachel L3-PGF-CTES-2020 4 48 alignement bizarre 22 Apr 2021 11:14 rachel L3-PGF-CTES-2020 1 10 alignement bizarre 22 Apr 2021 11:06 rachel L3-PGF-CTES-2020 1 5 alignement bizarre 16 Apr 2021 10:01 ElisaM L3-PGF-CTES-2020 2 26 Pause D'AA 16 Apr 2021 10:01 ElisaM L3-PGF-CTES-2020 1 10 Pause D'AA 14 Apr 2021 22:56 lea19 L3-PGF-CTES-2020 3 45 alignement 11 Apr 2021 19:27 sterna L3-PGF-CTES-2020 8 106 positions conservées inf 100 11 Apr 2021 17:15 NAOMIE L3-PGF-CTES-2020 6 84 Alignement multiple erreur 11 Apr 2021 1:12 Hope L3-PGF-CTES-2020 2 26 a.multiple 10 Apr 2021 23:29 Hope L3-PGF-CTES-2020 2 26 nombre de position 7 Apr 2021 17:38 aminaza L3-PGF-CTES-2020 2 27 alignement 23 Mar 2021 10:15 Benjii936 L3-PGF-CTES-2020 8 159 homologie plutot faible 7 Nov 2020 20:15 Fanny_Smahan PGF-2020 2 21 alignement 29 Oct 2020 14:11 HajarIslem PGF-2020 2 18 un souci avec l'alignement 21 Mar 2020 15:50 YasmineMyriam Bioch2020 2 41 questions TP 21 Mar 2020 15:36 YasmineMyriam Bioch2020 2 40 questions TP 17 Mar 2020 19:31 NimboKami Bioch2020 8 225 les Blocs 21 May 2019 20:43 ramonapojar L3-PGF-CTES-2018 3 27 deux protéines dans le meme ORF ? 10 May 2019 23:12 Krystel L3-PGF-CTES-2018 4 69 Gaps à l'intérieur de l'alignement 26 Apr 2019 16:57 nicomine Bioch2019 2 26 Positions conservées et arbres phylogénétique 16 Apr 2019 12:16 sheina L3-PGF-CTES-2018 3 24 Déterminer la fonction de l'ORF 15 Apr 2019 22:14 teamNN Bioch2019 2 108 analyse attendue 4 Apr 2019 22:01 hayafarouz L3-PGF-CTES-2018 7 157 GROUPE D'etude imprecis mais forte e value 2 Apr 2019 15:03 JulieP L3-PGF-CTES-2018 5 105 Alignement me semblant mauvais 5 Dec 2018 12:30 cocodmt PGF-2018 3 64 Incompréhension 10 May 2018 21:56 sania Bioch2018 3 17 Bug de Gblocks 28 Apr 2018 15:10 MissDia95 Bioch2018 2 10 Protocole 14 May 2017 15:16 ClaraSophie Bioch2017 4 53 Faute dans le cours matrice de programmation dynamique. Chapitre 2 30 Mar 2017 13:50 Vincent-Marine Bioch2017 2 12 Problème de format 28 Oct 2016 15:07 estana BioCell2016 2 49 groupe extérieur/ étude 9 Dec 2015 19:18 Pilgrim BioCell2015 2 30 Erreur d'annotation pour la séquence avec le meilleur alignement 5 Dec 2015 11:49 JuSzLuCi BioCell2015 2 33 Pertes de positions conservés 4 Dec 2014 8:40 ELPO BioCell2014 2 25 Problème d'alignement avec les choix des groupes 4 Nov 2014 20:55 ioanaetlobna BioCell2014 2 76 problème au niveau de l'alignement multiple 31 Oct 2014 15:28 SoulaNin BioCell2014 2 52 Alignement multiple avec GBlocks 21 May 2012 16:14 Bonaiti Biochimie 2012 3 42 error alignement multiple 15 May 2012 9:35 gpe2-roche Biochimie 2012 2 23 Dans le cas d'un second arbre... 11 May 2012 15:26 clemshe Biochimie 2012 3 80 urgent erreur phylogeny.fr 5 May 2012 22:37 gp1sogno Biochimie 2012 4 68 nombre de positions conservées cohérent? 