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Forum: Analyse phylogénétique
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Subject
27 Nov 2020 16:14
EmOmFa
PGF-2020
2
20
Abre phylogénétique
21 Nov 2020 13:20
ChaDev
Master-Mer-2020
2
10
Séquences métagénomiques
21 Nov 2020 10:59
ChaDev
Master-Mer-2020
1
5
Rapport taxonomique
21 Nov 2020 10:11
ChaDev
Master-Mer-2020
2
9
Rapport taxonomique
10 Nov 2020 22:40
PHingampMM20
Master-Mer-2020
2
12
Arbres BioNJ
2 Oct 2020 11:11
ChaDev
Master-Mer-2020
3
27
Perte séquences pour aligment + arbre
27 Apr 2020 11:53
eleonore
L3-PGF-CTES-2019
2
14
bootstrap
22 Apr 2020 2:01
CandiceC
L3-PGF-CTES-2019
5
55
Positionnement de l'ORF dans l'arbre
21 Mar 2020 16:26
YasmineMyriam
Bioch2020
2
38
Arbre phylogénétique
18 Mar 2020 19:44
SSA
Bioch2020
2
52
construction des arbres
18 Mar 2020 11:52
Yassine
Bioch2020
2
50
Séparation des deux groupes d'étude et externe
17 Mar 2020 18:37
ouno
Bioch2020
7
150
Arbre phylogénique
20 Sep 2019 16:15
PHingampMM19
Master-Sciences-Mer
1
9
Image de l'arbre "Zarbi" de la séquence OMRGCv2_8442080
26 May 2019 16:27
SARAH
L3-PGF-CTES-2018
1
11
RACINE et noeud
24 May 2019 15:08
SARAH
L3-PGF-CTES-2018
4
53
probleme racine
28 Apr 2019 18:41
sheina
L3-PGF-CTES-2018
4
36
Format du texte pour l'arbre
26 Apr 2019 15:04
SARFEL
Bioch2019
4
52
Arbe phylogénique
25 Apr 2019 10:26
Audelia
L3-PGF-CTES-2018
2
22
Choix du groupe d'étude
15 Apr 2019 17:26
DJABER-HOU
L3-PGF-CTES-2018
2
24
les séquences de groupe extérieure dans l'arbre phylogénique
12 Apr 2019 20:37
KareneFunaro
L3-PGF-CTES-2018
6
109
Arbre
12 Apr 2019 19:25
HarryTuttle
L3-PGF-CTES-2018
5
83
Arbre 2: même type de problème que JulieP dans "Arbre"?
12 Apr 2019 17:03
chloegouyet
L3-PGF-CTES-2018
4
59
enracinement
12 Apr 2019 14:17
chloegouyet
L3-PGF-CTES-2018
2
28
choix du groupe externe
10 Apr 2019 17:37
Leacauchois18
L3-PGF-CTES-2018
4
56
Problème d'enracinement.
