Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: choix du groupe d'étude et du groupe extèrieur

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choix du groupe d'étude et du groupe extèrieur
RAJESS
19 Apr 2009 20:32
Contribution non évaluée
Bonsoir,
Malgrès avoir lu les règles du jeu, la FAQ et le forum je n'arrive pas à définir le groupe d'étude et le groupe extèrieur. Mon meilleur score est 367 pour un a-protéobactérie et j'obtient des bons scores (environ 100) pour les autres protéobactéries ainsi que pour d'autres espèces bactériennes. Est ce que cela serai correcte de prendre comme groupe d'étude les a-protéobactérie et comme groupe extèrieur les autres protéobactéries?

En vous remerciant d'avance
Meglecz09
20 Apr 2009 17:57
Maître de jeu
Bonjour,

Votre choix me semble bien comme premier essai. Néanmoins si votre ORF ne s'intègre pas bien parmi les alpha protéobactérie, vous devriez élargir votre groupe d'étude.

Cordialement,

Emese Meglecz