Anntathon
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français
Messages Themes
17
 General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
[All subjects] 10 last subjects:
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20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
 33 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
 9 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
 9 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
 25 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
 36 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
 70 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
 43 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
 28 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
 61 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
 215 Informations de classification taxonomique
83
 ORF finding
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
 37 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
 9 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
 6 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
 9 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
 12 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
 6 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
 8 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
 2 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
 19 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
 24 ORF
27
 Homolog hunting: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
 18 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
 20 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
 28 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
 18 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
 12 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
 17 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
 52 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
 16 No homology
3 Jul 2017 18:39 jiaxin PSB2017
1
 49 New species found
25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
 21 blast
8
 Multiple sequence alignements
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
 5 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
 29 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
 22 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 21 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
 40 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
 17 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 16 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
 20 multiple sequnce alignmnt
17
 Phylogenetic analysis
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
 24 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 25 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
 28 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 24 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
 19 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
 27 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
 843 How to get a textual phylogenetic tree?
1
 Ontologies (molecular function & biological process)
[All subjects] 10 last subjects:
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25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
 6 ontologies
15
 Conserved domains
[All subjects] 10 last subjects:
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24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
 13 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
 10 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
 7 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
 5 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
 4 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
 3 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
 3 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
 5 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
 10 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
 8 Summary of TO78M_5925010.1
15
 Conclusion
[All subjects] 10 last subjects:
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21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
 25 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
 19 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
 13 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
 18 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
 13 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
 5 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
 9 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
 4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
 6 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
 12 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
602
 Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
4 Sep 2021 18:47 C_Petitjean_21 Bristol-2021
1
 14 General questions
16 Aug 2021 16:31 C_test Bristol-2021
3
 47 Test
8 Apr 2021 16:03 CHI L3-PGF-CTES-2020
3
 54 diagramme des ORFs détecters
31 Mar 2021 10:43 Meglecz20CTES L3-PGF-CTES-2020
3
 99 Grille d’évaluation, rédaction de rapport
30 Mar 2021 9:48 B_Wirth_etu Bioch2021
2
 48 Test
29 Mar 2021 17:00 A_Quaiser_21 OBI_2021
1
 35 pas de OBI/BIM cette semaine
29 Mar 2021 10:15 S_TEMPEL_WUT_21 WutAMU2021
2
 74 Email de Sebastien Tempel
22 Mar 2021 8:20 Meglecz20CTES L3-PGF-CTES-2020
3
 65 Important! BDD refseq_protein vs. NR
22 Dec 2020 0:08 isnaem BioCell2020
1
 19 Fragmant à évaluer
2 Dec 2020 11:37 TheoRayane M1_Orsay_2020
1
 8 BLAST taxonomic report
371
 Recherche d'ORF
[All subjects] 10 last subjects:
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22 Apr 2021 11:59 MUTABAZI Brazza21
