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20
General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
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Sujet
25 Feb 2024 3:49
T_TRAN_USTH24
USTH2024
1
38
Lecture material
5 Sep 2023 5:09
zxjin426
KU-ILAS-23
2
36
Errors
20 Apr 2018 8:30
ashru2006
Open Access
1
48
Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29
ashru2006
Open Access
1
14
Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24
ashru2006
Open Access
1
10
Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39
E_Meglecz18
USTH2018
1
31
closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12
trungbui
USTH2017
1
43
Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53
CamaliaTan
PSB2016
2
81
This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51
staggerwin
Open Access
2
47
Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30
bigecske2
UNIDEB
1
30
annotálás
83
ORF finding
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Sujet
27 Jul 2018 11:32
Ryann
PSB2018
1
50
ORF
27 Jul 2018 11:27
Ryann
PSB2018
1
12
ORF
27 Jul 2018 11:11
Ryann
PSB2018
1
10
ORF
27 Jul 2018 9:31
NICSXY
PSB2018
1
14
orf_1
27 Jul 2018 9:25
NICSXY
PSB2018
1
20
ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35
Jeremylimsy1995
Open Access
1
12
orf
26 Jul 2018 10:57
riceline
PSB2018
1
10
FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42
riceline
PSB2018
1
3
FASTA
23 Jul 2018 13:36
shaz
PSB2018
1
24
NO ORF
23 Jul 2018 7:14
Thasheeni
PSB2018
1
27
ORF
32
Homolog hunting: BLAST
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Sujet
7 Sep 2023 8:44
P_Hingamp_KU
KU-ILAS-23
1
14
For detailed book chapter on BLAST scoring and E-values
6 Sep 2023 8:29
P_Hingamp_KU
KU-ILAS-23
4
55
Concerning Sora's mysterious truncated BLAST lists of hits
27 Jul 2018 11:36
Ryann
PSB2018
1
34
BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48
Thasheeni
PSB2018
1
26
BLASTp
21 Jul 2018 7:40
Janus
PSB2018
1
32
No significant homology
21 Jul 2018 7:32
Janus
PSB2018
1
20
Only one homologue
21 Jul 2018 7:29
Janus
PSB2018
1
15
No putative protein
21 Jul 2018 7:28
Janus
PSB2018
1
21
Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23
Janus
PSB2018
2
60
E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16
Tessaoh
PSB2018
1
18
No homology
8
Multiple sequence alignements
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Sujet
27 Jul 2018 11:41
Ryann
PSB2018
1
12
MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08
Thasheeni
PSB2018
1
37
Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40
SAS
BSB6_spring2011
1
24
MSA
28 Apr 2011 8:18
HiraEjaz
BSB6_spring2011
1
24
clustalw2
27 Apr 2011 9:52
B_hajra
BSB6_spring2011
1
50
multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37
B_hajra
BSB6_spring2011
1
19
multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36
sanafarheen
BSB6_spring2011
1
17
msa :D
18 Apr 2011 9:29
sid_afo
BSB6_spring2011
1
25
multiple sequnce alignmnt
17
Phylogenetic analysis
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Sujet
25 Jun 2016 19:30
18575801_SY
PSB2016
1
35
Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21
HiraEjaz
BSB6_spring2011
1
28
tree
27 Apr 2011 10:00
B_hajra
BSB6_spring2011
1
32
tree analysis
18 Apr 2011 9:38
sanafarheen
BSB6_spring2011
1
30
phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32
sid_afo
BSB6_spring2011
1
23
tree details
19 May 2009 11:17
Maleeha
BSB06CIIT
1
30
annotation
27 Nov 2008 20:14
drhoads
Open Access
11
910
How to get a textual phylogenetic tree?