8 Apr 2019 12:43
LAETITIA
L3-PGF-CTES-2018
3
62
sous-groupe Gammaproteobacteria
7 Apr 2019 20:39
FIO19
L3-PGF-CTES-2018
4
89
Enracinement de l'arbre
4 Apr 2019 9:52
JulieP
L3-PGF-CTES-2018
8
122
Arbre
3 Apr 2019 19:31
LAETITIA
L3-PGF-CTES-2018
3
48
Flavobacteriia bizarrement enraciné
29 Mar 2019 2:19
lea
L3-PGF-CTES-2018
4
64
Choix groupe d'étude et groupe extérieur
24 Mar 2019 17:39
isis
L3-PGF-CTES-2018
5
73
Arbre
20 Mar 2019 19:31
Lucien
L3-PGF-CTES-2018
13
290
Rédaction
15 Mar 2019 14:56
Krystel
L3-PGF-CTES-2018
5
55
Information recherche erreur NCBI
13 Mar 2019 21:26
P-AL
L3-PGF-CTES-2018
17
400
Arbre phylogénique pas vraiment distinctif
9 Mar 2019 0:03
Krystel
L3-PGF-CTES-2018
5
65
Choix difficile du groupe d'étude-ordre incertain avec e-value égale au groupe d'étude
1 Mar 2019 17:32
zineddhu
Bioch2019
2
71
Exploitation de l'arbre phylogénétique
25 Feb 2019 11:45
TOMADEO
L3-PGF-CTES-2018
3
53
E valeur = 0
15 Nov 2018 19:49
CPeger13
PGF-2018
4
92
Arbre BioNJ
11 May 2018 19:21
MissDia95
Bioch2018
1
3
TaxReports/ Analyse des résutats/ table 5
9 May 2018 16:42
Rosonp
Bioch2018
2
13
Arbre phylogénétique
29 Apr 2018 14:18
Rosonp
Bioch2018
2
5
Taxreport
25 Apr 2018 16:48
LBMH
Bioch2018
3
48
Groupe extérieur
2 Apr 2018 16:25
GRP1_GESTIN
BISM2018
3
54
Taxons et groupes intérieurs/extérieurs
16 Apr 2017 18:39
ClaraSophie
Bioch2017
2
18
séquences eucaryotes
29 Mar 2017 9:23
Vincent-Marine
Bioch2017
2
27
Re enracinement de l'arbre (issus de la matrice de distance)
23 Feb 2017 10:56
Vincent-Marine
Bioch2017
6
72
Re enracinement de l'arbre (issus de la matrice de distance)
7 Nov 2016 15:26
SBDA
BioCell2016
2
46
AU SECOURS, URGENT!
31 Oct 2016 10:54
voyagel3
BioCell2016
2
38
Hypothèse des événements évolutifs d'une espèce: DA ou HTG?
4 Oct 2016 18:06
P_Hingamp_BC16
BioCell2016
1
31
Si vous observez des arbres "tous mélangés"...
29 Sep 2016 14:58
zbrrrrra
BioCell2016
2
55
détermination du groupe d'étude et extérieur
24 Sep 2016 16:38
Nico-Sosso
BioCell2016
2
63
Choix du groupe extérieur
16 Dec 2015 0:17
Pilgrim
BioCell2015
3
37
Conclusion sur la provenance de notre ORF
2 May 2015 18:50
FranckLea
Bioch2015
2
24
Topologie de l'arbre
24 Apr 2015 14:06
FranckLea
Bioch2015
5
57
Groupe d'étude et groupe extérieur
12 Apr 2015 14:28
Tcyr_Ab
AMIG2016
3
45
Phylogeny.fr HS
29 Mar 2015 11:22
IrigarayA
Bioch2015
2
20
Etiquettes arbre
24 Mar 2015 9:53
Charjay
AMIG2016
2
33
Distinction d'un groupe extérieur
17 Dec 2014 14:57
Ali_Attaf
BioCell2014
4
44
Sous-groupes
17 Dec 2014 11:13
Ali_Attaf
BioCell2014
3
29
Question correction Madame WIRTH
15 Dec 2014 11:41
adrianna
BioCell2014
4
35
Choix groupe externe
9 Dec 2014 16:30
Ali_Attaf
BioCell2014
2
18
Arbre noeuds profonds mal soutenus
9 Dec 2014 10:38
ELPO
BioCell2014
2
16
Contradiction dans la correction
21 Nov 2014 17:08
LB-MN
BioCell2014
10
213
nouvel arbre séquence 1
6 Nov 2014 10:54
Ali_Attaf
BioCell2014
4
28
noeuds mal supportés
6 Nov 2014 8:26
ELPO
BioCell2014
2
28
Choix du groupe d'étude et groupe externe
5 Nov 2014 20:02
BG-L3BC
