Forum: Analyse phylogénétique

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Messages Readers Subject
16 Apr 2017 18:39 ClaraSophie Bioch2017
2
12 séquences eucaryotes
29 Mar 2017 9:23 Vincent-Marine Bioch2017
2
10 Re enracinement de l'arbre (issus de la matrice de distance)
23 Feb 2017 10:56 Vincent-Marine Bioch2017
6
48 Re enracinement de l'arbre (issus de la matrice de distance)
7 Nov 2016 15:26 SBDA BioCell2016
2
36 AU SECOURS, URGENT!
31 Oct 2016 10:54 voyagel3 BioCell2016
2
22 Hypothèse des événements évolutifs d'une espèce: DA ou HTG?
4 Oct 2016 18:06 P_Hingamp_BC16 BioCell2016
1
26 Si vous observez des arbres "tous mélangés"...
29 Sep 2016 14:58 zbrrrrra BioCell2016
2
37 détermination du groupe d'étude et extérieur
24 Sep 2016 16:38 Nico-Sosso BioCell2016
2
47 Choix du groupe extérieur
16 Dec 2015 0:17 Pilgrim BioCell2015
3
28 Conclusion sur la provenance de notre ORF
2 May 2015 18:50 FranckLea Bioch2015
2
18 Topologie de l'arbre
24 Apr 2015 14:06 FranckLea Bioch2015
5
57 Groupe d'étude et groupe extérieur
12 Apr 2015 14:28 Tcyr_Ab AMIG2016
3
42 Phylogeny.fr HS
29 Mar 2015 11:22 IrigarayA Bioch2015
2
20 Etiquettes arbre
24 Mar 2015 9:53 Charjay AMIG2016
2
31 Distinction d'un groupe extérieur
17 Dec 2014 14:57 Ali_Attaf BioCell2014
4
40 Sous-groupes
17 Dec 2014 11:13 Ali_Attaf BioCell2014
3
29 Question correction Madame WIRTH
15 Dec 2014 11:41 adrianna BioCell2014
4
31 Choix groupe externe
9 Dec 2014 16:30 Ali_Attaf BioCell2014
2
18 Arbre noeuds profonds mal soutenus
9 Dec 2014 10:38 ELPO BioCell2014
2
14 Contradiction dans la correction
21 Nov 2014 17:08 LB-MN BioCell2014
10
152 nouvel arbre séquence 1
6 Nov 2014 10:54 Ali_Attaf BioCell2014
4
28 noeuds mal supportés
6 Nov 2014 8:26 ELPO BioCell2014
2
25 Choix du groupe d'étude et groupe externe
5 Nov 2014 20:02 BG-L3BC BioCell2014
3
31 Détermination du groupe d'étude
5 Nov 2014 17:39 LB-MN BioCell2014
2
34 Arbre BioNJ
4 Nov 2014 16:06 giaccherini BioCell2014
6
55 problème racinement arbre
4 Nov 2014 15:12 Ali_Attaf BioCell2014
7
89 groupe exterieur et groupe interieur
4 Nov 2014 13:47 Minions BioCell2014
2
22 Groupes extérieur et d'étude mal séparés
4 Nov 2014 12:52 LB-MN BioCell2014
14
172 arbre phyMl
3 Nov 2014 14:54 caiane BioCell2014
2
22 Différentes fonctions dans TAX REPORT
3 Nov 2014 9:37 axelleleif BioCell2014
2
27 groupe étude/ groupe exterieur
31 Oct 2014 14:35 LB-MN BioCell2014
2
21 Choix du groupe d'étude et externe
28 Oct 2014 8:32 bordigoniducrot BioCell2014
2
36 Choix groupe d'étude et groupe extérieur
23 Oct 2014 18:35 louiselisa BioCell2014
2
30 choix des groupes et enracinement de l'arbre
10 Oct 2014 0:05 giaccherini BioCell2014
2
28 ORF groupe d'étude/groupe extérieur
8 Oct 2014 19:47 genouxcagneux BioCell2014
2
23 Notre ORF se retrouve dans le groupe exterieur
8 Oct 2014 11:44 Minions BioCell2014
2
36 Groupe d'étude et groupe extérieur
5 Oct 2014 9:59 Ali_Attaf BioCell2014
4
112 Groupe extérieur
22 Mar 2014 16:27 Tythan AMIG2016
2
56 Question groupe d'étude et groupe externe
18 May 2012 20:09 MERROUCH Biochimie 2012
3
36 arbre non raciné
6 May 2012 13:18 nanais AMIG
2
16 Difficulté d'interprétation de notre arbre: groupe d'étude scindé en deux.