1
Ontologies (molecular function & biological process)
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Sujet
25 Jun 2016 19:34
18575801_SY
PSB2016
1
9
ontologies
15
Conserved domains
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Sujet
24 Jul 2018 9:57
Grace
PSB2018
1
16
no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15
ashru2006
Open Access
1
21
INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14
ashru2006
Open Access
1
13
Protein Domains
20 Apr 2018 8:11
ashru2006
Open Access
1
7
Protein Domains
20 Apr 2018 8:07
ashru2006
Open Access
1
6
Protein Domains
20 Apr 2018 8:05
ashru2006
Open Access
1
3
Protein Domains
20 Apr 2018 8:04
ashru2006
Open Access
1
6
Protein Domains
20 Apr 2018 8:03
ashru2006
Open Access
1
7
Protein Domains
25 Jun 2016 19:32
18575801_SY
PSB2016
1
15
Conserved domains
25 Jun 2016 10:54
YAPws
PSB2016
1
8
Summary of TO78M_5925010.1
15
Conclusion
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Sujet
21 Jul 2018 7:38
Janus
PSB2018
1
29
Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32
nhminh0701
USTH2018
1
21
Vai cut
25 Jun 2016 19:35
18575801_SY
PSB2016
1
20
conclusion
24 Jun 2016 17:34
xuejing
PSB2016
1
19
Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28
Verniselim
PSB2016
1
15
Conclusion
24 Jun 2016 16:50
18393000
PSB2016
1
7
TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38
reggiepsb
PSB2016
1
13
Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25
SiowChen
PSB2016
1
4
>TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14
SyawqinaAdlin
PSB2016
1
7
Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40
018548141
PSB2016
1
14
Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
633
Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
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Sujet
5 Nov 2023 22:19
levana
L3-PGF-CTES-2023-24
2
36
doute annotation séquence
2 Nov 2023 16:34
Spoon
L3-PGF-CTES-2023-24
2
28
Choix de sequence
1 Jul 2023 7:10
Mounire
L3-PGF-CTES-2023
1
4
Fragment de séquence provenant de la mer Baltique. Annotathon
21 Feb 2023 21:37
marieb
L3-PGF-CTES-2023
3
54
ouvrir 2 pages d'annotation
9 Feb 2023 19:36
marieb
L3-PGF-CTES-2023
2
42
erreur
24 Nov 2022 10:51
AugustinF
L3-PGF-2022
1
13
Oral de Bioinformatique
23 Nov 2022 13:16
bouillard
L3-PGF-2022
2
26
pip
28 Sep 2022 18:52
bouillard
L3-PGF-2022
3
47
recherche sequence
21 Apr 2022 14:07
Ma93
L3-PGF-CTES-2021
4
64
choix du groupe d'étude
14 Apr 2022 9:10
Laurence
L3-PGF-CTES-2021
2
35
soumission séquence - passage de Annotation I à Corrrection I
466
Recherche d'ORF
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Sujet
26 Apr 2024 14:27
B_WIRTH_WUT_24
WutAMU2024
3
18
Message de 发送自
26 Apr 2024 11:45
B_WIRTH_WUT_24
WutAMU2024
2
8
Message de HU Lingao (seq HMP2_11729010.77)
15 Apr 2024 9:01
chengbams
WutAMU2024
2
40
ORF complet en 5' ou no?
