Bonjour, malgré tous nos efforts pour rendre la première évaluation avant ce soir, nous avons un problème avec l'alignement multiple. En effet, même avec seulement 50 séquences, nous restons bloqué au niveau de la page de chargement. Ayant attendu pendant plus de 30 minutes et après de nombreux essais nous en sommes toujours au même point. Nous aurions préféré rendre la première évaluation avec une fiche entièrement remplie. Nous essaierons de vous la rendre le plus tôt possible (dès que le site phylogeny voudra bien fonctionner).

Bonjour,
depuis deux jours nous avons le même problème, et ce, aussi bien avec une requète avec une vingtaine de séquence qu'avec une requète avec 3 séquences. Il semble qu'il soit impossible d'obtenir d'arbre pour le moment.

vous avez beaucoup trop de séquences!
Séquences retenues pour l'analyse phylogénétique :
93 séquences retenues + la séquence requête.
=> vous devez slectionner parmis vos résultats de BLAST, uner liste pertinente d'accessions! Rien ne sert d'avoir 80 beta proteobactéries par ex!. En diminuant le nombre de seq, vous devriez règler le pb d'alignement
sam

Merci de votre réponse,
Mais notre requête dans phylogénie.fr ne comporte que 30 séquences, de plus après avoir essayé de réduire au maximum le nombre de séquence pour voir si cela était la cause du problème. nous nous sommes aperçu que même avec 3 séquence le logiciel ne marchait pas, et restait bloqué sur l'étape de l'alignement.
Ce problème est récent il ne nous touche que depuis hier après-midi.

phylogeny.fr ne marche pas non plus pour nous. et nous lui soumettons seulement 50 séquences.
GuiMeuguimeu

pour nous aussi ça bug. désolée mais on ne pourra pas soummettre notre annotation complète.

Je répondais effectivement à hakuna dans ma première réponse. Vous êtes nombreux cet après-midi à avoir ce pb.
Je viens de tester le site phylo.fr et effectivement il y a des soucis d'alignement. Je vous propose de réessayer ce soir, on ne sait jamais....(?) (ne passez pas 2 heures à attendre les résultats de l'alignement, cela doit prendre qq minutes au plus).
Dans tous les cas, même si le work flow ne marche pas, je vous suggère de bien travailler la constitution de vos groupes (etude et extrne) à partir de vos résultats BLAST.Proposez moi au moins vos groupes dans cette evaluation1, nous pourrons  discuter ensemble de la pertinence de vos choix.
bon courage à tous.
sam

Bonsoir,
phylogeny ne fonctionne pas non plus pour nous, le site reste bloqué juste avant la construction de notre arbre. On ne pourra donc pas soumettre notre annotation complète.