Bonjour , en absence d'OFR dans le brin direct est ce qu'on peut garder la séquence si on trouve des OFR dans la séquence réverse ? et est ce que c'est normal que OFR finder me donne des OFR des la séquence réverse avec ceux de la séquence directe et inversement , cordialement 

Bonjour Amina,

Oui, vous pouvez garder la séquence, peu importe si l’ORF est sur le brin direct ou indirect.
Cette situation peut arriver, même si ce n’est pas très fréquent.

Bon travail,
Emese Meglecz

Je pense que j’ai mal compris votre 2e question:
Il est fréquent de trouver des ORF sur les deux brins, mais s’il y a un chevauchement entre des ORF, alors ou moins un de deux est un faux positif.
Il est plutôt rare de trouver des ORFs sur un seul brin, mais cela arrive aussi.

rebonjour , quand j'ai cherché OFR sur le brin direct j'ai eu cette phrase ( ORF number 1 in reading frame 2 on the reverse strand extends from base 1061 to base 1816.) cela veut dire que l'OFR est sur le brin inverse , non ? cordialement

rebonjour , quand j'ai cherché OFR sur le brin direct j'ai eu cette phrase ( ORF number 1 in reading frame 2 on the reverse strand extends from base 1061 to base 1816.) cela veut dire que l'OFR est sur le brin inverse , non ? cordialement

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le problème c'est que quand je choisis le brin direct j'aurai des résultats sur le brin inverse et vice versa est ce que c'est normal ??

Bonjour Amina,

Vous avez fait des erreurs de copier-coller ou il y a un problème de sélection des options.

En choisissant le brin direct dans le formulaire, on obtient que des ORFs sur ce brin.

Dans les résultats bruts sous le point a. Brin direct. Vous avez des ORF sur le brin reverse et vice versa. Cela me semble d’une erreur de copier-coller. Je viens de tester ORFinder qui fonctionne normalement.

Cordialement,
Emese Meglecz