Anntathon
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français
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19
 General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
[All subjects] 10 last subjects:
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5 Sep 2023 5:09 zxjin426 KU-ILAS-23
2
 24 Errors
20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
 42 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
 12 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
 9 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
 27 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
 39 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
 74 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
 43 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
 28 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
 61 The "Rule book" is updated
83
 ORF finding
[All subjects] 10 last subjects:
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27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
 43 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
 12 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
 10 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
 11 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
 14 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
 7 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
 9 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
 2 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
 20 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
 25 ORF
32
 Homolog hunting: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
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7 Sep 2023 8:44 P_Hingamp_KU KU-ILAS-23
1
 8 For detailed book chapter on BLAST scoring and E-values
6 Sep 2023 8:29 P_Hingamp_KU KU-ILAS-23
4
 43 Concerning Sora's mysterious truncated BLAST lists of hits
27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
 30 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
 25 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
 31 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
 20 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
 14 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
 20 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
 56 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
 18 No homology
8
 Multiple sequence alignements
[All subjects] 10 last subjects:
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27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
 9 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
 34 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
 23 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 23 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
 49 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
 19 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 17 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
 24 multiple sequnce alignmnt
17
 Phylogenetic analysis
[All subjects] 10 last subjects:
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25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
 29 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 28 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
 30 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 28 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
 22 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
 28 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
 899 How to get a textual phylogenetic tree?
1
 Ontologies (molecular function & biological process)
[All subjects] 10 last subjects:
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25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
 8 ontologies
15
 Conserved domains
[All subjects] 10 last subjects:
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24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
 14 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
 16 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
 11 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
 6 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
 4 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
 3 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
 5 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
 5 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
 13 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
 8 Summary of TO78M_5925010.1
15
 Conclusion
[All subjects] 10 last subjects:
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21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
 26 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
 21 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
 17 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
 18 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
 14 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
 6 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
 13 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
 4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
 7 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
 13 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
629
 Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
[All subjects] 10 last subjects:
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1 Jul 2023 7:10 Mounire L3-PGF-CTES-2023
1
 3 Fragment de séquence provenant de la mer Baltique. Annotathon
21 Feb 2023 21:37 marieb L3-PGF-CTES-2023
3
 54 ouvrir 2 pages d'annotation
9 Feb 2023 19:36 marieb L3-PGF-CTES-2023
2
 42 erreur
24 Nov 2022 10:51 AugustinF L3-PGF-2022
1
 11 Oral de Bioinformatique
23 Nov 2022 13:16 bouillard L3-PGF-2022
2
 24 pip
28 Sep 2022 18:52 bouillard L3-PGF-2022
3
 47 recherche sequence
21 Apr 2022 14:07 Ma93 L3-PGF-CTES-2021
4
 56 choix du groupe d'étude
14 Apr 2022 9:10 Laurence L3-PGF-CTES-2021
2
 33 soumission séquence - passage de Annotation I à Corrrection I
17 Mar 2022 12:29 test_2022 Bioch2022
1
 21 Test
17 Mar 2022 12:24 B_Wirth_22 Bioch2022
2
 19 Test
435
 Recherche d'ORF
[All subjects] 10 last subjects:
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29 May 2023 17:06 princesses WutAMU2023
1
 12 Modifier la classification de ORF2
13 Apr 2023 15:07 Printemps2023 L3-PGF-CTES-2023
4
 36 statut 3' incomplet
30 Mar 2023 20:05 Varly L3-PGF-CTES-2023
2
 22 ORf
12 Mar 2023 19:35 noapardo L3-PGF-CTES-2023
4
 56 Choix d'ORF
27 Feb 2023 18:33 noapardo L3-PGF-CTES-2023
2
 34 Determiner les ORF individuellement
21 Feb 2023 19:24 retenodus L3-PGF-CTES-2023
3
 52 ORF non complet / classification
30 Jan 2023 10:27 Veronica L3-PGF-CTES-2023
3
 54 ORFs sans homologue sur Swiss Prot
30 Jan 2023 10:18 Veronica L3-PGF-CTES-2023
3
 66 Choix ORFs
16 Oct 2022 19:47 Lesboss BioCell2022
1
 42 diagramme orf
5 Oct 2022 15:17 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
2
 36 Gènes absents
731
 Recherche d'homologues: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
12 Aug 2023 23:33 Carbon14 L3-PGF-CTES-2023
3
 6 Détermination de la e-value seuil
5 Jun 2023 16:46 QiaoJin WutAMU2023
1
 7 Modifier la section de BLAST
10 Apr 2023 12:24 B_Wirth_23 Bioch2023
1
 18 Définition de la e-value seuil dans NR
10 Apr 2023 11:59 B_Wirth_23 Bioch2023
1
 12 Définition de la e-value seuil dans SP
14 Mar 2023 11:02 Sundance L3-PGF-CTES-2023
2
 26 E-valeur=0
13 Mar 2023 22:06 noapardo L3-PGF-CTES-2023
11
 121 "Definition List"
