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13
General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
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6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
21 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
41 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
23 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
27 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
54 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
163 Informations de classification taxonomique
12 Dec 2008 19:14 Supervisor Open Access
1
52 The Frequently Asked Questions (FAQ) version 1 is complete
17 Oct 2008 17:29 Pascal_Hingamp UNAM
1
38 New domain annotation fields, and other minor changes
11 Oct 2008 20:30 Pascal_Hingamp UNAM
1
33 Error in "Adding a sequence to cart" is mended
65
ORF finding
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1 Mar 2017 0:44 Ccile Open Access
1
2 Known vs Novel
25 Jun 2016 19:29 18575801_SY PSB2016
1
5 orf
24 Jun 2016 21:04 CamaliaTan PSB2016
1
7 TO36D_5877010.1 by Camalia Tan Hui Ci
24 Jun 2016 17:54 1859394011 PSB2016
1
3 TO41D_5887010.1
24 Jun 2016 17:47 185707260 PSB2016
1
4 Summary of TO25D_5888010.1
24 Jun 2016 17:29 Verniselim PSB2016
1
2 Orf findings
24 Jun 2016 16:48 DiyanaAtira PSB2016
1
3 ORF Finding TO9D_5892010.2
24 Jun 2016 8:39 nurulsakinah PSB2016
1
9 Orf findings
22 Jun 2016 14:49 enxinandjoey PSB2016
1
16 Complete strand
15 Jun 2016 22:14 Caristan PSB2016
1
23 ORF findings
17
Homolog hunting: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
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25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
7 blast
28 Apr 2011 16:39 SAM BSB6_spring2011
1
25 blast result
28 Apr 2011 15:17 Rabail BSB6_spring2011
1
10 BLAST!
28 Apr 2011 8:26 SAS BSB6_spring2011
1
7 BLAST Results
28 Apr 2011 8:11 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
6 Blast results
27 Apr 2011 9:27 B_hajra BSB6_spring2011
1
3 blast results
18 Apr 2011 9:50 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
5 Blast result
18 Apr 2011 9:48 BERA_HAJU BSB6_spring2011
1
2 No hits found
18 Apr 2011 9:43 farahanum BSB6_spring2011
1
5 BLAST results
18 Apr 2011 9:35 sanafarheen BSB6_spring2011
1
5 blast
6
Multiple sequence alignements
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28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
8 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
10 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
16 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
8 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
9 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
8 multiple sequnce alignmnt
17
Phylogenetic analysis
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25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
1 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
12 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
17 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
14 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
11 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
22 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
608 How to get a textual phylogenetic tree?
1
Ontologies (molecular function & biological process)
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25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
1 ontologies
7
Conserved domains
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25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
3 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
3 Summary of TO78M_5925010.1
28 Apr 2011 17:21 SAM BSB6_spring2011
1
15 conserved protein domains
28 Apr 2011 8:25 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
7 interpro
27 Apr 2011 9:57 B_hajra BSB6_spring2011
1
13 interpro results
8 Jan 2009 18:53 biologiste Open Access
2
90 résultats brutes
13
Conclusion
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25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
3 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
5 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
3 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
3 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
3 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
4 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
9 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
30 Apr 2015 12:49 Rebecca LaTrobe2015
1
28 Trk Protein
30 Apr 2011 22:30 Adil BSB6_spring2011
1
8 Message
488
Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
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3 Feb 2017 18:36 Vincent-Marine Bioch2017
2
19 Problème avec TaxReport
5 Jan 2017 14:31 Laury BioCell2016
2
24 Relance Oubli Soumission Correction 2
22 May 2016 21:02 FatouManon Clermont_2016
1
45 Erreur Soumission de projet
5 Feb 2016 18:12 P_Hingamp_16 Bioch2016
16
400 Questions (et réponses) sur les annotations
18 Dec 2015 13:19 P_Hingamp_15 BioCell2015
1
21 Examen de bioinformatique
8 Dec 2015 22:01 P_Hingamp_15 BioCell2015
1
12 Date limite pour la soumission des annotations 2 (finales) de la première séquence repoussée au 18/12
12 Oct 2015 19:24 BigBrother USTH2016
1
39 test
15 May 2015 12:03 Chabia Bioch2015
1
9 Examen écrit
2 May 2015 16:57 A_Quaiser OBI
1
11 Deadline pour annotation finale 7.4.2015
29 Apr 2015 11:59 CD_Blin OBI
3
35 Présentations des outils d'Annontathon
189
Recherche d'ORF
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28 Feb 2017 13:56 lasserve_aitou UCA_2016
