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Annotathon v1.04
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17
General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
[All subjects]
10 last subjects:
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Subject
20 Apr 2018 8:30
ashru2006
Open Access
1
35
Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29
ashru2006
Open Access
1
10
Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24
ashru2006
Open Access
1
9
Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39
E_Meglecz18
USTH2018
1
26
closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12
trungbui
USTH2017
1
37
Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53
CamaliaTan
PSB2016
2
73
This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51
staggerwin
Open Access
2
43
Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30
bigecske2
UNIDEB
1
28
annotálás
9 Jan 2009 21:38
Supervisor
Open Access
1
61
The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49
chevalier
Open Access
3
224
Informations de classification taxonomique
83
ORF finding
[All subjects]
10 last subjects:
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Subject
27 Jul 2018 11:32
Ryann
PSB2018
1
42
ORF
27 Jul 2018 11:27
Ryann
PSB2018
1
12
ORF
27 Jul 2018 11:11
Ryann
PSB2018
1
10
ORF
27 Jul 2018 9:31
NICSXY
PSB2018
1
11
orf_1
27 Jul 2018 9:25
NICSXY
PSB2018
1
13
ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35
Jeremylimsy1995
Open Access
1
7
orf
26 Jul 2018 10:57
riceline
PSB2018
1
8
FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42
riceline
PSB2018
1
2
FASTA
23 Jul 2018 13:36
shaz
PSB2018
1
19
NO ORF
23 Jul 2018 7:14
Thasheeni
PSB2018
1
25
ORF
27
Homolog hunting: BLAST
[All subjects]
10 last subjects:
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Subject
27 Jul 2018 11:36
Ryann
PSB2018
1
24
BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48
Thasheeni
PSB2018
1
23
BLASTp
21 Jul 2018 7:40
Janus
PSB2018
1
31
No significant homology
21 Jul 2018 7:32
Janus
PSB2018
1
19
Only one homologue
21 Jul 2018 7:29
Janus
PSB2018
1
14
No putative protein
21 Jul 2018 7:28
Janus
PSB2018
1
19
Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23
Janus
PSB2018
2
54
E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16
Tessaoh
PSB2018
1
17
No homology
3 Jul 2017 18:39
jiaxin
PSB2017
1
50
New species found
25 Jun 2016 19:28
18575801_SY
PSB2016
1
25
blast
8
Multiple sequence alignements
[All subjects]
10 last subjects:
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Subject
27 Jul 2018 11:41
Ryann
PSB2018
1
8
MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08
Thasheeni
PSB2018
1
32
Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40
SAS
BSB6_spring2011
1
22
MSA
28 Apr 2011 8:18
HiraEjaz
BSB6_spring2011
1
22
clustalw2
27 Apr 2011 9:52
B_hajra
BSB6_spring2011
1
46
multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37
B_hajra
BSB6_spring2011
1
18
multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36
sanafarheen
BSB6_spring2011
1
16
msa :D
18 Apr 2011 9:29
sid_afo
BSB6_spring2011
1
23
multiple sequnce alignmnt
17
Phylogenetic analysis
[All subjects]
10 last subjects:
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Readers
Subject
25 Jun 2016 19:30
18575801_SY
PSB2016
1
28
Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21
HiraEjaz
BSB6_spring2011
1
26
tree
27 Apr 2011 10:00
B_hajra
BSB6_spring2011
1
29
tree analysis
18 Apr 2011 9:38
sanafarheen
BSB6_spring2011
1
28
phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32
sid_afo
BSB6_spring2011
1
20
tree details
19 May 2009 11:17
Maleeha
BSB06CIIT
1
28
annotation
27 Nov 2008 20:14
drhoads
Open Access
11
888
How to get a textual phylogenetic tree?
1
Ontologies (molecular function & biological process)
[All subjects]
10 last subjects:
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Readers
Subject
25 Jun 2016 19:34
18575801_SY
PSB2016
1
8
ontologies
15
Conserved domains
[All subjects]
10 last subjects:
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Readers
Subject
24 Jul 2018 9:57
Grace
PSB2018
1
14
no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15
ashru2006
Open Access
1
15
INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14
ashru2006
Open Access
1
11
Protein Domains
20 Apr 2018 8:11
ashru2006
Open Access
1
6
Protein Domains
20 Apr 2018 8:07
ashru2006
Open Access
1
4
Protein Domains
20 Apr 2018 8:05
ashru2006
Open Access
1
3
Protein Domains
20 Apr 2018 8:04
ashru2006
Open Access
1
4
Protein Domains
20 Apr 2018 8:03
ashru2006
Open Access
1
5
Protein Domains
25 Jun 2016 19:32
18575801_SY
PSB2016
1
13
Conserved domains
25 Jun 2016 10:54
YAPws
PSB2016
1
8
Summary of TO78M_5925010.1
15
Conclusion
[All subjects]
10 last subjects:
Messages
Readers
Subject
21 Jul 2018 7:38
Janus
PSB2018
1
25
Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32
nhminh0701
USTH2018
1
20
Vai cut
25 Jun 2016 19:35
18575801_SY
PSB2016
1
16
conclusion
24 Jun 2016 17:34
xuejing
PSB2016
1
18
Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28
Verniselim
PSB2016
1
14
Conclusion
24 Jun 2016 16:50
18393000
PSB2016
1
5
TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38
reggiepsb
PSB2016
1
12
Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25
SiowChen
PSB2016
1
4
>TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14
SyawqinaAdlin
PSB2016
1
7
Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40
018548141
PSB2016
1
12
Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
618
Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
[All subjects]
10 last subjects:
Messages
Readers
Subject
21 Apr 2022 14:07
Ma93
L3-PGF-CTES-2021
4
44
choix du groupe d'étude
14 Apr 2022 9:10
Laurence
L3-PGF-CTES-2021
2
33
soumission séquence - passage de Annotation I à Corrrection I
17 Mar 2022 12:29
test_2022
Bioch2022
1
21
Test
17 Mar 2022 12:24
B_Wirth_22
Bioch2022
2
19
Test
14 Mar 2022 17:09
MarinePapot
L3-PGF-CTES-2021
7
118
NCBI Blast : bouton Reformat, autre option?
