Anntathon
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Messages Themes
17
General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
35 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
10 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
9 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
26 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
37 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
73 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
43 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
28 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
61 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
224 Informations de classification taxonomique
83
ORF finding
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
42 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
12 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
10 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
11 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
13 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
7 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
8 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
2 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
19 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
25 ORF
27
Homolog hunting: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
24 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
23 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
31 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
19 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
14 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
19 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
54 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
17 No homology
3 Jul 2017 18:39 jiaxin PSB2017
1
50 New species found
25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
25 blast
8
Multiple sequence alignements
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
8 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
32 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
22 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
22 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
46 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
18 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
16 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
23 multiple sequnce alignmnt
17
Phylogenetic analysis
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
28 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
26 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
29 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
28 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
20 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
28 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
888 How to get a textual phylogenetic tree?
1
Ontologies (molecular function & biological process)
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
8 ontologies
15
Conserved domains
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
14 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
15 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
11 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
6 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
4 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
3 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
4 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
5 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
13 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
8 Summary of TO78M_5925010.1
15
Conclusion
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
25 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
20 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
16 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
18 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
14 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
5 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
12 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
7 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
12 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
618
Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
21 Apr 2022 14:07 Ma93 L3-PGF-CTES-2021
4
44 choix du groupe d'étude
14 Apr 2022 9:10 Laurence L3-PGF-CTES-2021
2
33 soumission séquence - passage de Annotation I à Corrrection I
17 Mar 2022 12:29 test_2022 Bioch2022
1
21 Test
17 Mar 2022 12:24 B_Wirth_22 Bioch2022
2
19 Test
14 Mar 2022 17:09 MarinePapot L3-PGF-CTES-2021
7
118 NCBI Blast : bouton Reformat, autre option?
4 Sep 2021 18:47 C_Petitjean_21 Bristol-2021
1
14 General questions
16 Aug 2021 16:31 C_test Bristol-2021
3
47 Test
8 Apr 2021 16:03 CHI L3-PGF-CTES-2020
3
57 diagramme des ORFs détecters
31 Mar 2021 10:43 Meglecz20CTES L3-PGF-CTES-2020
3
120 Grille d’évaluation, rédaction de rapport
30 Mar 2021 9:48 B_Wirth_etu Bioch2021
2
50 Test
410
Recherche d'ORF
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
15 Apr 2022 15:43 miyuka Bioch2022
4
36 Choix de l'ORF KNOWN
14 Apr 2022 15:34 AshleyRusso L3-PGF-CTES-2021
2
23 ORF codant ? Pertinent pour annotation ?
11 Apr 2022 15:32 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021
3
45 choix de l'ORF
9 Apr 2022 13:57 mongeoussada Bioch2022
4
52 ORF complet ou incomplet
2 Apr 2022 18:00 Faiznaleann Bioch2022
1
12 choix de l'ORF
