Bonjour,

Si notre ORF se termine à la position 1039 alors que la longueur de la séquence génomique fait 1040 pb, on peut le considérer comme complet ou pas ?

Merci.

Bonjour, 

je me permet de vous répondre d'après ce que j'ai compris en TP, deux cas ce présentent : 

le premier est que le dernier codon de votre ORF est un codon stop (vous le voyez dans la traduction mentionné en étoile à la fin) dans ce cas il est complet.

dans le deuxième, le dernier codon de votre ORF n'es pas un stop (pas d'étoile dans la séquence d'acide aminés), on ne connait donc pas la totalité du codon (des 3 nucléotides) qu'il y'a après la fin de votre séquence (position 1039) et donc on ne sais pas s'il s'agit d'un codon stop ou non, donc votre ORF est très probablement incomplet de ce coté (puisqu'il y'a plus de chance par le hasard d'obtenir un codon codant un acide aminé qu'un codon stop)

Merci Ilyas.

Bonjour,

Très bonne réponse d'ilyas !

Je ne fais que confirmer la réponse.

Bon travail,

BW