Bonjour,
Mon alignement clustal est le suivant, je me demandais pourquoi à deux positions différentes il y avait une grande "pause" d'AA similaire, la peut-il venir d'une fusion de gènes? Où est-ce des parties on codantes ou peu importante en terme d'évolution qui ont été "effacé" chez certains individus?
Meric
CLUSTAL FORMAT: MUSCLE (3.8) multiple sequence alignment
BPAPPC2_Ba -------MSGSVNKVILLGNLGRDPEIRSMQSGKKMASFSIATSKRWKDRNTQEQKENTS
BPAPP3_Bac -------MVGSVNKAILLGNLGRDPEIRSMQSGSKMASFSIATSKRWKDRNTQEQKEKTS
BPAPu1_Bac -------MVGSVNKVILLGNLGRDPEIRSMQSGSKMANFSIATSKRWKDRNTQEQKEKTS
BPAPP2_Bac -------MAGSVNKVILIGNLGKDPDVRSTSNGGRFASFSIATSTKYRNKETQQLEDKTE
OMRGCv2_95 YLLIKKFMAGSVNKVILLGNLGKDPDIRATQAGSRLASFSIATSTKYRNKDTQQLEDKTE
BPAPP1_Bac -------MAGSVNKVILLGNLGKDPDIRATSAGSRLASFSIATSTKYRNKETQQLEDKTE
BPAPPC3_Ba -------MAGSLNKVFLIGRLGNDPDIKSTQNGKSVAILSLATSESWKDKNTGEKKEKTE
BPAPPC1_Ba -------MASSLNKVMLIGNLGADPIIRQTQDGKKLAQLSLATSESWKDKNTGERRDKTQ
BPAHCC2_Ba -------MAGSVNKVTLIGRLGKDPEVRNSPDGSKIVTMSVATSETWKDRASGERKERTE
BPAHCC1_Ba -------MAGSVNKVILVGNLGRDPEVRHMQDGNKVVQLSVATSEAWKDRTTGERRDRTE
BPARRN1_Ba -------MAGSVNKVILIGNLGKEPEVRSLQNGGKVCTLRIATSETWKDRGTGERQERTQ
BPARA1_Bac -------MAGSVNKVILVGNLGRDPEVRNTQSGSKIVNLAIATSDTWNDRNTGERRDRTE
BPARRO1_Ba -------MAGSVNKVILIGNLGRDPEIRSMQNGQKVANLALATSENWRDKQSGERRERTE
BPARTT1_Ba -------MAG-VNKVILVGNLGRDPEVRTSQDGSKIVNLNIATSESWKDRATGERKEKTE
BPARAG1_Ba -------MAGSVNKVILIGNLGRDPEVRNTQDGGKVVNFTLATSETWNDRASGERKERTE
BPARAA1_Ba -------MAGSVNKVILVGNLGKDPDVRSSQSGSKIVSFSLATSDTWNDRASGERRERTE
BPARAK1_Ba -------MAGSVNKVILVGNLGKDPEVRTSQSGAKIVSLTLATSDTWNDRASGERRERTE
BPARR1_Bac -------MAGSVNKVILVGNLGRDPEVRFSQDGKKIVNMSLATSESWNDRDTGERREKTE
BPARAA2_Ba -------MAGSVNKVILVGNLGRDPEIRTSQSGQKIASLSVATSDTWNDRTSGERRERTE
BPARRT1_Ba -------MAGSVNKVILIGNLGRDPEVRSTQDGMKIVNLAVATSETWRDRQSGERRERTE
BPARRT2_Ba -------MAGSVNKVILIGNLGRDPEVRTMNNGGKVVNLSVATSETWRDKNSGERQEKTE
* . :**. *:*.** :* :. * . : :*** :.:. : : :.*.