BioCell2014
3
35
Détermination du groupe d'étude
5 Nov 2014 17:39
LB-MN
BioCell2014
2
36
Arbre BioNJ
4 Nov 2014 16:06
giaccherini
BioCell2014
6
55
problème racinement arbre
4 Nov 2014 15:12
Ali_Attaf
BioCell2014
7
104
groupe exterieur et groupe interieur
4 Nov 2014 13:47
Minions
BioCell2014
2
30
Groupes extérieur et d'étude mal séparés
4 Nov 2014 12:52
LB-MN
BioCell2014
14
242
arbre phyMl
3 Nov 2014 14:54
caiane
BioCell2014
2
28
Différentes fonctions dans TAX REPORT
3 Nov 2014 9:37
axelleleif
BioCell2014
2
29
groupe étude/ groupe exterieur
31 Oct 2014 14:35
LB-MN
BioCell2014
2
24
Choix du groupe d'étude et externe
28 Oct 2014 8:32
bordigoniducrot
BioCell2014
2
42
Choix groupe d'étude et groupe extérieur
23 Oct 2014 18:35
louiselisa
BioCell2014
2
34
choix des groupes et enracinement de l'arbre
10 Oct 2014 0:05
giaccherini
BioCell2014
2
28
ORF groupe d'étude/groupe extérieur
8 Oct 2014 19:47
genouxcagneux
BioCell2014
2
31
Notre ORF se retrouve dans le groupe exterieur
8 Oct 2014 11:44
Minions
BioCell2014
2
53
Groupe d'étude et groupe extérieur
5 Oct 2014 9:59
Ali_Attaf
BioCell2014
4
129
Groupe extérieur
22 Mar 2014 16:27
Tythan
AMIG2016
2
56
Question groupe d'étude et groupe externe
18 May 2012 20:09
MERROUCH
Biochimie 2012
3
36
arbre non raciné
6 May 2012 13:18
nanais
AMIG
2
16
Difficulté d'interprétation de notre arbre: groupe d'étude scindé en deux.
30 Apr 2012 12:08
Stellathan
Biochimie 2012
2
19
Erreur de tree rendering
29 Apr 2012 18:26
nanais
AMIG
10
143
Problème reconstruction TreeDyn
27 Apr 2012 17:50
lopez_falce
AMIG
2
15
un seul groupe de bactéries
25 Apr 2012 12:08
Gp1_HUGONI
Biochimie 2012
5
75
Besoin d'aide
23 Apr 2012 18:22
alcam
AMIG
2
26
Difficultés d'analyse de l'arbre phylogénétique
24 Mar 2012 16:49
jash
AMIG
2
22
Pas d'alignements satisfaisants pour construire l'arbre phylogénétique
23 Mar 2012 13:28
az-com
AMIG
3
90
analyse de notre arbre phylogénétique
18 Mar 2012 19:56
DRAMALOVE
Biochimie 2012
1
14
Congruence
18 Mar 2012 10:52
Omb_Cla
AMIG
2
10
Choix du groupe d'étude et des groupes extérieurs
17 Mar 2012 22:30
nanais
AMIG
2
14
Archées dans l'étude taxonomique et éventuel biais.
15 Mar 2012 16:51
nanais
AMIG
2
10
Serveur phylogeny momentanément indisponible
15 Mar 2012 13:06
camardi
AMIG
2
12
Choix de sequences pour taxonomie
13 Mar 2012 14:15
nanais
AMIG
2
16
Archaea versus bacteria
13 Mar 2012 10:34
clemshe
Biochimie 2012
1
12
provenance d'un homologue
7 Mar 2012 11:55
SoMe
Biochimie 2012
1
14
arbre
27 Feb 2012 21:33
CAE
Biochimie 2012
4
101
Arbre phylogénétique
27 Feb 2012 20:19
quentlude
Biochimie 2012
11
451
Arbres phylogénétiques
23 Feb 2012 22:27
quentlude
Biochimie 2012
5
134
Curation (GOS_2883010.51)
12 Dec 2011 17:47
cerises
BioCell2011
6
139
problème
8 Dec 2011 11:51
rovivi
BioCell2011
2
74
Soucis lineage report
27 Oct 2011 11:44
Alirion
BioCell2011
3
153
problème outil id2fasta
7 May 2011 1:28
reneejenni
Biochimie 2011
2
5
Définir le plus proche parent de mon ORF
7 Apr 2011 10:43
matir
Biochimie 2011
1
9
Construire l'arbre phylogénique !