30 Apr 2012 12:08 Stellathan Biochimie 2012
2
19 Erreur de tree rendering
29 Apr 2012 18:26 nanais AMIG
10
113 Problème reconstruction TreeDyn
27 Apr 2012 17:50 lopez_falce AMIG
2
15 un seul groupe de bactéries
25 Apr 2012 12:08 Gp1_HUGONI Biochimie 2012
5
70 Besoin d'aide
23 Apr 2012 18:22 alcam AMIG
2
20 Difficultés d'analyse de l'arbre phylogénétique
24 Mar 2012 16:49 jash AMIG
2
22 Pas d'alignements satisfaisants pour construire l'arbre phylogénétique
23 Mar 2012 13:28 az-com AMIG
3
54 analyse de notre arbre phylogénétique
18 Mar 2012 19:56 DRAMALOVE Biochimie 2012
1
14 Congruence
18 Mar 2012 10:52 Omb_Cla AMIG
2
8 Choix du groupe d'étude et des groupes extérieurs
17 Mar 2012 22:30 nanais AMIG
2
12 Archées dans l'étude taxonomique et éventuel biais.
15 Mar 2012 16:51 nanais AMIG
2
10 Serveur phylogeny momentanément indisponible
15 Mar 2012 13:06 camardi AMIG
2
12 Choix de sequences pour taxonomie
13 Mar 2012 14:15 nanais AMIG
2
16 Archaea versus bacteria
13 Mar 2012 10:34 clemshe Biochimie 2012
1
12 provenance d'un homologue
7 Mar 2012 11:55 SoMe Biochimie 2012
1
14 arbre
27 Feb 2012 21:33 CAE Biochimie 2012
4
85 Arbre phylogénétique
27 Feb 2012 20:19 quentlude Biochimie 2012
11
396 Arbres phylogénétiques
23 Feb 2012 22:27 quentlude Biochimie 2012
5
79 Curation (GOS_2883010.51)
12 Dec 2011 17:47 cerises BioCell2011
6
121 problème
8 Dec 2011 11:51 rovivi BioCell2011
2
72 Soucis lineage report
27 Oct 2011 11:44 Alirion BioCell2011
3
153 problème outil id2fasta
7 May 2011 1:28 reneejenni Biochimie 2011
2
5 Définir le plus proche parent de mon ORF
7 Apr 2011 10:43 matir Biochimie 2011
1
9 Construire l'arbre phylogénique !
6 Apr 2011 19:51 matir Biochimie 2011
3
22 Construire un arbre !
17 Mar 2011 18:30 gp2PESENTI Biochimie 2011
2
16 Unknown task status! (error)
3 Mar 2011 10:41 reneejenni Biochimie 2011
2
32 choix de groupe d'étude lorsqu'on a des séquences homologues métagénomiques
2 Mar 2011 14:13 MARFE Biochimie 2011
5
100 Surprise lors de l'arbre phylogénétique
1 Mar 2011 8:30 reneeonana Biochimie 2011
8
78 choix de groupe d'étude
22 Feb 2011 14:12 BrothTeam Biochimie 2011
2
36 Phylogénie de référence sur NCBI
17 Feb 2011 23:02 samiahafsoi Biochimie 2011
6
143 Arbre phylogénétique
17 Feb 2011 16:17 omarissem Biochimie 2011
2
41 groupe exrerieur
17 Feb 2011 16:02 samiahafsoi Biochimie 2011
4
88 arbre phylogenetique
15 Feb 2011 8:48 BrothTeam Biochimie 2011
2
43 Tree Rendering
14 Feb 2011 11:38 BrothTeam Biochimie 2011
7
231 Choix des groupes
14 Feb 2011 1:02 BrothTeam Biochimie 2011
2
48 Détail des étapes?
17 Dec 2010 9:58 FannyFlo BioCell2010
2
32 Scores homologues du groupe extérieur
12 Dec 2010 15:35 AG-GC BioCell2010
3
79 Congruence des arbres
11 Dec 2010 17:53 FannyFlo BioCell2010
4
114 Arbre - relations de parentés
10 Dec 2010 12:14 chlolulu BioCell2010
2
51 arbre
10 Dec 2010 11:06 Setis BioCell2010
2
50 Groupe D'étude
27 Apr 2010 21:57 marineoral Biochimie 2010
4
36 interprétation des arbres
26 Apr 2010 16:46 eloow Biochimie 2010
2
21 Problème avec Phylogeny.fr
24 Apr 2010 17:27 Orallea Biochimie 2010
2
24 Recherche groupe d\'étude groupe extérieur
24 Apr 2010 14:59 luminien Biochimie 2010
2