BPAPPC2_Ba WHNIVVFNEGLVDVIERYIKKGSKIYVEGELSTRKYQDK-DGNDKYTTEVVLQGYNSTLT
BPAPP3_Bac WHNIVVFGDGLVDIVEKYVKKGSKIYVEGELQTRKWQDK-DGNDRYTTEVILQGYNCNLT
BPAPu1_Bac WHNIVIFGDGLVDIVEKYVKKGSKVYVEGELQTRKWQDQ-EGKDRYTTEVILQGYNCNLT
BPAPP2_Bac WHRVIIFNEKLADISEKYLKKGSKIYLEGQLQTRKY-EQ-DGVTKYTTEVVIPNFGGVLT
OMRGCv2_95 WHRVVVFNDKLADICEKYLRKGSKIYIEGQLQTRKWTDN-NGVDKYTTEVVIPNYSGVLT
BPAPP1_Bac WHRVVVFNDKLADVCEKYLRKGSKVYVEGQLQTRKWTDN-NGVDKYTTEVVIPNYSGVLT
BPAPPC3_Ba WHRVVIFNEGLVNVVQKYLKKGAQVYVEGQISTTKYTDN-NGQEKFSTQIVLQGYNSTLT
BPAPPC1_Ba WHRIVIFNDGLAGVVENYLKKGSKIYIEGQLQTRKFTDN-NGVEKYTTEVVLANYNGTLT
BPAHCC2_Ba WHRVVIFNEKLGEIAERYLKKGGQVYLEGSLQTRKWTDP-QGIEKYTTEVVIQRYRGELT
BPAHCC1_Ba WHRVVIFNDRIAEIAERYLKKGAKVFLEGQLQTRKWTDQASGQEKYTTEIVIQKYKGELT
BPARRN1_Ba WHSVVIFNENLVGVAERFLKKGSKVYIEGQLETRKWQDQ-QGQERYTTEVVLRQFRGELT
BPARA1_Bac WHRVVIFNERVGDVAERYLRKGRKVYIEGELRTRKWTDQ-QGVEKYTTEVVIDRFRGNLV
BPARRO1_Ba WHRVVIFNENLIEIAEKYLRKGSKIYIEGSLQTRKWQDQ-SGQEKYTTEIVLQRYRGELT
BPARTT1_Ba WHRVVIFNPHLGDIAERYLKKGSTVYIEGALQTRKWTDQ-SGQEKYSTEVVIGRFKGELT
BPARAG1_Ba WHRVVVFNDRLADIAERYLRKGTKVYVEGALQTRKWTDQ-AGQEKYTTEVVISRFRGEIT
BPARAA1_Ba WHRVVIFNERLADVAERFLRKGRKVYLEGSLQTRKWTDQ-GGQERFTTEVIVDRFRGELV
BPARAK1_Ba WHRVVIFNERIGDVAERFLRKGRKVYLEGSLQTRKWTDQ-SGQDRYTTEVVVDRFRGDLV
BPARR1_Bac WHRIVIFNDRLADVAEKYLKKGSKIYVEGQLQTRKWTDN-AGVEKYSTEVVLQNFRGELT
BPARAA2_Ba WHRVVVFNDRIADVAERFLRKGRKVYVEGTLQTRKWTDQ-SGQEKYTTEIVLDRFRGELV
BPARRT1_Ba WHRVVIFNERLAEVAEKFLRKGSKVYVEGALQTRKWTDQ-QGQEKYTTEVVLQRFRGELT
BPARRT2_Ba WHRVVIFNEKLGEVAERFLKKGSKVYVEGALQTRKWTDQ-SGTEKYSTEVVLQRFRGELT
** :::*. : : :.::.** :::** : * *: : * .::*:::: : :.
BPAPPC2_Ba MLDSRNSGSASIE-----------------------------EAPNXSSLDSXLEDTLDS
BPAPP3_Bac LLDTRNNSQTSSN-----------------------------NNDQIDDSKSIEDDSIES
BPAPu1_Bac LLDSRNQSNNSLE-----------------------------SQSESMQDNSISDDSFGS
BPAPP2_Bac MLDSRSQSDS--------------------------------NQQTDQIESAADASVSPT
OMRGCv2_95 MLDTRSQSSVSE------------------------------ESNNNQLDSAADEAMGGS
BPAPP1_Bac MLDSRSQSTIS-------------------------------DDNSSQIDSAADEALGGP
BPAPPC3_Ba MLGGSNKA----------------------------------IESGIDQDTSSNLPSDES