1
52 ORF FINDER
31 Jan 2017 16:19 ClaraSophie Bioch2017
3
25 Search of ORF
3 Nov 2016 11:53 Bio3 BioCell2016
4
56 2 OFR avec des homologues
18 Nov 2015 14:46 lun BioCell2015
2
25 problème d'ORF
24 Oct 2015 14:53 JuSzLuCi BioCell2015
4
69 ORF en sens indirecte prennant la totalité de la séquence.
10 Apr 2015 19:45 M_LIinot OBI
3
42 ORF bizares ;)
30 Mar 2015 18:05 tuxx Bioch2015
1
11 Question
5 Nov 2014 17:38 genouxcagneux BioCell2014
2
30 Recherche d'ORF avec atg, gtg, ctg, ttg
5 Oct 2014 9:38 MarvinOstagh BioCell2014
2
66 choix de L'ORF
11 May 2012 10:33 SoMe Biochimie 2012
5
80 Choix de l'ORF
431
Recherche d'homologues: BLAST
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4 Jan 2017 9:30 WaitndSee AMIG2017
1
10 Significant alignments
8 Nov 2016 15:34 Laury BioCell2016
2
29 E value seuil et homologue distant
3 Feb 2016 21:35 AngB_HuaR AMIG2016
2
23 Choix de la e-value seuil
28 Jan 2016 13:47 P_Hingamp_16 Bioch2016
2
24 Abandon de l'annotation des séquences qui sont >95% identiques
3 Nov 2015 16:48 Pilgrim BioCell2015
5
97 Choix d'une e-value seuil
28 Oct 2015 15:38 RosnetRosellini BioCell2015
6
97 2 Blast très intéressant pour 2 ORF
5 May 2015 11:11 LaurieNoemie Bioch2015
2
25 Recherche de la valeur seuil
28 Apr 2015 18:22 IrigarayA Bioch2015
2
16 Chevauchements
21 Apr 2015 16:41 LaurieNoemie Bioch2015
2
21 Problèmes pour définir la valeur seuil
13 Apr 2015 19:10 IrigarayA Bioch2015
3
36 Rapport taxonomique
172
Alignement multiple: CLUSTALW
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28 Oct 2016 15:07 estana BioCell2016
2
28 groupe extérieur/ étude
9 Dec 2015 19:18 Pilgrim BioCell2015
2
16 Erreur d'annotation pour la séquence avec le meilleur alignement
5 Dec 2015 11:49 JuSzLuCi BioCell2015
2
25 Pertes de positions conservés
4 Dec 2014 8:40 ELPO BioCell2014
2
23 Problème d'alignement avec les choix des groupes
4 Nov 2014 20:55 ioanaetlobna BioCell2014
2
30 problème au niveau de l'alignement multiple
31 Oct 2014 15:28 SoulaNin BioCell2014
2
37 Alignement multiple avec GBlocks
21 May 2012 16:14 Bonaiti Biochimie 2012
3
36 error alignement multiple
15 May 2012 9:35 gpe2-roche Biochimie 2012
2
23 Dans le cas d'un second arbre...
11 May 2012 15:26 clemshe Biochimie 2012
3
53 urgent erreur phylogeny.fr
5 May 2012 22:37 gp1sogno Biochimie 2012
4
64 nombre de positions conservées cohérent?
