Forum "Recherche d'ORF"

Sujet de discussion: correction

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correction
bioinfo
28 Mar 2008 21:38
Contribution non évaluée
Bonjour,
Je suis tombé sur un lot non codant parceque si je coche codant on m'affiche une
barre rouge ERROR, et quand je mes non codant ça se corrige (la barre rouge
disparait).je ne pouvait donc procéder par blast, alignement multiple avec
clustal, phylogénie...car on m'affiche par conséquent 0 aa.
Du coup, je l'ai soumis directement à correction pour voir comment procéder.
Je tiens à vous dire que je n'ai pas bien compris "on ne sait même pas basé
sur quoi?".Pourriez vous me donner s'il vous plait plus d'explication pour que
je puisse avancer dans mon travail.
Cordialement.
dans mon travail,
  

Brochier_B08
29 Mar 2008 9:47
Maître de jeu
Bonjour,
J'ai du mal à comprendre votre problème. J'essaye néanmoins quelques éléments de réponse
1/ Quel était le message associé à la barre rouge ? Normalement ce message doit vous mettre sur la voie et il concerne généralement des problèmes liés à la définition des codons start et stop.
2/ ORF non codant ne doit être coché que si il n'y a aucun ORF
3/ Postez un message sur le forum avant de soumettre votre lot à correction
Bon courage pour la fin
Céline Brochier


bioinfo
29 Mar 2008 16:28
Contribution: Pas assez limpide
J'ai un ORF qui contient un codon stop à l'interieur et il est incomplet aux
deux extrémités (3' et 5'). Comment définir la fin d'ORF?