19 interprétation de l'arbre
20 Apr 2010 22:20 luminien Biochimie 2010
4
56 étude des arbres
19 Apr 2010 19:31 oralma Biochimie 2010
2
26 arbres non conformes à la phylogénie de référence, difficiles à interpreter
14 Apr 2010 17:09 oralblandine Biochimie 2010
2
24 problème interprétation arbres
12 Apr 2010 21:28 oralbre Biochimie 2010
2
21 4homologues
8 Apr 2010 16:09 ameliane Biochimie 2010
6
139 Problème dans l'interprétation de l'arbre obtenu
8 Apr 2010 15:31 oralblandine Biochimie 2010
2
31 interprétation de mes arbres
8 Apr 2010 0:27 ameliane Biochimie 2010
3
39 Divergence entre phylogénie établie et arbre obtenu par phylogeny.fr
24 Mar 2010 15:28 MSdu83 Biochimie 2010
3
93 Analyse phylogénétique
5 Mar 2010 16:56 leaman Biochimie 2010
3
114 format
14 Dec 2009 15:13 clem_va BioCell2009
2
28 arbre mal raciné
12 Dec 2009 22:56 farahetsalah BioCell2009
1
12 arbre
12 Dec 2009 22:44 farahetsalah BioCell2009
2
20 arbre phylogénétique
11 Dec 2009 15:04 sonia2hayiri BioCell2009
4
72 problème d'interprétation d'arbre phylogénétique
11 Dec 2009 13:22 sonia2hayiri BioCell2009
1
9 Mélange des 2 groupes
9 Dec 2009 15:39 farahetsalah BioCell2009
2
22 arbre phylogenetique
7 Dec 2009 16:39 farahetsalah BioCell2009
1
13 Despoir pour obtenir l'arbre phylogénétique
3 Dec 2009 18:53 ma-cha BioCell2009
1
16 arbre en désordre
29 Nov 2009 13:32 famar BioCell2009
4
56 incohérence de l'alignement multiple et de l'arbre.
27 Nov 2009 7:23 NAME BioCell2009
1
11 Proteo groupe d'etude et autre bacteries exterieur
26 Nov 2009 15:58 NAME BioCell2009
3
42 Mélange du groupe d'étude et du groupe extérieur
23 Nov 2009 15:01 fabisa BioCell2009
2
27 Mélange des 2 groupes
15 May 2009 17:15 lbfm Biochimie 2009
2
7 choiw groupe étude et extérieur
9 May 2009 19:47 louss_riquet Biochimie 2009
2
13 bootstrap
26 Apr 2009 21:34 sweet Biochimie 2009
1
14 groupe extérieur
26 Apr 2009 19:01 sweet Biochimie 2009
2
23 groupe extérieur et d\'étude
21 Apr 2009 16:18 Adrien2 Biochimie 2009
2
31 Problème d'analyse d'arbre
15 Apr 2009 16:30 CALAMARS Biochimie 2009
2
28 ARBRE
7 Apr 2009 16:59 CALAMARS Biochimie 2009
2
33 identification des classe des organismes
3 Apr 2009 16:23 saidaloui Biochimie 2009
1
20 comment faire l'arbre?
19 Dec 2008 14:17 dama BioCell2008
6
100 Problème interprétation arbre
18 Dec 2008 16:44 Emiso BioCell2008
4
62 Choix du groupe extérieur
17 Dec 2008 23:01 meline BioCell2008
2
26 choix du groupe d'étude
17 Dec 2008 20:21 marmoh BioCell2008
5
59 séquence environnementale marginale ?
17 Dec 2008 17:23 dama BioCell2008
4
55 Problème groupe extérieur
17 Dec 2008 16:01 casan BioCell2008
4
39 Arbres Intermédiaires
16 Dec 2008 19:08 Walidassiba BioCell2008
3
40 Arbre bazar!
16 Dec 2008 17:40 teamide BioCell2008
3
43 problème sur phylogeny.fr
15 Dec 2008 18:14 opale BioCell2008
8
95 difficulté à interpréter
14 Dec 2008 21:31 ci_co BioCell2008
3
45 Pour Mme Brochier
14 Dec 2008 17:51 magorne BioCell2008
2
22 arbre
14 Dec 2008 16:20 dama BioCell2008
2
18 Arbre
14 Dec 2008 10:30 Lilou BioCell2008
2
30 Correction 2, à l'attention de Mme Brochier
12 Dec 2008 10:56 ci_co BioCell2008
2
28 arbres tous différents !
12 Dec 2008 10:44 ci_co BioCell2008
1
9 arbres tous différents !
