Bonjour Madame, j'ai un problème avec l'ORF indirect. D'après ce que j'ai compris, l'ORF1 débute à 1042 et se termine à 1233 et l'ORF2 débute à 1318 et se termine à 1533 ; cependant pour l'ORF3, la lecture se fait en indirect donc de 327 à 1 et l'ORF4 de 891 à 328. Est-ce juste une erreur dans l'affichage du résultat qui me l'indique de 1 à 327 pour l'ORF3 et de 328 à 891 pour l'ORF4 ou est-ce qu'il faut vraiment le lire dans ce sens ? Merci pour votre éclairage.

HOUDJEDJE Djaber

Bonjour Djaber,

Quand vous faites l’ORF Finder dans SMS sur le brin reverse, le logiciel prend le reverse complémentaire de brin direct et cherche ORF dedans. En prenant le reverse complémentaire, la numérotation est inversée. Le nucléotide 1877 devient le 1. Dans votre schéma, vous avez affiché correctement les positions pour les ORF 3 et 4, mais modifiez le sens de la lecture. La lecture d’une séquence d’ADN se fait toujours dans le sens 5’ => 3’. Sur votre schéma, 5’ => 3’ est de gauche vers la droite pour le brin direct, et de droite vers la gauche sur le brin reverse.

Bon travail,
Emese Meglecz

Merci pour votre explication Madame