1 May 2012 13:28 groupe2rolland Biochimie 2012 3 91 curation impossible 30 Apr 2012 15:22 clemshe Biochimie 2012 1 8 erreur 18 Mar 2012 13:05 amel Biochimie 2012 3 71 problème d'alignement multiple 2 Mar 2012 11:12 DRAMALOVE Biochimie 2012 3 66 taxonomy report 2 Mar 2012 10:39 Sarahanais Biochimie 2012 3 87 question sur l'alignement multiple 28 Feb 2012 23:24 imane-hafsoi Biochimie 2012 3 135 Rapport taxonomique 28 Feb 2012 12:46 quentlude Biochimie 2012 4 108 Analyse résultats (GOS_2883010.73) 22 Feb 2012 19:25 B_Wirth_12 Biochimie 2012 1 5 22 Feb 2012 19:05 amel-faiza Biochimie 2012 2 47 alignement multiple SI BLASTp vs nr-env 22 Feb 2012 13:25 meline13 Biochimie 2012 6 384 alignement multiple 24 Apr 2011 22:50 reneejenni Biochimie 2011 2 9 entérobactéries introuvables 24 Apr 2011 22:47 reneejenni Biochimie 2011 2 24 définition d'un groupe d'étude 22 Apr 2011 14:40 lakisemedo Biochimie 2011 2 8 vraisemblance du codon start 18 Apr 2011 15:16 meljess Biochimie 2011 2 21 croisement avec INTERPRO 28 Feb 2011 13:42 reneejenni Biochimie 2011 4 88 alignement multiple de séquences protéiques et nucléiques ensemble? 24 Feb 2011 15:54 samiahafsoi Biochimie 2011 10 89 Recherche de groupes d'étude et groupes exterieurs 5 May 2010 21:59 sacha IS-UBP-2010 2 34 info sur le format de fichier a utiliser pour Gblocks 7 Apr 2010 23:15 oralblandine Biochimie 2010 3 69 avec ou sans groupe extérieur? 5 Apr 2010 17:03 soufvinc Biochimie 2010 6 776 Groupes d'étude et groupe externe 2 Apr 2010 11:18 hakuna IS-UBP-2010 8 241 Problème avec le site phylogeny 24 Nov 2009 12:52 sonia2hayiri BioCell2009 4 128 incohérence entre résultats du blast et alignement multiple 21 Nov 2009 8:35 NAME BioCell2009 3 43 probleme de chargement 9 May 2009 11:32 CALAMARS Biochimie 2009 4 59 Les zones de conservation des alignement multiples 2 May 2009 0:17 lorguais Biochimie 2009 2 32 Résultat après GBLOCKS 25 Apr 2009 23:18 marinedalila Biochimie 2009 4 72 G-BLOOK 20 Apr 2009 18:14 RAJESS Biochimie 2009 2 26 paramètre pour l'lignement multiple 2 Apr 2009 15:46 CALAMARS Biochimie 2009 3 113 CLUSTAL W utilisation de la fonction CURATION gblocks 30 Mar 2009 18:04 catnat Biochimie 2009 4 166 problème d'alignement 19 Dec 2008 20:17 casan BioCell2008 9 154 T-Coffee / 3D-Coffee 19 Dec 2008 14:43 Emiso BioCell2008 5 74 Alignement avec t coffee 18 Dec 2008 14:46 Emiso BioCell2008 2 25 mitochondrie 16 Dec 2008 14:56 marmoh BioCell2008 1 11 etiquette 2 16 Dec 2008 13:41 marmoh BioCell2008 4 113 Enlever une séquence ou non !? 16 Dec 2008 10:59 marmoh BioCell2008 6 65 Etiquette 7 Dec 2008 17:46 fowen BioCell2008 2 140 orf complet en 5\'? 26 Nov 2008 23:17 eniyro BioCell2008 11 525 Groupe d'étude et groupe exterieur 29 Nov 2007 9:56 milou BioCell 2007 2 66 groupe exterieur 13 Apr 2007 18:13 giraudaguerre Biochimie 2007 2 52 alignement multiple et HSP 24 Mar 2007 11:17 vleonet1 Biochimie 2007 2 52 Problème dans l'arbre 16 Mar 2007 15:54 sophmon Biochimie 2007 2 53 fonctionnement