6 Apr 2011 19:51
matir
Biochimie 2011
3
22
Construire un arbre !
17 Mar 2011 18:30
gp2PESENTI
Biochimie 2011
2
16
Unknown task status! (error)
3 Mar 2011 10:41
reneejenni
Biochimie 2011
2
32
choix de groupe d'étude lorsqu'on a des séquences homologues métagénomiques
2 Mar 2011 14:13
MARFE
Biochimie 2011
5
125
Surprise lors de l'arbre phylogénétique
1 Mar 2011 8:30
reneeonana
Biochimie 2011
8
134
choix de groupe d'étude
22 Feb 2011 14:12
BrothTeam
Biochimie 2011
2
36
Phylogénie de référence sur NCBI
17 Feb 2011 23:02
samiahafsoi
Biochimie 2011
6
161
Arbre phylogénétique
17 Feb 2011 16:17
omarissem
Biochimie 2011
2
43
groupe exrerieur
17 Feb 2011 16:02
samiahafsoi
Biochimie 2011
4
96
arbre phylogenetique
15 Feb 2011 8:48
BrothTeam
Biochimie 2011
2
43
Tree Rendering
14 Feb 2011 11:38
BrothTeam
Biochimie 2011
7
238
Choix des groupes
14 Feb 2011 1:02
BrothTeam
Biochimie 2011
2
48
Détail des étapes?
17 Dec 2010 9:58
FannyFlo
BioCell2010
2
33
Scores homologues du groupe extérieur
12 Dec 2010 15:35
AG-GC
BioCell2010
3
82
Congruence des arbres
11 Dec 2010 17:53
FannyFlo
BioCell2010
4
126
Arbre - relations de parentés
10 Dec 2010 12:14
chlolulu
BioCell2010
2
51
arbre
10 Dec 2010 11:06
Setis
BioCell2010
2
52
Groupe D'étude
27 Apr 2010 21:57
marineoral
Biochimie 2010
4
36
interprétation des arbres
26 Apr 2010 16:46
eloow
Biochimie 2010
2
21
Problème avec Phylogeny.fr
24 Apr 2010 17:27
Orallea
Biochimie 2010
2
24
Recherche groupe d\'étude groupe extérieur
24 Apr 2010 14:59
luminien
Biochimie 2010
2
19
interprétation de l'arbre
20 Apr 2010 22:20
luminien
Biochimie 2010
4
68
étude des arbres
19 Apr 2010 19:31
oralma
Biochimie 2010
2
26
arbres non conformes à la phylogénie de référence, difficiles à interpreter
14 Apr 2010 17:09
oralblandine
Biochimie 2010
2
26
problème interprétation arbres
12 Apr 2010 21:28
oralbre
Biochimie 2010
2
21
4homologues
8 Apr 2010 16:09
ameliane
Biochimie 2010
6
241
Problème dans l'interprétation de l'arbre obtenu
8 Apr 2010 15:31
oralblandine
Biochimie 2010
2
31
interprétation de mes arbres
8 Apr 2010 0:27
ameliane
Biochimie 2010
3
51
Divergence entre phylogénie établie et arbre obtenu par phylogeny.fr
24 Mar 2010 15:28
MSdu83
Biochimie 2010
3
102
Analyse phylogénétique
5 Mar 2010 16:56
leaman
Biochimie 2010
3
114
format
14 Dec 2009 15:13
clem_va
BioCell2009
2
28
arbre mal raciné
12 Dec 2009 22:56
farahetsalah
BioCell2009
1
12
arbre
12 Dec 2009 22:44
farahetsalah
BioCell2009
2
20
arbre phylogénétique
11 Dec 2009 15:04
sonia2hayiri
BioCell2009
4
88
problème d'interprétation d'arbre phylogénétique
11 Dec 2009 13:22
sonia2hayiri
BioCell2009
1
9
Mélange des 2 groupes
9 Dec 2009 15:39
farahetsalah
BioCell2009
2
22
arbre phylogenetique
7 Dec 2009 16:39
farahetsalah
BioCell2009
1
14
Despoir pour obtenir l'arbre phylogénétique
3 Dec 2009 18:53
ma-cha
BioCell2009
1
16
arbre en désordre
29 Nov 2009 13:32
famar
BioCell2009
4
56
incohérence de l'alignement multiple et de l'arbre.
