Messages Themes
17
General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
25 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
6 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
6 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
22 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
34 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
62 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
43 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
27 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
59 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
203 Informations de classification taxonomique
83
ORF finding
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
29 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
7 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
6 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
8 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
8 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
6 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
7 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
1 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
17 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
23 ORF
27
Homolog hunting: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
13 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
15 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
26 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
16 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
10 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
16 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
50 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
14 No homology
3 Jul 2017 18:39 jiaxin PSB2017
1
48 New species found
25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
19 blast
8
Multiple sequence alignements
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
2 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
20 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
19 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
18 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
34 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
13 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
13 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
16 multiple sequnce alignmnt
17
Phylogenetic analysis
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
15 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
22 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
25 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
21 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
17 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
26 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
766 How to get a textual phylogenetic tree?
1
Ontologies (molecular function & biological process)
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
4 ontologies
15
Conserved domains
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
10 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
6 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
5 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
2 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
2 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
2 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
3 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
6 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
6 Summary of TO78M_5925010.1
15
Conclusion
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
24 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
19 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
10 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
18 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
10 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
4 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
7 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
6 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
12 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
582
Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
20 Nov 2020 14:01 A_Quaiser_20M2 M2_Rennes
1
27 Bonjour sur le forum
15 Nov 2020 16:30 ChaDev Master-Mer-2020
7
55 Email
15 Sep 2020 12:18 PHingamp_PGF20 PGF-2020
1
13 Documents supplémentaires pour comprendre les analyses à affectuer
2 Sep 2020 23:22 PHingampMM20 Master-Mer-2020
7
84 Ressources supplémentaires : PDF et screencast
24 Aug 2020 1:55 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
13
48 Résultats
19 Apr 2020 11:50 Meglecz19CTES L3-PGF-CTES-2019
1
11 Date limite repoussée au 04 mai
2 Apr 2020 11:56 F_Rosier_20 Bioch2020
1
26 Seconde annotation
18 Mar 2020 18:13 B_Wirth_20 Bioch2020
6
95 Délai supplémentaire de 24h ou 48h ?
14 Mar 2020 15:29 essai2020 Bioch2020
3
93 Test
13 Nov 2019 11:40 AQuaiser_19 AME_2019
1
19 forum within AME_2019 test message
291
Recherche d'ORF
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
26 Nov 2020 17:07 Emistien UCA_20_21
1
37 ORFs
18 Nov 2020 15:54 NoelGrafenstein M1_Orsay_2020
2
19 Chevauchement alors que même fonctions chez homologue ?
12 Nov 2020 14:43 ammarweng M1_Orsay_2020
2
18 Nombre différent de résultats dans la recherche d'ORF avec SMS et NCBI
4 Nov 2020 19:09 NoelGrafenstein M1_Orsay_2020
2
24 Question
4 Nov 2020 17:14 BOUTAMAGAN M1_Orsay_2020
1
12 Résultat première recherche d'ORF
4 Nov 2020 16:27 sana-jiaying M1_Orsay_2020
3
42 Recherche d'ORF
18 Oct 2020 12:36 ChaDev Master-Mer-2020
12
108 Analyse des résultats
23 Aug 2020 12:18 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
5
25 Résultats bruts
14 Aug 2020 8:51 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
6
12 Bonjour Mme Meclecz, Je souhaiterai vous identifier des séquences ORF
14 Aug 2020 8:44 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
2
4 Bonjour Mme Meclecz,
551
Recherche d'homologues: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
18 Nov 2020 16:17 NoelGrafenstein M1_Orsay_2020
2
16 E-value seuil
26 Sep 2020 19:53 HajarIslem PGF-2020
2
16 choix de séquences
5 Jun 2020 12:55 oassous L3-PGF-CTES-2019
2
6 Augmenter du nombre de séquences du groupe d'étude
27 Apr 2020 18:03 AgnesB L3-PGF-CTES-2019
3
25 e-value de 0.0 alors que moins de 90% de différence
19 Apr 2020 0:42 CandiceC L3-PGF-CTES-2019
7
85 Choix des séquences homologues pour le rapport taxonomique
27 Mar 2020 16:44 eleonore L3-PGF-CTES-2019
3
34 e-valeur seuil
17 Mar 2020 13:12 ouno Bioch2020
3
85 Tableau 3 Nombre et qualite des alignements detectes
16 Mar 2020 23:30 Yassine Bioch2020
5
174 Rapport taxonomique du Blast
16 Mar 2020 23:30 Yassine Bioch2020
2
56 Rapport taxonomique du Blast
24 May 2019 10:29 ramonapojar L3-PGF-CTES-2018
2
15 vérifier la fiabilité d'une annotation
228
Alignement multiple: CLUSTALW
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
7 Nov 2020 20:15 Fanny_Smahan PGF-2020
2
14 alignement
29 Oct 2020 14:11 HajarIslem PGF-2020
2
16 un souci avec l'alignement
21 Mar 2020 15:50 YasmineMyriam Bioch2020
2
35 questions TP
21 Mar 2020 15:36 YasmineMyriam Bioch2020
2
34 questions TP
17 Mar 2020 19:31 NimboKami Bioch2020
8
161 les Blocs
21 May 2019 20:43 ramonapojar L3-PGF-CTES-2018
3
27 deux protéines dans le meme ORF ?
