Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: arbre mal raciné

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arbre mal raciné
clem_va
14 Dec 2009 15:13
Contribution non évaluée
Après la 1ère correction on nous a dis que notre arbre était mal raciné et que l'on devait le raciner a partir du noeud A.
Nous ne savons absolument pas comment faire pour raciner notre arbre différemment.
pourriez vous nous éclairer s'il vous plait?

  +---------------------Alphapro4_Silicibacter/Alphaproteobacteria/ref_ZP_05739023.1_gi
     |
+---+           +----Alphapro11_Hyphomicrobium/Alphaproteobacteria/ref_ZP_05375339.1
|   |           |
|   |           |     +-----Betaprot1_Leptothrix_cholodnii_SP-6/Betaproteobacteria/ref_YP_00
|   +-----------+     |
|               |     |          +---Alphapro3_Sagittula_stellata_E-37/Alphaproteobacteria/ref_ZP_017
|               +-----+          |
|                     |     +----+
|                     |     |    +---Alphapro8_Roseovarius_sp._HTCC2601/Alphaproteobacteria/ref_ZP_01
|                     +-----+
|                           |+--------Alphapro9_Silicibacter_pomeroyi_DSS-3/Alphaproteobacteria/ref_YP
|                           ++
|                            +------Alphapro5_Sinorhizobium_meliloti_1021/Alphaproteobacteria/ref_NP
|
|                            +-GOS_1107030_Traduction_18-1004_sens_indirect
|                         +--+
|                         |  +--Alphapro13_Rhodobacterales/Alphaproteobacteria/ref_ZP_01447853.1
|                        ++
|                        |+--Alphapro2_Rhodobacterales_bacterium_HTCC2150/Alphaproteobacteria
|   +--------------------+
|   |                    |
|   |                    +-Alphapro1_Rhodobacterales_bacterium_HTCC2083/Alphaproteobacteria
|   |
|   |    +-----------------Alphapro7_Asticcacaulis/Alphaproteobacteria/ref_ZP_04770208.1_gi
|   |    |
+---+  +-+  +-------------------Gammapro2_Yersinia_pseudotuberculosis_IP_31758/Gammaproteobacter
     |  | |  |
     |  | +--+    +--------------------Alphapro6_Bradyrhizobium_sp._BTAi1/Alphaproteobacteria/ref_YP_00
     |  |    +----+
     |  |         +-------------------------------------Alphapro12_Sphingomonas_wittichii_RW1/Alphaproteobacteria/ref_YP
     |  |
     +--+      +---------------------------Gammapro1_Psychromonas_ingrahamii_37/Gammaproteobacteria/ref_YP
        |      |
        |  +---+
        |  |   | +---------Betaprot2_Dechloromonas_aromatica_RCB/Betaproteobacteria/ref_YP
        |  |   +-+
        |  |     |   +----Alphapro10_Magnetospirillum_gryphiswaldense_MSR-1/Alphaproteobac
        +--A     +---+
           |         +------Gammapro3_Acidithiobacillus_ferrooxidans_ATCC_23270/Gammaproteob
           |
           +------------Betaprot3_Methylotenera/Betaproteobacteria/ref_YP_003049202.1_gi
ETalla09
14 Dec 2009 15:45
Maître de jeu
Bonjour,

Le re-enracinement de votre arbre se fait sous phylogeny.fr, etape 6 (Tree rendering) de votre analyse phylogenetique..., puis cliquez sur le boton reroot, puis sur la branche qui servira de nouvelle racine, pour avoir le nouvel arbre...

ET