27 Nov 2009 7:23
NAME
BioCell2009
1
11
Proteo groupe d'etude et autre bacteries exterieur
26 Nov 2009 15:58
NAME
BioCell2009
3
42
Mélange du groupe d'étude et du groupe extérieur
23 Nov 2009 15:01
fabisa
BioCell2009
2
27
Mélange des 2 groupes
15 May 2009 17:15
lbfm
Biochimie 2009
2
7
choiw groupe étude et extérieur
9 May 2009 19:47
louss_riquet
Biochimie 2009
2
13
bootstrap
26 Apr 2009 21:34
sweet
Biochimie 2009
1
14
groupe extérieur
26 Apr 2009 19:01
sweet
Biochimie 2009
2
27
groupe extérieur et d\'étude
21 Apr 2009 16:18
Adrien2
Biochimie 2009
2
33
Problème d'analyse d'arbre
15 Apr 2009 16:30
CALAMARS
Biochimie 2009
2
28
ARBRE
7 Apr 2009 16:59
CALAMARS
Biochimie 2009
2
33
identification des classe des organismes
3 Apr 2009 16:23
saidaloui
Biochimie 2009
1
21
comment faire l'arbre?
19 Dec 2008 14:17
dama
BioCell2008
6
100
Problème interprétation arbre
18 Dec 2008 16:44
Emiso
BioCell2008
4
70
Choix du groupe extérieur
17 Dec 2008 23:01
meline
BioCell2008
2
26
choix du groupe d'étude
17 Dec 2008 20:21
marmoh
BioCell2008
5
64
séquence environnementale marginale ?
17 Dec 2008 17:23
dama
BioCell2008
4
55
Problème groupe extérieur
17 Dec 2008 16:01
casan
BioCell2008
4
39
Arbres Intermédiaires
16 Dec 2008 19:08
Walidassiba
BioCell2008
3
55
Arbre bazar!
16 Dec 2008 17:40
teamide
BioCell2008
3
61
problème sur phylogeny.fr
15 Dec 2008 18:14
opale
BioCell2008
8
95
difficulté à interpréter
14 Dec 2008 21:31
ci_co
BioCell2008
3
45
Pour Mme Brochier
14 Dec 2008 17:51
magorne
BioCell2008
2
28
arbre
14 Dec 2008 16:20
dama
BioCell2008
2
18
Arbre
14 Dec 2008 10:30
Lilou
BioCell2008
2
30
Correction 2, à l'attention de Mme Brochier
12 Dec 2008 10:56
ci_co
BioCell2008
2
32
arbres tous différents !
12 Dec 2008 10:44
ci_co
BioCell2008
1
9
arbres tous différents !
7 Dec 2008 22:24
Walidassiba
BioCell2008
2
24
Groupe exterieur?
6 Dec 2008 12:19
magorne
BioCell2008
20
334
groupe extérieur
5 Dec 2008 15:55
Hingamp_BC08
BioCell2008
4
65
Explorer des arbres très rapidement
5 Dec 2008 13:00
eniyro
BioCell2008
5
57
les protéines universelles = la galère
4 Dec 2008 22:19
teamide
BioCell2008
2
25
problème d'interprétation
3 Dec 2008 17:03
Dj-neiluj
BioCell2008
1
17
Définition du groupe d'étude et du groupe extérieur
3 Dec 2008 15:20
Lilou
BioCell2008
8
111
Conversion Newick/NH -> arbre en texte
29 Nov 2008 15:41
magorne
BioCell2008
2
39
groupe exterieur
25 Nov 2008 18:24
mamagaga
BioCell2008
2
40
problème d'arbre
23 Nov 2008 13:30
magorne
BioCell2008
2
43
recherche de GE et Gext
22 Nov 2008 17:54
bioinfodj
BioCell2008
2
54
probleme arbre phylogenetique
20 Nov 2008 15:06
marmoh
BioCell2008
3
65
reSOS
20 Nov 2008 14:01
marmoh
BioCell2008
2
55
SOS
17 Apr 2008 9:05
BNPA
Biochimie 2008
2
20
arbre
15 Apr 2008 14:24
bloublou
Biochimie 2008
3
46
problème d'interprétation
11 Apr 2008 2:26
noura
Biochimie 2008
2
23
Arbre non raciné
2 Dec 2007 19:44
TAMT
BioCell 2007
2
34
Uncultured marine bacteria???