4 Sep 2021 18:47
C_Petitjean_21
Bristol-2021
1
14
General questions
16 Aug 2021 16:31
C_test
Bristol-2021
3
47
Test
8 Apr 2021 16:03
CHI
L3-PGF-CTES-2020
3
57
diagramme des ORFs détecters
31 Mar 2021 10:43
Meglecz20CTES
L3-PGF-CTES-2020
3
120
Grille d’évaluation, rédaction de rapport
30 Mar 2021 9:48
B_Wirth_etu
Bioch2021
2
50
Test
410
Recherche d'ORF
[All subjects]
10 last subjects:
Messages
Readers
Subject
15 Apr 2022 15:43
miyuka
Bioch2022
4
36
Choix de l'ORF KNOWN
14 Apr 2022 15:34
AshleyRusso
L3-PGF-CTES-2021
2
23
ORF codant ? Pertinent pour annotation ?
11 Apr 2022 15:32
Dvo26
L3-PGF-CTES-2021
3
45
choix de l'ORF
9 Apr 2022 13:57
mongeoussada
Bioch2022
4
52
ORF complet ou incomplet
2 Apr 2022 18:00
Faiznaleann
Bioch2022
1
12
choix de l'ORF
31 Mar 2022 14:13
Emilie20
L3-PGF-CTES-2021
2
34
Recherche Faux Positif
30 Mar 2022 14:16
MaeBinaud
L3-PGF-CTES-2021
5
96
ORF complet ou non
11 Mar 2022 18:40
AgatheB
L3-PGF-CTES-2021
7
146
Erreur codon stop
9 Mar 2022 10:41
MarinePapot
L3-PGF-CTES-2021
6
103
fin ORF
6 Mar 2022 14:20
Dvo26
L3-PGF-CTES-2021
5
95
questions sur sequence + diagramme
693
Recherche d'homologues: BLAST
[All subjects]
10 last subjects:
Messages
Readers
Subject
24 Apr 2022 19:14
PLQE
Bioch2022
2
25
Comment connaitre la e-value seuil ?
21 Apr 2022 17:29
AurelieB
L3-PGF-CTES-2021
5
66
Choix groupe d'étude et groupe extérieur
19 Apr 2022 20:00
Emilie20
L3-PGF-CTES-2021
3
39
Choix groupe d'étude_Phylum non classifié
18 Apr 2022 16:15
AshleyRusso
L3-PGF-CTES-2021
2
17
Gene Ontology et synonyme
13 Apr 2022 13:17
Anissa
L3-PGF-CTES-2021
2
16
autres ORF possibles sur blast x
12 Apr 2022 14:34
Dvo26
L3-PGF-CTES-2021
5
65
choix séquences groupe d'étude / extérieur
4 Apr 2022 9:38
soleneA
L3-PGF-CTES-2021
4
68
Problemes de choix du groupe exterieur pour l'etude et questions sur l'arbre
31 Mar 2022 16:48
MaeBinaud
L3-PGF-CTES-2021
4
60
Définition de la fonction d'un ORF
30 Mar 2022 8:26
soleneA
L3-PGF-CTES-2021
2
34
Groupe d'etude et groupe exterieur
28 Mar 2022 21:03
maellejarnoux
L3-PGF-CTES-2021
2
29
Choix de l'e-valeur seuil
313
Alignement multiple: CLUSTALW
[All subjects]
10 last subjects:
Messages
Readers
Subject
28 Apr 2022 11:41
B_Wirth_22
Bioch2022
1
11
Nombre d'aa manquants aux extrémités : /Blast et /clustalW
21 Apr 2022 15:08
SofiaOuarriche
L3-PGF-CTES-2021
2
24
annalyse de l'orf
13 Apr 2022 11:32
soleneA
L3-PGF-CTES-2021
2
29
Nombre de gap internes
12 Apr 2022 18:34
Anna
L3-PGF-CTES-2021
4
55
Pourcentage identité faible dans l'alignement
5 Apr 2022 14:35
MaeBinaud
L3-PGF-CTES-2021
4
72
Choix du groupe d'étude et du groupe extérieur
1 Apr 2022 17:13
maellejarnoux
L3-PGF-CTES-2021
5
75
Choix du groupe d'étude
20 Oct 2021 10:28
Benameur
L3-PGF-2021
2
32
SITE D INSERTION FCS
20 Oct 2021 10:17
Rahma
L3-PGF-2021
2
27
FCS
19 Oct 2021 21:02
Soline1
L3-PGF-2021
2
26
MSA insertion FCS
19 Oct 2021 20:47
CHANGKE
L3-PGF-2021
1
13
FCS dans certains CoV
892
Analyse phylogénétique
[All subjects]
10 last subjects:
Messages
Readers
Subject
28 May 2022 19:08
Anissa
L3-PGF-CTES-2021
2
9
modification arbre et analyse
24 Apr 2022 20:57
SofiaOuarriche
L3-PGF-CTES-2021