14 Feb 2024 18:41
Rapha
L3_BBMCG_Limoges2024
1
17
Recherche d'ORF
12 Feb 2024 16:57
merlishhh
L3_BBMCG_Limoges2024
2
35
ORF finding
27 Nov 2023 15:00
R_Delage
Rennes_M2_2023
1
9
ORF Finder for reverse sequence (with SMS)
27 Nov 2023 15:00
D_Roy
Rennes_M2_2023
1
9
SMS ORfinder for reverse sequence
27 Nov 2023 14:53
AntoineMD
Rennes_M2_2023
1
9
1 ORF found frame 3 direct
27 Nov 2023 14:50
AntoineMD
Rennes_M2_2023
1
6
No ORFs were found
13 Nov 2023 14:12
Cate
L3-PGF-CTES-2023-24
2
26
Choix d'ORF
788
Recherche d'homologues: BLAST
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Sujet
15 Apr 2024 9:42
chengbams
WutAMU2024
2
22
e-value seuil par SP
15 Apr 2024 9:30
chengbams
WutAMU2024
2
14
differences between activity enzymatique and process biologique
15 Apr 2024 9:18
chengbams
WutAMU2024
2
26
list de Domaines Protéiques, le façon de rejeter certaine domaine
28 Nov 2023 16:44
Spoon
L3-PGF-CTES-2023-24
2
26
e-valeur seuil
26 Nov 2023 16:08
Spoon
L3-PGF-CTES-2023-24
2
14
Fonctions des sequences
25 Nov 2023 19:19
levana
L3-PGF-CTES-2023-24
2
19
plus d'alignement homologue groupe externe que groupe d'etude
25 Nov 2023 1:49
odessaH
L3-PGF-CTES-2023-24
2
23
Tableau de fonctions
24 Nov 2023 9:02
FlorentinS
L3-PGF-CTES-2023-24
4
40
Choix du niveau de classification taxonomique et du groupe d'étude
23 Nov 2023 20:00
levana
L3-PGF-CTES-2023-24
2
16
groupe externe
20 Nov 2023 13:14
Spoon
L3-PGF-CTES-2023-24
4
36
Uniprot
362
Alignement multiple: CLUSTALW
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Sujet
23 Nov 2023 20:33
Cate
L3-PGF-CTES-2023-24
3
15
Arbre
23 Nov 2023 17:09
avigail
L3-PGF-CTES-2023-24
7
70
phylogénie
9 Nov 2023 21:31
Yael
L3-PGF-CTES-2023-24
7
72
séquences qui commencent en amont de mon ORF
29 May 2023 10:14
wuhan_killers
WutAMU2023
2
26
Changer le nombre d'INDELS.
12 May 2023 0:28
Varly
L3-PGF-CTES-2023
2
12
Nombres de séquences
28 Apr 2023 17:11
B_Wirth_23
Bioch2023
1
7
Trouver les résidus importants pour la fonction/activité de notre famille de protéines
14 Apr 2023 16:14
Printemps2023
L3-PGF-CTES-2023
1
11
ORF beaucoup plus court que les homologues
14 Apr 2023 13:57
Quentacio
Bioch2023
2
27
Construction de l'arbre
31 Mar 2023 13:21
noapardo
L3-PGF-CTES-2023
6
68
Choix de groupe d'étude
17 Mar 2023 0:28
AMIRA
L3-PGF-CTES-2023
4
32
Choix des groupes extérieurs
1032
Analyse phylogénétique
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Sujet
28 Apr 2024 19:13
julien12138
WutAMU2024
1
5
La version correcte n'est pas sauvegardée
26 Apr 2024 14:09
B_WIRTH_WUT_24
WutAMU2024
2
12
Message de 逯泽晖
25 Apr 2024 12:03
B_WIRTH_WUT_24
WutAMU2024
2
16
Message de FAN Chenyue (séquence HMP2_11689030.117)
25 Apr 2024 12:02
B_WIRTH_WUT_24
WutAMU2024
1
3
Message de FAN Chenyue (séquence HMP2_11689030.117)
22 Apr 2024 13:11
chengbams
WutAMU2024
2
12
Arbre
18 Apr 2024 10:06
B_WIRTH_WUT_24
WutAMU2024
1
12
Message de Weizhe LU (séquence HMP2_11678060.146)
7 Jan 2024 17:50
TEHI
L3-PGF-CTES-2023-24
6
66
Réenraciner l'arbre
26 Nov 2023 14:36
levana
L3-PGF-CTES-2023-24
2
14
