On cherche ORF Finder sur internet. On copie la séquence inconnue sans changer les paramètres prédéfinis. On identifie une séquence d'intérêt et on l'analyse grâce au logiciel.
La séquence d'intérêt est ORF 2 de GOS_8710010.1 car elle
Description ORF :
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Label
ORF2
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Strand
-
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Frame
1
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Start
629
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Stop
>3
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Lenght (nt/aa)
627 | 208
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Seq nucléotides :
>lcl|ORF2 CDS
ATGAGTTTAAACTCTGGAGGCCATTTAACTCATGGAGCTAAACCTGCTCA
ATCGGGAAAATGGTTTAATGCTTTACACTATGAAGTTGATAAGAAAACAG
GTCTTATAGATTATGAAGGTGTAGAAAGACTTGCAATAGAAAATAAACCT
AAATTAATAATTGCTGGTGGCAGCGCATATTCAAGAATTATTGACTTTAA
AAAATTTAGACAAATATGTGATAAAGTGGGTGCATATCTGCTTGTAGATA
TGGCTCACTTTTCTGGTCTAGTTGCAGGTGGTGCTTATCCAAACCCAACT
AAATACGCTGATGTAGTTACTTCCACTACTCACAAAGTTTTGAGAGGACC
AAGAGGAGGAATAATTCTTACAAATAGAGAAGATTTAATAAAAAAATTTA
ATAGTGCTATATTCCCAGGGTTGCAAGGCGGACCTCTAATGCATGTAATA
GCTGCTAAAGCAGTCTGTTTTAAAGAAGCTCTTTCACCTGATTTTAAAGA
ATATACAAAAAATGTTATTCATAACGCTAAGATTCTATCAGACAGGTTAA
CTGAAAAAGGTTTAAAGATTTTTTCGGGAGGCACTGACACTCATCTAATG
TTAATTGATTTGAGATCATTAGGTGTA
Seq protéines :
>lcl|ORF2
MSLNSGGHLTHGAKPAQSGKWFNALHYEVDKKTGLIDYEGVERLAIENKP
KLIIAGGSAYSRIIDFKKFRQICDKVGAYLLVDMAHFSGLVAGGAYPNPT
KYADVVTSTTHKVLRGPRGGIILTNREDLIKKFNSAIFPGLQGGPLMHVI
AAKAVCFKEALSPDFKEYTKNVIHNAKILSDRLTEKGLKIFSGGTDTHLM
LIDLRSLGV