2
20
enracinement de l'arbre
24 Apr 2022 14:48
Dvo26
L3-PGF-CTES-2021
1
10
appartenance de la séquence étudiée
23 Apr 2022 20:46
SofiaOuarriche
L3-PGF-CTES-2021
6
62
choix de groupe d'étude
23 Apr 2022 18:16
AshleyRusso
L3-PGF-CTES-2021
3
36
Arbre erroné et choix de groupes
22 Apr 2022 9:50
Emilie20
L3-PGF-CTES-2021
3
42
Séquences et conclusion
21 Apr 2022 16:44
AgatheB
L3-PGF-CTES-2021
2
24
Séquence groupe extérieur mal placée
19 Apr 2022 16:42
AshleyRusso
L3-PGF-CTES-2021
4
53
Choix groupe d'étude et extérieur
19 Apr 2022 13:52
ClementineC
L3-PGF-CTES-2021
4
58
Groupe d'étude dispersé dans l'arbre
18 Apr 2022 23:04
Dvo26
L3-PGF-CTES-2021
2
26
couleur arbre phylo
151
Domaines conservés: INTERPRO
[All subjects]
10 last subjects:
Messages
Readers
Subject
1 May 2022 17:41
SRSM
Bioch2022
2
7
Choix du domaine
11 Apr 2022 23:00
Sylia
Bioch2022
3
33
Domaine protéique non conservé dans la famille
26 Mar 2022 12:10
mongeoussada
Bioch2022
2
30
Choix du domaine retenu
13 Oct 2021 20:01
ilonaMi
Master-Mer-2021
3
29
Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:57
ilonaMi
Master-Mer-2021
1
6
Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:56
ilonaMi
Master-Mer-2021
1
7
Choix du profil Interpro pour table 2
4 Oct 2021 18:16
emmaRO
Master-Mer-2021
2
29
Domaines protéiques à annoter
27 Sep 2021 17:42
Thibault_A
Master-Mer-2021
2
30
Domaines protéiques INTERPRO
20 Sep 2021 11:15
ilonaMi
Master-Mer-2021
2
30
Base de données
26 Nov 2020 15:11
c18015311
Master-Mer-2020
5
51
Choix des domaines retenus
50
Fonctions moléculaires & Processus biologiques
[All subjects]
10 last subjects:
Messages
Readers
Subject
29 Apr 2022 11:21
Faiznaleann
Bioch2022
4
27
Contradiction
28 Apr 2022 10:37
B_Wirth_22
Bioch2022
1
11
Choix du Processus biologique
21 May 2019 18:52
DebB
L3-PGF-CTES-2018
3
49
Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15
MissDia95
Bioch2018
1
13
Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24
ClaraSophie
Bioch2017
2
44
Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22
Vincent-Marine
Bioch2017
3
58
Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41
FranckLea
Bioch2015
7
136
Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04
Tythan
AMIG2016
2
54
Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24
quentlude
Biochimie 2012
2
61
Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18
BrothTeam
Biochimie 2011
3
66
pas de domaines structuraux sur interpro
103
Conclusion
[All subjects]
10 last subjects:
Messages
Readers
Subject
28 Apr 2022 10:51
B_Wirth_22
Bioch2022
1
10
Nombre de caractères attendus
19 Apr 2022 12:50
MaeBinaud
L3-PGF-CTES-2021
5
80
Début de l'ORF
14 May 2021 13:09
Belmont
L3-PGF-CTES-2020
2
30
Homologue
13 May 2021 16:03
sterna
L3-PGF-CTES-2020
2
48
nombres d'homologues
5 May 2021 17:01
Fatima
L3-PGF-CTES-2020
4
64
Le nombre élevé des hits d'eucaryotes
18 Apr 2021 12:19
esther
L3-PGF-CTES-2020
4
110
problème
30 Mar 2021 14:51
Benjii936
L3-PGF-CTES-2020
2
63
aide
19 Nov 2020 11:32
ChaDev
Master-Mer-2020
4
72
Correction
18 Nov 2020 16:43
ChaDev
Master-Mer-2020
2
13
OGA
18 Nov 2020 16:37
ChaDev
Master-Mer-2020
3
33
OGA