Anntathon
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français
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17
 General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
[All subjects] 10 last subjects:
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20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
 20 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
 4 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
 5 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
 22 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
 33 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
 62 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
 39 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
 27 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
 58 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
 200 Informations de classification taxonomique
83
 ORF finding
[All subjects] 10 last subjects:
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27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
 25 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
 5 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
 5 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
 6 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
 6 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
 4 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
 6 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
 1 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
 17 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
 21 ORF
27
 Homolog hunting: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
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27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
 11 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
 13 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
 26 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
 16 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
 10 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
 16 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
 50 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
 13 No homology
3 Jul 2017 18:39 jiaxin PSB2017
1
 47 New species found
25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
 18 blast
8
 Multiple sequence alignements
[All subjects] 10 last subjects:
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27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
 2 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
 20 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
 19 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 18 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
 34 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
 13 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 13 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
 16 multiple sequnce alignmnt
17
 Phylogenetic analysis
[All subjects] 10 last subjects:
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25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
 12 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 20 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
 22 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 18 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
 15 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
 25 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
 743 How to get a textual phylogenetic tree?
1
 Ontologies (molecular function & biological process)
[All subjects] 10 last subjects:
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25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
 4 ontologies
15
 Conserved domains
[All subjects] 10 last subjects:
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24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
 9 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
 6 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
 4 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
 2 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
 2 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
 3 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
 6 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
 6 Summary of TO78M_5925010.1
15
 Conclusion
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21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
 24 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
 19 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
 9 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
 17 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
 9 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
 4 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
 6 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
 4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
 5 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
 12 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
548
 Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
[All subjects] 10 last subjects:
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2 Apr 2020 11:56 F_Rosier_20 Bioch2020
1
 10 Seconde annotation
18 Mar 2020 18:13 B_Wirth_20 Bioch2020
6
 77 Délai supplémentaire de 24h ou 48h ?
14 Mar 2020 15:29 essai2020 Bioch2020
3
 87 Test
13 Nov 2019 11:40 AQuaiser_19 AME_2019
1
 19 forum within AME_2019 test message
2 Apr 2019 18:44 MAudhui OBI_2019
4
 57 Echéance
31 Mar 2019 23:09 Leacauchois18 L3-PGF-CTES-2018
6
 106 Informations
29 Mar 2019 16:09 LAETITIA L3-PGF-CTES-2018
3
 86 règles de fairplay
12 Feb 2019 12:55 isis L3-PGF-CTES-2018
8
 225 e valeur
7 Feb 2019 16:46 LauraCTES L3-PGF-CTES-2018
11
 345 Absence de codon STOP à la fin d'un ORF
7 Feb 2019 16:37 LauraCTES L3-PGF-CTES-2018
1
 20 Absence de codon STOP à la fin d'un ORF
244
 Recherche d'ORF
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20 Mar 2020 12:02 ouno Bioch2020
4
 48 Poids Moleculaire
20 Nov 2019 12:44 anloiret UCA_19_20
1
 40 1ère analyse
23 Oct 2019 12:45 carand0224 UCA_19_20
1
 45 1ère analyse
23 Oct 2019 9:02 Mars UCA_19_20
1
 45 ORFFinder
15 Apr 2019 10:04 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 51 Choix final
14 Apr 2019 20:40 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 30 Cas particulier
11 Apr 2019 11:25 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 28 Nombre à virgule
9 Apr 2019 13:42 sheina L3-PGF-CTES-2018
9
 115 plus explications
9 Apr 2019 13:41 sheina L3-PGF-CTES-2018
1
 12 plus explications
8 Apr 2019 21:56 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 45 Ai-je bien compris?
534
 Recherche d'homologues: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
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27 Mar 2020 16:44 eleonore L3-PGF-CTES-2019
3
 9 e-valeur seuil
17 Mar 2020 13:12 ouno Bioch2020
3
 82 Tableau 3 Nombre et qualite des alignements detectes
16 Mar 2020 23:30 Yassine Bioch2020
5
 149 Rapport taxonomique du Blast
16 Mar 2020 23:30 Yassine Bioch2020
2
 46 Rapport taxonomique du Blast
24 May 2019 10:29 ramonapojar L3-PGF-CTES-2018
2
 15 vérifier la fiabilité d'une annotation
19 May 2019 14:41 sheina L3-PGF-CTES-2018
4
 30 Fonction de mon ORF
8 May 2019 16:38 isis L3-PGF-CTES-2018
8
 157 valeur seuil
14 Apr 2019 20:50 sheina L3-PGF-CTES-2018
4
 39 Longueur
10 Apr 2019 17:33 HarryTuttle L3-PGF-CTES-2018
3
 37 doute sur le code génétique en revoyant la vidéo sur le BLASTx pour recherche rapide d'homologues
9 Apr 2019 17:54 DebB L3-PGF-CTES-2018
2
 37 Doute dans le choix du groupe d'étude et extérieur
224
 Alignement multiple: CLUSTALW
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21 Mar 2020 15:50 YasmineMyriam Bioch2020
2
 19 questions TP
21 Mar 2020 15:36 YasmineMyriam Bioch2020
2
 19 questions TP
17 Mar 2020 19:31 NimboKami Bioch2020
8
 144 les Blocs
21 May 2019 20:43 ramonapojar L3-PGF-CTES-2018
3
 27 deux protéines dans le meme ORF ?