BPAPPC1_Ba MLDSRGGGSS--------------------------------DFGGESSPQIDQDMSQDS
BPAHCC2_Ba LLESKGGSEGYSN---------DFD-------------TSPLGSGGGSSDPFSVAPAGGS
BPAHCC1_Ba LLDSRGEGSSS-------------------------------QVGESHTDYQPQRMAAGA
BPARRN1_Ba LLDGREGGGMGAGAGGASYDDRGGD-------------YGGGGYGGGSSYGGGGGGSYGG
BPARA1_Bac LLDSQRGGGDGGGYGDDGYDG-GYG-------------DGGSNWAGG---GSAPAGRGGA
BPARRO1_Ba MLDGRADGGSGSGGG-------SGG-------------GSGGGYESAQDDYSGGAASGPA
BPARTT1_Ba LLGGRGDSGGGGG-----------G-------------YGG-GGGGY---DESPRQGGGG
BPARAG1_Ba MLDSRSGGEGA-------------G-------------EGG-GYRSA---PAQRAPSGGG
BPARAA1_Ba LLDNKGNSEGGGNYPPPNN---GEN-------------SRSSTYGGQSANSGSAGGGWDA
BPARAK1_Ba LLDSNRGGEGGGDDMGGGYGG-G-G-------------YGG-GSGGG---YSAPARSQPQ
BPARR1_Bac MLDTRGGG----------------------------------GSGGDVQEPDYGPGPGAP
BPARAA2_Ba LLDGRGSGEGEEGGGGSSGYG-GAE-------------SDG-GFGGG---GGTPRRIGGA
BPARRT1_Ba MLDGRGEGGGGAEFGGGDDFGGGAGGGFGGGQGGGGRRGGGGGYGGGRGGQGGGTGGGQG
BPARRT2_Ba MLDGKGGGGGGAG---------GGD-------------DYGDDYGGGGGGNGGGGRSSGG
:* .
BPAPPC2_Ba QVSDSX---------------------------DLDDXIPF
BPAPP3_Bac QNNDSN---------------------------DLDEDIPF
BPAPu1_Bac NSSDSS---------------------------DLDEDIPF
BPAPP2_Bac EDNSTA----S----------------------KLDDDIPF
OMRGCv2_95 ETSTAE---------------------------QLDDDIPF
BPAPP1_Bac DNSTAE---------------------------QLDDDIPF
BPAPPC3_Ba VSKT-----------------------------KIDDEVPF
BPAPPC1_Ba NFSSSD----DL---------------------DIDDEIPF
BPAHCC2_Ba KGFD-----------------------------DLNDDIPF
BPAHCC1_Ba EGASVA----NLTS-------------------DLEDEIPF
BPARRN1_Ba GGGDYG----GGNRGGGSRGGSGGGSSRPSPAADLDDEIPF
BPARA1_Bac GGRGQQ----GGNFGGG----AGWDSSSGQGDQALDDEIPF
BPARRO1_Ba GSPARG----GS---------------------DLDDEIPF
BPARTT1_Ba GGGGRQ----GGG--------QSWEP--PA---DMDDEIPF
BPARAG1_Ba SGFGGG----SSRPASGG---SGWE---PSHGGDLDDEIPF
BPARAA1_Ba SGSGGS----G----------------------DLDDEIPF
BPARAK1_Ba RNNDRP----A-GGGGGSTG-GGWDA--PAGGSDLDDEIPF
BPARR1_Bac GATD-----------------------------DLDDDIPF
BPARAA2_Ba SGAGGA----GGARKSAPASPGGWDA--PSG--DLDDEIPF
BPARRT1_Ba GGFGGGYDDYGSDYGGGSSGGGRGGAGGGGGSNDLDDEIPF
BPARRT2_Ba GGGRKP----SG---------------------PIDDDIPF
::: :**