2 Dec 2007 13:09
AlbatarMazmaz
BioCell 2007
2
42
Choix des homologues.
1 Dec 2007 20:48
luluemmy
BioCell 2007
4
96
arbres Protpars différents de l'arbre NJ
1 Dec 2007 13:33
AlbatarMazmaz
BioCell 2007
2
41
Sémentique d'un mot.
1 Dec 2007 11:18
luluemmy
BioCell 2007
2
52
alignement multiple et arbre
30 Nov 2007 20:28
mavio
BioCell 2007
2
33
groupe externe
29 Nov 2007 20:21
milou
BioCell 2007
2
41
groupe exterieur
29 Nov 2007 12:43
milou
BioCell 2007
3
65
groupe exterieur
27 Nov 2007 16:20
laurelimate
BioCell 2007
2
44
Correction et groupe extérieur
27 Nov 2007 15:17
luluemmy
BioCell 2007
2
50
Groupe extérieur
25 Nov 2007 14:17
mavio
BioCell 2007
2
48
Groupe exterieur ou pas?
20 Nov 2007 16:59
TAMT
BioCell 2007
4
120
Pitite question au sujet des arbres...
13 Nov 2007 18:59
Brochier_BC07
BioCell 2007
1
33
Sites web utiles pour la taxonomie
13 Nov 2007 18:33
josh
BioCell 2007
2
56
Definir le groupe extérieur
13 Nov 2007 17:49
milou
BioCell 2007
4
143
choix des groupes d'etudes et exterieurs
13 Nov 2007 9:04
cqfpf
BioCell 2007
2
33
Plus de proximité avec le groupe extérieur.
9 Nov 2007 20:04
Brochier_BC07
BioCell 2007
1
25
Analyse phylogénétique des séquences obtenues à partir de la banque environnementale
13 Apr 2007 15:10
aurore
Biochimie 2007
2
31
determination orthologue/paralogue
13 Apr 2007 8:20
giraudaguerre
Biochimie 2007
2
27
Arbres
12 Apr 2007 17:15
madixu
Biochimie 2007
2
24
CHOIX DU GROUPE D'ETUDE
12 Apr 2007 11:03
giraudaguerre
Biochimie 2007
2
26
problémes concernant l'analyse des arbres
11 Apr 2007 13:31
aurore
Biochimie 2007
2
36
determination orthologues paralogues (bis)
10 Apr 2007 14:19
asergean
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4
52
groupe d'étude
9 Apr 2007 15:54
aurore
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PROBLEMES POUR CHOISIR LES ORTHOLOGUES ET LES PARALOGUES
24 Mar 2007 20:57
vleonet1
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53
problème d'arbre
24 Mar 2007 0:06
vleonet1
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32
Groupe d'étude / Groupe extérieur
23 Mar 2007 13:59
tyler
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détermination des paralogues/orthologues/xénologues
23 Mar 2007 11:06
madixu
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130
Choix du groupe extérieur
23 Mar 2007 10:17
mtadjdet
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39
groupe d'étude et groupe exterieur (cas d'un arbre raciné!)
21 Mar 2007 12:55
stefcec
Biochimie 2007
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31
Toutes les séquences homologues proviennent d'organismes inconnus (séquences métagénomiques)
21 Mar 2007 12:00
aurore
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32
Quelle séquence correspondant à notre ORF doit-on inclure dans l'arbre?
16 Mar 2007 17:41
Hingamp_B07
Biochimie 2007
1
24
Nouveautés pour l'alignement multiple et la phylogénie (www.phylogeny.fr)