robustesse basse doute bis
26 Nov 2023 14:14
levana
L3-PGF-CTES-2023-24
1
8
robustesse basse
26 Nov 2023 3:29
Sarahdm
L3-PGF-CTES-2023-24
2
15
groupe d'étude
152
Domaines conservés: INTERPRO
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Sujet
24 Nov 2022 15:00
LesPerdus
BioCell2022
1
29
Petit problème sur la recherche de domaines protéiques INTERPRO
1 May 2022 17:41
SRSM
Bioch2022
2
9
Choix du domaine
11 Apr 2022 23:00
Sylia
Bioch2022
3
40
Domaine protéique non conservé dans la famille
26 Mar 2022 12:10
mongeoussada
Bioch2022
2
30
Choix du domaine retenu
13 Oct 2021 20:01
ilonaMi
Master-Mer-2021
3
35
Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:57
ilonaMi
Master-Mer-2021
1
8
Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:56
ilonaMi
Master-Mer-2021
1
8
Choix du profil Interpro pour table 2
4 Oct 2021 18:16
emmaRO
Master-Mer-2021
2
29
Domaines protéiques à annoter
27 Sep 2021 17:42
Thibault_A
Master-Mer-2021
2
34
Domaines protéiques INTERPRO
20 Sep 2021 11:15
ilonaMi
Master-Mer-2021
2
30
Base de données
55
Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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Sujet
28 Apr 2024 19:10
julien12138
WutAMU2024
1
5
Dernière version non sauvegardée
18 Apr 2024 10:27
B_WIRTH_WUT_24
WutAMU2024
2
28
Message de HU Yinghua (séquence HMP2_11687030)
28 Apr 2023 16:46
B_Wirth_23
Bioch2023
1
6
Absence de processus biologique dans Interpro
28 Apr 2023 16:32
B_Wirth_23
Bioch2023
1
3
Symbole de gène
29 Apr 2022 11:21
Faiznaleann
Bioch2022
4
31
Contradiction
28 Apr 2022 10:37
B_Wirth_22
Bioch2022
1
12
Choix du Processus biologique
21 May 2019 18:52
DebB
L3-PGF-CTES-2018
3
53
Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15
MissDia95
Bioch2018
1
13
Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24
ClaraSophie
Bioch2017
2
46
Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22
Vincent-Marine
Bioch2017
3
71
Choix de la fonction/processus et gène
129
Conclusion
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Sujet
28 Dec 2023 16:23
odessaH
L3-PGF-CTES-2023-24
2
19
source fonction
26 Nov 2023 0:55
Yael
L3-PGF-CTES-2023-24
2
30
longueur de la conclusion
26 Nov 2023 0:40
Yael
L3-PGF-CTES-2023-24
2
26
identifier les branches de l'arbre phylogénétique avec des lettres
17 Nov 2023 13:50
Yael
L3-PGF-CTES-2023-24
2
22
choix du nom scientifque à mettre dans la conclusion
12 Oct 2022 12:16
IMalki
L3-PGF-2022
1
19
Pour sars Cov 1
28 Sep 2022 14:18
LILYROSEPGF
L3-PGF-2022
1
19
J'ai trouvé des nouveaux génomes + génome privé
27 Sep 2022 17:48
P_Hingamp_PGF22
L3-PGF-2022
1
14
Paru hier : article "Origine du SARS-CoV-2 et du Covid-19 : le point sur l’enquête en cours et les dernières hypothèses"
26 Sep 2022 18:51
P_Hingamp_PGF22
L3-PGF-2022
1
11
Le virus qui venait du froid...
23 Sep 2022 10:38
hoda1
L3-PGF-2022
1
21
J'ai trouvé le génome complet de la souche BANAL-20-52/Laos/2020 identifiée par l'Institut Pasteur
22 Sep 2022 20:27
LILYROSEPGF
L3-PGF-2022
1
20
J'ai trouvé le génome complet de SARS-Cov1 (Souche Tor2)