2 Mar 2023 19:23 noapardo L3-PGF-CTES-2023
1
 12 Proteines hypothetiques
2 Mar 2023 19:21 noapardo L3-PGF-CTES-2023
6
 48 Proteines hypothetiques
2 Mar 2023 19:16 noapardo L3-PGF-CTES-2023
3
 30 Aucune similarites trouvees
2 Mar 2023 17:19 marieb L3-PGF-CTES-2023
2
 18 e value 0
345
 Alignement multiple: CLUSTALW
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
29 May 2023 10:14 wuhan_killers WutAMU2023
2
 24 Changer le nombre d'INDELS.
12 May 2023 0:28 Varly L3-PGF-CTES-2023
2
 12 Nombres de séquences
28 Apr 2023 17:11 B_Wirth_23 Bioch2023
1
 6 Trouver les résidus importants pour la fonction/activité de notre famille de protéines
14 Apr 2023 16:14 Printemps2023 L3-PGF-CTES-2023
1
 11 ORF beaucoup plus court que les homologues
14 Apr 2023 13:57 Quentacio Bioch2023
2
 27 Construction de l'arbre
31 Mar 2023 13:21 noapardo L3-PGF-CTES-2023
6
 68 Choix de groupe d'étude
17 Mar 2023 0:28 AMIRA L3-PGF-CTES-2023
4
 32 Choix des groupes extérieurs
3 Mar 2023 22:27 AMIRA L3-PGF-CTES-2023
4
 54 Choix de groupe d'étude
2 Mar 2023 9:39 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023
4
 64 resultats alignements multiples
28 Feb 2023 10:46 LEVY L3-PGF-CTES-2023
6
 87 choisir des séquences
972
 Analyse phylogénétique
[All subjects] 10 last subjects:
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4 Aug 2023 12:55 sarah1904 L3-PGF-CTES-2023
2
 5 enracinement de l'arbre
31 Jul 2023 17:46 sarah1904 L3-PGF-CTES-2023
2
 5 NEWUCK TREE MANIPULATION
14 Jun 2023 10:49 marieb L3-PGF-CTES-2023
2
 13 enracinement de l'arbre
13 Jun 2023 16:34 Printemps2023 L3-PGF-CTES-2023
2
 9 Impossibilité d'inclure plus de séquences de Pelagibacterales
24 May 2023 10:24 Varly L3-PGF-CTES-2023
2
 15 Enracinement de l'arbre
23 May 2023 22:37 Varly L3-PGF-CTES-2023
2
 13 Enracinement de l'arbre
12 May 2023 8:57 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023
4
 41 arbre
9 May 2023 23:27 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023
2
 11 phylogeny.fr --> format newick incomplet
9 May 2023 23:00 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023
1
 5 phylogeny.fr --> format newick incomplet
28 Apr 2023 17:37 GAnaluciaOR Bioch2023
2
 9 tax report et choix groupe externe
152
 Domaines conservés: INTERPRO
[All subjects] 10 last subjects:
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24 Nov 2022 15:00 LesPerdus BioCell2022
1
 28 Petit problème sur la recherche de domaines protéiques INTERPRO
1 May 2022 17:41 SRSM Bioch2022
2
 9 Choix du domaine
11 Apr 2022 23:00 Sylia Bioch2022
3
 36 Domaine protéique non conservé dans la famille
26 Mar 2022 12:10 mongeoussada Bioch2022
2
 30 Choix du domaine retenu
13 Oct 2021 20:01 ilonaMi Master-Mer-2021
3
 32 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:57 ilonaMi Master-Mer-2021
1
 7 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:56 ilonaMi Master-Mer-2021
1
 8 Choix du profil Interpro pour table 2
4 Oct 2021 18:16 emmaRO Master-Mer-2021
2
 29 Domaines protéiques à annoter
27 Sep 2021 17:42 Thibault_A Master-Mer-2021
2
 32 Domaines protéiques INTERPRO
20 Sep 2021 11:15 ilonaMi Master-Mer-2021
2
 30 Base de données
52
 Fonctions moléculaires & Processus biologiques
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
28 Apr 2023 16:46 B_Wirth_23 Bioch2023
1
 3 Absence de processus biologique dans Interpro
28 Apr 2023 16:32 B_Wirth_23 Bioch2023
1
 2 Symbole de gène
29 Apr 2022 11:21 Faiznaleann Bioch2022
4
 31 Contradiction
28 Apr 2022 10:37 B_Wirth_22 Bioch2022
1
 12 Choix du Processus biologique
21 May 2019 18:52 DebB L3-PGF-CTES-2018
3
 50 Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
 13 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
 46 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
 70 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
 136 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
 54 Problème de choix de la fonction moléculaire
121
 Conclusion
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
12 Oct 2022 12:16 IMalki L3-PGF-2022
1
 19 Pour sars Cov 1
28 Sep 2022 14:18 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
1
 19 J'ai trouvé des nouveaux génomes + génome privé
27 Sep 2022 17:48 P_Hingamp_PGF22 L3-PGF-2022
1
 12 Paru hier : article "Origine du SARS-CoV-2 et du Covid-19 : le point sur l’enquête en cours et les dernières hypothèses"
26 Sep 2022 18:51 P_Hingamp_PGF22 L3-PGF-2022
1
 11 Le virus qui venait du froid...
23 Sep 2022 10:38 hoda1 L3-PGF-2022
1
 21 J'ai trouvé le génome complet de la souche BANAL-20-52/Laos/2020 identifiée par l'Institut Pasteur
22 Sep 2022 20:27 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
1
 20 J'ai trouvé le génome complet de SARS-Cov1 (Souche Tor2)
22 Sep 2022 20:18 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
1
 19 J'ai trouvé le génome complet de SARS-Cov2 - Wuhan-Hu-1
22 Sep 2022 17:41 P_Hingamp_PGF22 L3-PGF-2022
2
 22 Max une séquence de référence par étudiant :) Et d'autres séquences de références sont les bienvenues
22 Sep 2022 17:38 chamcham L3-PGF-2022
1
 20 J'ai trouvé le génome du MERS
22 Sep 2022 17:35 IMalki L3-PGF-2022
1
 19 j'ai trouvé le genome du Sars-CoV 2