10 May 2019 23:12 Krystel L3-PGF-CTES-2018
4
65 Gaps à l'intérieur de l'alignement
26 Apr 2019 16:57 nicomine Bioch2019
2
26 Positions conservées et arbres phylogénétique
16 Apr 2019 12:16 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
24 Déterminer la fonction de l'ORF
15 Apr 2019 22:14 teamNN Bioch2019
2
58 analyse attendue
677
Analyse phylogénétique
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Nov 2020 16:14 EmOmFa PGF-2020
2
9 Abre phylogénétique
21 Nov 2020 13:20 ChaDev Master-Mer-2020
2
10 Séquences métagénomiques
21 Nov 2020 10:59 ChaDev Master-Mer-2020
1
5 Rapport taxonomique
21 Nov 2020 10:11 ChaDev Master-Mer-2020
2
8 Rapport taxonomique
10 Nov 2020 22:40 PHingampMM20 Master-Mer-2020
2
12 Arbres BioNJ
2 Oct 2020 11:11 ChaDev Master-Mer-2020
3
27 Perte séquences pour aligment + arbre
27 Apr 2020 11:53 eleonore L3-PGF-CTES-2019
2
14 bootstrap
22 Apr 2020 2:01 CandiceC L3-PGF-CTES-2019
5
45 Positionnement de l'ORF dans l'arbre
21 Mar 2020 16:26 YasmineMyriam Bioch2020
2
30 Arbre phylogénétique
18 Mar 2020 19:44 SSA Bioch2020
2
42 construction des arbres
133
Domaines conservés: INTERPRO
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
26 Nov 2020 15:11 c18015311 Master-Mer-2020
5
15 Choix des domaines retenus
18 Oct 2020 14:58 ChaDev Master-Mer-2020
2
16 Fonction biologique
8 Sep 2020 11:57 eugtest BioCell2020
1
50 pred cdsearch
20 Mar 2020 15:05 bylka Bioch2020
5
83 analyse de l'arbre et de l'alignement multiple
13 Nov 2019 0:08 RLPGF PGF-2019
2
39 Domaine protéique étrange
9 Feb 2019 21:11 GRA1_Antoine BISM2019
6
191 Infos à mettre dans le Tableau
4 May 2018 20:59 MissDia95 Bioch2018
2
21 Les numéros d'IPR à mettre dans la table 2
3 May 2018 20:00 MissDia95 Bioch2018
2
20 Protocole
29 Apr 2018 18:42 Rosonp Bioch2018
3
23 GO term
29 Apr 2018 13:41 Rosonp Bioch2018
2
11 Toujours de GO-terms avec INTERPRO séquence 1
45
Fonctions moléculaires & Processus biologiques
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
21 May 2019 18:52 DebB L3-PGF-CTES-2018
3
28 Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
9 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
32 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
46 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
100 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
50 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
42 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
60 pas de domaines structuraux sur interpro
16 Feb 2011 20:00 L3CharlotteAure Biochimie 2011
4
145 Fonctions moléculaires, processus biologiques et taxonomie
17 Dec 2010 18:04 MELO BioCell2010
2
54 Processus Biologique
83
Conclusion
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
19 Nov 2020 11:32 ChaDev Master-Mer-2020
4
24 Correction
18 Nov 2020 16:43 ChaDev Master-Mer-2020
2
11 OGA
18 Nov 2020 16:37 ChaDev Master-Mer-2020
3
21 OGA
4 Nov 2020 18:50 AnouarBillal PGF-2020
2
16 Trop de caractère dans notre conclusion
17 Sep 2020 16:44 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
1
2 remise de l'Annotathon et attente de confirmation de l'heure et du lieu de l'examen
10 Sep 2020 14:10 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
7
27 Terminé à l'instant
24 Apr 2020 14:30 eleonore L3-PGF-CTES-2019
5
42 conclusion
17 Apr 2020 10:54 eleonore L3-PGF-CTES-2019
8
40 Arbre
7 Apr 2020 21:26 eleonore L3-PGF-CTES-2019
5
42 arbre
19 May 2019 19:53 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
34 Rickettsiales intruses