10 May 2019 23:12 Krystel L3-PGF-CTES-2018
4
 60 Gaps à l'intérieur de l'alignement
26 Apr 2019 16:57 nicomine Bioch2019
2
 24 Positions conservées et arbres phylogénétique
16 Apr 2019 12:16 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 24 Déterminer la fonction de l'ORF
15 Apr 2019 22:14 teamNN Bioch2019
2
 43 analyse attendue
4 Apr 2019 22:01 hayafarouz L3-PGF-CTES-2018
7
 135 GROUPE D'etude imprecis mais forte e value
2 Apr 2019 15:03 JulieP L3-PGF-CTES-2018
5
 105 Alignement me semblant mauvais
658
 Analyse phylogénétique
[All subjects] 10 last subjects:
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21 Mar 2020 16:26 YasmineMyriam Bioch2020
2
 20 Arbre phylogénétique
18 Mar 2020 19:44 SSA Bioch2020
2
 31 construction des arbres
18 Mar 2020 11:52 Yassine Bioch2020
2
 43 Séparation des deux groupes d'étude et externe
17 Mar 2020 18:37 ouno Bioch2020
7
 124 Arbre phylogénique
20 Sep 2019 16:15 PHingampMM19 Master-Sciences-Mer
1
 9 Image de l'arbre "Zarbi" de la séquence OMRGCv2_8442080
26 May 2019 16:27 SARAH L3-PGF-CTES-2018
1
 9 RACINE et noeud
24 May 2019 15:08 SARAH L3-PGF-CTES-2018
4
 27 probleme racine
28 Apr 2019 18:41 sheina L3-PGF-CTES-2018
4
 28 Format du texte pour l'arbre
26 Apr 2019 15:04 SARFEL Bioch2019
4
 48 Arbe phylogénique
25 Apr 2019 10:26 Audelia L3-PGF-CTES-2018
2
 22 Choix du groupe d'étude
123
 Domaines conservés: INTERPRO
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20 Mar 2020 15:05 bylka Bioch2020
3
 52 analyse de l'arbre et de l'alignement multiple
13 Nov 2019 0:08 RLPGF PGF-2019
2
 33 Domaine protéique étrange
9 Feb 2019 21:11 GRA1_Antoine BISM2019
6
 185 Infos à mettre dans le Tableau
4 May 2018 20:59 MissDia95 Bioch2018
2
 19 Les numéros d'IPR à mettre dans la table 2
3 May 2018 20:00 MissDia95 Bioch2018
2
 14 Protocole
29 Apr 2018 18:42 Rosonp Bioch2018
3
 17 GO term
29 Apr 2018 13:41 Rosonp Bioch2018
2
 9 Toujours de GO-terms avec INTERPRO séquence 1
27 Apr 2018 16:50 Rosonp Bioch2018
2
 13 Pas de GO-terms
2 Apr 2017 16:47 ClaraSophie Bioch2017
1
 11 Fiche interpro supprimée
8 Nov 2016 14:57 estana BioCell2016
2
 28 dommaines protéiques
45
 Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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21 May 2019 18:52 DebB L3-PGF-CTES-2018
3
 28 Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
 6 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
 32 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
 43 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
 100 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
 50 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
 40 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
 60 pas de domaines structuraux sur interpro
16 Feb 2011 20:00 L3CharlotteAure Biochimie 2011
4
 137 Fonctions moléculaires, processus biologiques et taxonomie
17 Dec 2010 18:04 MELO BioCell2010
2
 52 Processus Biologique
46
 Conclusion
[All subjects] 10 last subjects:
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19 May 2019 19:53 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 31 Rickettsiales intruses
7 May 2019 14:25 LAETITIA L3-PGF-CTES-2018
2
 42 manque de place / citation des sources
16 Apr 2019 0:06 DJABER-HOU L3-PGF-CTES-2018
5
 98 Soumision Annotation a l'evaluation
9 Dec 2018 11:54 ChloeB OBEM-2018
3
 50 Pdf
9 May 2015 19:14 LaurieNoemie Bioch2015
1
 13 Nombre de caractère limites de la conclusion
8 May 2015 16:09 FranckLea Bioch2015
2
 31 Poids moléculaire
27 Nov 2012 16:37 matou BioCell2012
1
 50 Oubli du code [A CORRIGER]
19 Apr 2012 10:16 Stellathan Biochimie 2012
2
 35 Symbole de gènes
3 Sep 2009 15:39 Hingamp BioCell 2005
9
 59 test: ignorez SVP
26 Apr 2008 21:25 BNPA Biochimie 2008
1
 25 notation et remarque