515
Analyse phylogénétique
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23 Feb 2017 10:56 Vincent-Marine Bioch2017
6
48 Re enracinement de l'arbre (issus de la matrice de distance)
7 Nov 2016 15:26 SBDA BioCell2016
2
34 AU SECOURS, URGENT!
31 Oct 2016 10:54 voyagel3 BioCell2016
2
22 Hypothèse des événements évolutifs d'une espèce: DA ou HTG?
4 Oct 2016 18:06 P_Hingamp_BC16 BioCell2016
1
26 Si vous observez des arbres "tous mélangés"...
29 Sep 2016 14:58 zbrrrrra BioCell2016
2
35 détermination du groupe d'étude et extérieur
24 Sep 2016 16:38 Nico-Sosso BioCell2016
2
47 Choix du groupe extérieur
16 Dec 2015 0:17 Pilgrim BioCell2015
3
28 Conclusion sur la provenance de notre ORF
2 May 2015 18:50 FranckLea Bioch2015
2
18 Topologie de l'arbre
24 Apr 2015 14:06 FranckLea Bioch2015
5
57 Groupe d'étude et groupe extérieur
12 Apr 2015 14:28 Tcyr_Ab AMIG2016
3
42 Phylogeny.fr HS
100
Domaines conservés: INTERPRO
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8 Nov 2016 14:57 estana BioCell2016
2
14 dommaines protéiques
28 Oct 2016 11:25 Laury BioCell2016
2
17 Pas de domaine conservés retrouvés sur INTERPRO
10 May 2015 13:37 IrigarayA Bioch2015
1
8 Présentation tableau InterPro
5 May 2015 0:43 IrigarayA Bioch2015
2
13 Regroupement de domaines
22 Apr 2015 12:54 M_LIinot OBI
2
18 aa size
18 Dec 2014 15:30 SoulaNin BioCell2014
2
16 Fonctionnement d'Interpro
21 Nov 2014 14:02 LB-MN BioCell2014
2
20 Incompréhension d'une remarque
28 Oct 2014 16:28 Ali_Attaf BioCell2014
2
35 pas d'IPR
18 Feb 2012 14:37 imane-hafsoi Biochimie 2012
3
99 Choix de domaine protéique
18 Feb 2012 12:02 VinJenni Biochimie 2012
4
116 Absence de résultats pour la recherche de domaines protéiques
41
Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
12 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
18 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
58 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
46 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
32 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
51 pas de domaines structuraux sur interpro
16 Feb 2011 20:00 L3CharlotteAure Biochimie 2011
4
121 Fonctions moléculaires, processus biologiques et taxonomie
17 Dec 2010 18:04 MELO BioCell2010
2
46 Processus Biologique
21 Apr 2010 10:12 oralblandine Biochimie 2010
2
31 détermination de la fonction et du processus
18 Apr 2010 21:10 oralblandine Biochimie 2010
2
32 problème dans la détermination de la fonctions moléculaire et du processus biologique
33
Conclusion
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9 May 2015 19:14 LaurieNoemie Bioch2015
1
7 Nombre de caractère limites de la conclusion
8 May 2015 16:09 FranckLea Bioch2015
2
20 Poids moléculaire
27 Nov 2012 16:37 matou BioCell2012
1
46 Oubli du code [A CORRIGER]
19 Apr 2012 10:16 Stellathan Biochimie 2012
2
25 Symbole de gènes
3 Sep 2009 15:39 Hingamp BioCell 2005
9
50 test: ignorez SVP
26 Apr 2008 21:25 BNPA Biochimie 2008
1
19 notation et remarque
21 Apr 2008 23:54 bloublou Biochimie 2008
2
48 problème d'interprétation d'une correction
21 Apr 2008 21:16 noura Biochimie 2008
3
146 correction
14 Apr 2008 12:02 BNPA Biochimie 2008
1
26 correction conclusion
14 Apr 2008 10:07 BNPA Biochimie 2008
1
18 correction conclusion