7 Dec 2008 22:24 Walidassiba BioCell2008
2
24 Groupe exterieur?
6 Dec 2008 12:19 magorne BioCell2008
20
334 groupe extérieur
5 Dec 2008 15:55 Hingamp_BC08 BioCell2008
4
61 Explorer des arbres très rapidement
5 Dec 2008 13:00 eniyro BioCell2008
5
57 les protéines universelles = la galère
4 Dec 2008 22:19 teamide BioCell2008
2
25 problème d'interprétation
3 Dec 2008 17:03 Dj-neiluj BioCell2008
1
17 Définition du groupe d'étude et du groupe extérieur
3 Dec 2008 15:20 Lilou BioCell2008
8
111 Conversion Newick/NH -> arbre en texte
29 Nov 2008 15:41 magorne BioCell2008
2
34 groupe exterieur
25 Nov 2008 18:24 mamagaga BioCell2008
2
40 problème d'arbre
23 Nov 2008 13:30 magorne BioCell2008
2
43 recherche de GE et Gext
22 Nov 2008 17:54 bioinfodj BioCell2008
2
44 probleme arbre phylogenetique
20 Nov 2008 15:06 marmoh BioCell2008
3
65 reSOS
20 Nov 2008 14:01 marmoh BioCell2008
2
55 SOS
17 Apr 2008 9:05 BNPA Biochimie 2008
2
20 arbre
15 Apr 2008 14:24 bloublou Biochimie 2008
3
37 problème d'interprétation
11 Apr 2008 2:26 noura Biochimie 2008
2
23 Arbre non raciné
2 Dec 2007 19:44 TAMT BioCell 2007
2
34 Uncultured marine bacteria???
2 Dec 2007 13:09 AlbatarMazmaz BioCell 2007
2
38 Choix des homologues.
1 Dec 2007 20:48 luluemmy BioCell 2007
4
84 arbres Protpars différents de l'arbre NJ
1 Dec 2007 13:33 AlbatarMazmaz BioCell 2007
2
41 Sémentique d'un mot.
1 Dec 2007 11:18 luluemmy BioCell 2007
2
44 alignement multiple et arbre
30 Nov 2007 20:28 mavio BioCell 2007
2
33 groupe externe
29 Nov 2007 20:21 milou BioCell 2007
2
41 groupe exterieur
29 Nov 2007 12:43 milou BioCell 2007
3
62 groupe exterieur
27 Nov 2007 16:20 laurelimate BioCell 2007
2
42 Correction et groupe extérieur
27 Nov 2007 15:17 luluemmy BioCell 2007
2
46 Groupe extérieur
25 Nov 2007 14:17 mavio BioCell 2007
2
46 Groupe exterieur ou pas?
20 Nov 2007 16:59 TAMT BioCell 2007
4
108 Pitite question au sujet des arbres...
13 Nov 2007 18:59 Brochier_BC07 BioCell 2007
1
32 Sites web utiles pour la taxonomie
13 Nov 2007 18:33 josh BioCell 2007
2
56 Definir le groupe extérieur
13 Nov 2007 17:49 milou BioCell 2007
4
123 choix des groupes d'etudes et exterieurs
13 Nov 2007 9:04 cqfpf BioCell 2007
2
33 Plus de proximité avec le groupe extérieur.
9 Nov 2007 20:04 Brochier_BC07 BioCell 2007
1
25 Analyse phylogénétique des séquences obtenues à partir de la banque environnementale
13 Apr 2007 15:10 aurore Biochimie 2007
2
29 determination orthologue/paralogue
13 Apr 2007 8:20 giraudaguerre Biochimie 2007
2
25 Arbres
12 Apr 2007 17:15 madixu Biochimie 2007
2
22 CHOIX DU GROUPE D'ETUDE
12 Apr 2007 11:03 giraudaguerre Biochimie 2007
2
26 problémes concernant l'analyse des arbres
11 Apr 2007 13:31 aurore Biochimie 2007
2
34 determination orthologues paralogues (bis)
10 Apr 2007 14:19 asergean Biochimie 2007
4
52 groupe d'étude
9 Apr 2007 15:54 aurore Biochimie 2007
2
39 PROBLEMES POUR CHOISIR LES ORTHOLOGUES ET LES PARALOGUES
24 Mar 2007 20:57 vleonet1 Biochimie 2007
3
53 problème d'arbre
24 Mar 2007 0:06 vleonet1 Biochimie 2007
2
32 Groupe d'étude / Groupe extérieur
23 Mar 2007 13:59 tyler Biochimie 2007
2
48 détermination des paralogues/orthologues/xénologues
23 Mar 2007 11:06 madixu Biochimie 2007
8
130 Choix du groupe extérieur
23 Mar 2007 10:17 mtadjdet Biochimie 2007
2
35 groupe d'étude et groupe exterieur (cas d'un arbre raciné!)
21 Mar 2007 12:55 stefcec Biochimie 2007
2
31 Toutes les séquences homologues proviennent d'organismes inconnus (séquences métagénomiques)
21 Mar 2007 12:00 aurore Biochimie 2007
2
32 Quelle séquence correspondant à notre ORF doit-on inclure dans l'arbre?
16 Mar 2007 17:41 Hingamp_B07 Biochimie 2007
1
24 Nouveautés pour l'alignement multiple et la phylogénie (www.phylogeny.fr)