1
 5 ORF
13 Apr 2021 14:33 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
4
 62 Codon stop
11 Apr 2021 16:43 esther L3-PGF-CTES-2020
4
 42 POYPEPTIDE SIZE
1 Apr 2021 15:09 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
4
 76 Homologues
23 Mar 2021 21:31 Hope L3-PGF-CTES-2020
2
 54 Choix de l'orf
22 Mar 2021 12:05 AlexTom L3-PGF-CTES-2020
5
 73 Problème de résultat comparatif sur ORF SMS et NCBI
21 Mar 2021 17:05 lea19 L3-PGF-CTES-2020
2
 36 compréhension des pourcentages d'identités
21 Mar 2021 15:27 AlexTom L3-PGF-CTES-2020
3
 46 NCBI utilisation
21 Mar 2021 14:49 Julien051 L3-PGF-CTES-2020
4
 88 <50% d'identité et hypothetic protein
21 Mar 2021 10:58 Julien051 L3-PGF-CTES-2020
4
 75 Codon STOP dans la séquence.
648
 Recherche d'homologues: BLAST
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
6 Aug 2021 0:15 johanna24 L3-PGF-CTES-2020
2
 5 determiner la fonction de orf avec GO
17 May 2021 20:29 Fatima L3-PGF-CTES-2020
2
 22 E-valeurs très hautes dans swissprot
15 May 2021 17:35 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
3
 29 Lien entre fonctions
14 May 2021 15:04 lea19 L3-PGF-CTES-2020
2
 25 e valeur seuil
14 May 2021 14:30 Benjii936 L3-PGF-CTES-2020
2
 20 correction que je ne comprends pas
27 Apr 2021 18:54 B_Wirth_21 Bioch2021
1
 8 Pb TaxReport - Sélection des séq - Gblocks : Pb Réglé !
21 Apr 2021 2:07 tova L3-PGF-CTES-2020
6
 94 questions à propos de détermination de fonctions
19 Apr 2021 14:03 CHI L3-PGF-CTES-2020
3
 29 Aucune homologie trouvée pour la recherche Swissport
16 Apr 2021 13:38 rachel L3-PGF-CTES-2020
2
 38 e value et identité
16 Apr 2021 13:22 rachel L3-PGF-CTES-2020
5
 38 pourcentage d'identité
295
 Alignement multiple: CLUSTALW
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
20 Oct 2021 10:28 Benameur L3-PGF-2021
2
 26 SITE D INSERTION FCS
20 Oct 2021 10:17 Rahma L3-PGF-2021
2
 25 FCS
19 Oct 2021 21:02 Soline1 L3-PGF-2021
2
 24 MSA insertion FCS
19 Oct 2021 20:47 CHANGKE L3-PGF-2021
1
 12 FCS dans certains CoV
19 Oct 2021 19:08 Lucas17 L3-PGF-2021
1
 15 FCS
19 Oct 2021 17:20 JulietteR L3-PGF-2021
1
 14 MSA de RdRP
19 Oct 2021 16:16 manonmtz30 L3-PGF-2021
1
 15 MSA de RdRP sous format Gblocks montrant conversation des acides aminés
18 Oct 2021 23:57 thibaultbrunet L3-PGF-2021
1
 14 MSA de RdRp illustrant les acides aminées conservées
18 Oct 2021 23:20 manonmtz30 L3-PGF-2021
2
 27 MSA de spike montrant l'insertion de FCS dans SC2
18 Oct 2021 15:04 Ma-thilde L3-PGF-2021
2
 25 Problème d'alignement multiple
819
 Analyse phylogénétique
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
12 Oct 2021 15:51 emmajamon Master-Mer-2021
5
 57 Interprétation des hits dans la phylogénie
16 May 2021 18:04 CHI L3-PGF-CTES-2020
2
 15 Vérifier si une séquence est mal annoté.
16 May 2021 14:52 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
3
 19 Groupe d'étude
11 May 2021 14:50 ElisaM L3-PGF-CTES-2020
4
 39 Newick tree
2 May 2021 22:24 B_Wirth_21 Bioch2021
1
 8 Si PhyML ne fonctionne pas sur Phylogeny.fr
2 May 2021 16:49 MarieLoane Bioch2021
3
 25 pas d'arbre possible
1 May 2021 10:40 Morgane-Zohra Bioch2021
2
 14 Arbre
29 Apr 2021 15:03 MarieLoane Bioch2021
5
 37 recherche du groupe externe
27 Apr 2021 10:36 B_Wirth_21 Bioch2021
1
 9 Incorporation d'Images dans le formulaire Annotathon
25 Apr 2021 18:25 aminaza L3-PGF-CTES-2020
7
 86 arbre
144
 Domaines conservés: INTERPRO
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
13 Oct 2021 20:01 ilonaMi Master-Mer-2021
3
 17 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:57 ilonaMi Master-Mer-2021
1
 4 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:56 ilonaMi Master-Mer-2021
1
 5 Choix du profil Interpro pour table 2
4 Oct 2021 18:16 emmaRO Master-Mer-2021
2
 20 Domaines protéiques à annoter
27 Sep 2021 17:42 Thibault_A Master-Mer-2021
2
 22 Domaines protéiques INTERPRO
20 Sep 2021 11:15 ilonaMi Master-Mer-2021
2
 26 Base de données
26 Nov 2020 15:11 c18015311 Master-Mer-2020
5
 26 Choix des domaines retenus
18 Oct 2020 14:58 ChaDev Master-Mer-2020
2
 16 Fonction biologique
8 Sep 2020 11:57 eugtest BioCell2020
1
 55 pred cdsearch
20 Mar 2020 15:05 bylka Bioch2020
5
 114 analyse de l'arbre et de l'alignement multiple
45
 Fonctions moléculaires & Processus biologiques
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
21 May 2019 18:52 DebB L3-PGF-CTES-2018
3
 34 Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
 10 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
 42 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
 49 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
 115 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
 52 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
 54 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
 60 pas de domaines structuraux sur interpro
16 Feb 2011 20:00 L3CharlotteAure Biochimie 2011
4
 149 Fonctions moléculaires, processus biologiques et taxonomie
17 Dec 2010 18:04 MELO BioCell2010
2
 56 Processus Biologique
97
 Conclusion
[All subjects] 10 last subjects:
Messages Readers Subject
14 May 2021 13:09 Belmont L3-PGF-CTES-2020
2
 20 Homologue
13 May 2021 16:03 sterna L3-PGF-CTES-2020
2
 38 nombres d'homologues
5 May 2021 17:01 Fatima L3-PGF-CTES-2020
4
 52 Le nombre élevé des hits d'eucaryotes
18 Apr 2021 12:19 esther L3-PGF-CTES-2020
4
 86 problème
30 Mar 2021 14:51 Benjii936 L3-PGF-CTES-2020
2
 58 aide
19 Nov 2020 11:32 ChaDev Master-Mer-2020
4
 52 Correction
18 Nov 2020 16:43 ChaDev Master-Mer-2020
2
 11 OGA
18 Nov 2020 16:37 ChaDev Master-Mer-2020
3
 24 OGA
4 Nov 2020 18:50 AnouarBillal PGF-2020
2
 26 Trop de caractère dans notre conclusion
17 Sep 2020 16:44 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
1
 4 remise de l'Annotathon et attente de confirmation de l'heure et du lieu de l'examen