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Thread subject: list de Domaines Protéiques, le façon de rejeter certaine domaine

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list de Domaines Protéiques, le façon de rejeter certaine domaine
chengbams
15 Apr 2024 9:18
Non evaluated contribution

je rejette le résultat de Gene3D, parce que il n'est pas intégré dans INTERPRO. je n'est pas sur que ce raison marche or pas?
merci beaucoup!
B_WIRTH_WUT_24
16 Apr 2024 12:54
Game master

Bonjour,

 

Oui, vous devez vous focaliser sur les résultats intégrés dans Interpro, donc les domaines avec un numéro d'accession IPRxxxxx.

Les domaines non intégrés dans Interpro ne seront pas analysés, et sont donc rejetés.

C'est bien le cas de votre domaine Gene3D.

 

On peut aussi rejeter un domaine dans le cas d'un souci de e-value : evalue absente (non calculée ou non renseignée), ou e-value trop élevée.

 

Bien cordialement,

Bénédicte WIRTH