Forum "Recherche d'ORF"

Thread subject: Poids moléculaire

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Poids moléculaire
chalia
17 Dec 2008 15:23
Contribution: Pertinent
Bonjour,
j'ai une question concernant le calcul du poids moléculaire. Mon ORF est complet je peux donc le calculer.Mais en faisant un blast x on s'est apercu d'une erreur de séquençage entrainant un Frame Shift.Cela change le fait que notre ORF soit complet? Si non ,pourquoi de pas donner le poids moléculaire?

Merci de votre réponse
Hingamp_BC08
17 Dec 2008 18:32
Game master
S'il y a un frame shift, c'est ou une erreur de séquençage (assez commun), ou une vraie mutation (il faudrait reséquencer plusieurs fois). Si c'est une mutation, alors le PM est celui de la protéine tronquée, si c'est une erreur, le PM devrait être finalement la somme des PM des deux parties "discontinues" de la protéine; ou alors comme c'est incertain, vous ne calculez pas le PM du tout... Faites votre choix, mais, comme toujours, justifiez-le.