31 Mar 2022 14:13 Emilie20 L3-PGF-CTES-2021
2
34 Recherche Faux Positif
30 Mar 2022 14:16 MaeBinaud L3-PGF-CTES-2021
5
96 ORF complet ou non
11 Mar 2022 18:40 AgatheB L3-PGF-CTES-2021
7
146 Erreur codon stop
9 Mar 2022 10:41 MarinePapot L3-PGF-CTES-2021
6
103 fin ORF
6 Mar 2022 14:20 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021
5
95 questions sur sequence + diagramme
693
Recherche d'homologues: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
24 Apr 2022 19:14 PLQE Bioch2022
2
25 Comment connaitre la e-value seuil ?
21 Apr 2022 17:29 AurelieB L3-PGF-CTES-2021
5
66 Choix groupe d'étude et groupe extérieur
19 Apr 2022 20:00 Emilie20 L3-PGF-CTES-2021
3
39 Choix groupe d'étude_Phylum non classifié
18 Apr 2022 16:15 AshleyRusso L3-PGF-CTES-2021
2
17 Gene Ontology et synonyme
13 Apr 2022 13:17 Anissa L3-PGF-CTES-2021
2
16 autres ORF possibles sur blast x
12 Apr 2022 14:34 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021
5
65 choix séquences groupe d'étude / extérieur
4 Apr 2022 9:38 soleneA L3-PGF-CTES-2021
4
68 Problemes de choix du groupe exterieur pour l'etude et questions sur l'arbre
31 Mar 2022 16:48 MaeBinaud L3-PGF-CTES-2021
4
60 Définition de la fonction d'un ORF
30 Mar 2022 8:26 soleneA L3-PGF-CTES-2021
2
34 Groupe d'etude et groupe exterieur
28 Mar 2022 21:03 maellejarnoux L3-PGF-CTES-2021
2
29 Choix de l'e-valeur seuil
313
Alignement multiple: CLUSTALW
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
28 Apr 2022 11:41 B_Wirth_22 Bioch2022
1
11 Nombre d'aa manquants aux extrémités : /Blast et /clustalW
21 Apr 2022 15:08 SofiaOuarriche L3-PGF-CTES-2021
2
24 annalyse de l'orf
13 Apr 2022 11:32 soleneA L3-PGF-CTES-2021
2
29 Nombre de gap internes
12 Apr 2022 18:34 Anna L3-PGF-CTES-2021
4
55 Pourcentage identité faible dans l'alignement
5 Apr 2022 14:35 MaeBinaud L3-PGF-CTES-2021
4
72 Choix du groupe d'étude et du groupe extérieur
1 Apr 2022 17:13 maellejarnoux L3-PGF-CTES-2021
5
75 Choix du groupe d'étude
20 Oct 2021 10:28 Benameur L3-PGF-2021
2
32 SITE D INSERTION FCS
20 Oct 2021 10:17 Rahma L3-PGF-2021
2
27 FCS
19 Oct 2021 21:02 Soline1 L3-PGF-2021
2
26 MSA insertion FCS
19 Oct 2021 20:47 CHANGKE L3-PGF-2021
1
13 FCS dans certains CoV
892
Analyse phylogénétique
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
28 May 2022 19:08 Anissa L3-PGF-CTES-2021
2
9 modification arbre et analyse
24 Apr 2022 20:57 SofiaOuarriche L3-PGF-CTES-2021
2
20 enracinement de l'arbre
24 Apr 2022 14:48 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021
1
10 appartenance de la séquence étudiée
23 Apr 2022 20:46 SofiaOuarriche L3-PGF-CTES-2021
6
62 choix de groupe d'étude
23 Apr 2022 18:16 AshleyRusso L3-PGF-CTES-2021
3
36 Arbre erroné et choix de groupes
22 Apr 2022 9:50 Emilie20 L3-PGF-CTES-2021
3
42 Séquences et conclusion
21 Apr 2022 16:44 AgatheB L3-PGF-CTES-2021
2
24 Séquence groupe extérieur mal placée
19 Apr 2022 16:42 AshleyRusso L3-PGF-CTES-2021
4
53 Choix groupe d'étude et extérieur
19 Apr 2022 13:52 ClementineC L3-PGF-CTES-2021
4
58 Groupe d'étude dispersé dans l'arbre
18 Apr 2022 23:04 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021
2
26 couleur arbre phylo
151
Domaines conservés: INTERPRO
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
1 May 2022 17:41 SRSM Bioch2022
2
7 Choix du domaine
11 Apr 2022 23:00 Sylia Bioch2022
3
33 Domaine protéique non conservé dans la famille
26 Mar 2022 12:10 mongeoussada Bioch2022
2
30 Choix du domaine retenu
13 Oct 2021 20:01 ilonaMi Master-Mer-2021
3
29 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:57 ilonaMi Master-Mer-2021
1
6 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:56 ilonaMi Master-Mer-2021
1
7 Choix du profil Interpro pour table 2
4 Oct 2021 18:16 emmaRO Master-Mer-2021
2
29 Domaines protéiques à annoter
27 Sep 2021 17:42 Thibault_A Master-Mer-2021
2
30 Domaines protéiques INTERPRO
20 Sep 2021 11:15 ilonaMi Master-Mer-2021
2
30 Base de données
26 Nov 2020 15:11 c18015311 Master-Mer-2020
5
51 Choix des domaines retenus
50
Fonctions moléculaires & Processus biologiques
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
29 Apr 2022 11:21 Faiznaleann Bioch2022
4
27 Contradiction
28 Apr 2022 10:37 B_Wirth_22 Bioch2022
1
11 Choix du Processus biologique
21 May 2019 18:52 DebB L3-PGF-CTES-2018
3
49 Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
13 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
44 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
58 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
136 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
54 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
61 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
66 pas de domaines structuraux sur interpro
103
Conclusion
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
28 Apr 2022 10:51 B_Wirth_22 Bioch2022
1
10 Nombre de caractères attendus
19 Apr 2022 12:50 MaeBinaud L3-PGF-CTES-2021
5
80 Début de l'ORF
14 May 2021 13:09 Belmont L3-PGF-CTES-2020
2
30 Homologue
13 May 2021 16:03 sterna L3-PGF-CTES-2020
2
48 nombres d'homologues
5 May 2021 17:01 Fatima L3-PGF-CTES-2020
4
64 Le nombre élevé des hits d'eucaryotes
18 Apr 2021 12:19 esther L3-PGF-CTES-2020
4
110 problème
30 Mar 2021 14:51 Benjii936 L3-PGF-CTES-2020
2
63 aide
19 Nov 2020 11:32 ChaDev Master-Mer-2020
4
72 Correction
18 Nov 2020 16:43 ChaDev Master-Mer-2020
2
13 OGA
18 Nov 2020 16:37 ChaDev Master-Mer-2020
3
33 OGA