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Forum: Recherche d'homologues: BLAST

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Messages Readers Subject
21 Apr 2017 11:31 Vincent-Marine Bioch2017
5
30 Rapport taxonomique
10 Apr 2017 20:20 Alccio Bioch2017
8
56 E-valeur seuil
2 Apr 2017 12:44 Yasmine_Alexey Bioch2017
3
13 Comment c'est possible?
4 Jan 2017 9:30 WaitndSee AMIG2017
1
11 Significant alignments
8 Nov 2016 15:34 Laury BioCell2016
2
29 E value seuil et homologue distant
3 Feb 2016 21:35 AngB_HuaR AMIG2016
2
25 Choix de la e-value seuil
28 Jan 2016 13:47 P_Hingamp_16 Bioch2016
2
24 Abandon de l'annotation des séquences qui sont >95% identiques
3 Nov 2015 16:48 Pilgrim BioCell2015
5
117 Choix d'une e-value seuil
28 Oct 2015 15:38 RosnetRosellini BioCell2015
6
97 2 Blast très intéressant pour 2 ORF
5 May 2015 11:11 LaurieNoemie Bioch2015
2
25 Recherche de la valeur seuil
28 Apr 2015 18:22 IrigarayA Bioch2015
2
16 Chevauchements
21 Apr 2015 16:41 LaurieNoemie Bioch2015
2
21 Problèmes pour définir la valeur seuil
13 Apr 2015 19:10 IrigarayA Bioch2015
3
42 Rapport taxonomique
5 Apr 2015 21:07 LaurieNoemie Bioch2015
4
40 Groupe d'étude et extérieur
26 Mar 2015 19:52 FranckLea Bioch2015
2
20 Distribution des HSP
18 Dec 2014 15:39 SoulaNin BioCell2014
2
17 Message pour le correcteur
5 Nov 2014 19:21 Arvel BioCell2014
4
51 Détermination du seuil.
3 Nov 2014 15:16 LB-MN BioCell2014
2
24 Problème dans TaxReport
29 Oct 2014 17:31 louiselisa BioCell2014
2
27 Définition du seuil dans NR
28 Oct 2014 14:29 Minions BioCell2014
2
28 Seuil de e-value
25 Mar 2014 16:44 Alicola AMIG2016
2
46 BLAST non-concluant
25 Mar 2014 13:16 Cecilia_Dubarry AMIG2016
2
48 Choix des groupes d'étude/exterieur
20 May 2012 12:30 nesrine14 Biochimie 2012
2
22 seuil homologues/non homologues
19 May 2012 16:43 gp1DIEUSAERT Biochimie 2012
2
19 BlastX
17 May 2012 19:05 Bonaiti Biochimie 2012
6
94 choix du groupe d'étude
12 May 2012 10:00 meline13 Biochimie 2012
2
25 Rapport taxonomique
6 May 2012 13:45 meline13 Biochimie 2012
2
29 groupe externe groupe d'étude
30 Apr 2012 12:52 GP1-houseaux Biochimie 2012
3
44 Homologues
25 Apr 2012 22:32 lopez_falce AMIG
2
22 BLAST de notre protéine contre nr
18 Apr 2012 23:40 ticettac13 Biochimie 2012
7
118 Problèmes d'homologies et ce qui en découle
31 Mar 2012 17:40 muganic Biochimie 2012
2
38 choix de valeur seuil
27 Mar 2012 12:23 amel-faiza Biochimie 2012
2
31 choix d'un groupe d'étude et groupe exterieur
24 Mar 2012 15:40 amel Biochimie 2012
2
22 séquence codante ou pas ?
24 Mar 2012 10:54 gp1DANGIO Biochimie 2012
2
22 groupes d'étude et groupe externe
23 Mar 2012 13:10 az-com AMIG
2
14 presque pas d'homologues mais une signature mise en évidence
15 Mar 2012 12:46 camardi AMIG
4
24 familles homologues
13 Mar 2012 18:06 nanais AMIG
5
30 Deux fragments protéiques sur une mêm séquence
12 Mar 2012 13:58 amel Biochimie 2012
2
29 Choix des groupes d'études et groupe exterieur
11 Mar 2012 17:18 nanais AMIG
2
16 Comment choisir les homologues ?
5 Mar 2012 18:55 amel-faiza Biochimie 2012
2
39 choix d'un groupe d'étude et exterieur
4 Mar 2012 16:51 Thonsrouge Biochimie 2012
2
29 Suite 'Choix du groupe d'études'
3 Mar 2012 14:44 ticettac13 Biochimie 2012
3
42 Enracinement
2 Mar 2012 1:03 Thonsrouge Biochimie 2012
7
124 Choix du groupe d'études
1 Mar 2012 11:15 DRAMALOVE Biochimie 2012
3
49 Choix d'un groupe externe
27 Feb 2012 16:38 DRAMALOVE Biochimie 2012
4
74 zone de valeur seuil
26 Feb 2012 17:20 CAE Biochimie 2012
5
119 Choix d'un groupe externe
27 Oct 2011 19:04 P_Hingamp_11 BioCell2011
7
526 Une astuce qui vous fera gagner du temps :)
7 May 2011 0:07 Bigbioch Biochimie 2011
2
12 recherche de groupe d'étude et de groupe exterieur
28 Apr 2011 9:38 matir Biochimie 2011
4
28 déterminer le score seuil blastp contre nr?
27 Apr 2011 1:25 lakisemedo Biochimie 2011
5
40 utilisation du blast x et interprétation de ce que l'on y trouve
20 Apr 2011 21:59 reneejenni Biochimie 2011
2
10 Interprétation de la différence du nombre de séquence entre différentes banques environnementales
18 Apr 2011 23:38 reneejenni Biochimie 2011
2
12 Blastx
18 Apr 2011 23:02 reneejenni Biochimie 2011
2
14 Plusieurs séquences avec 100% d'identité, 100% de similitude et 0% de gap
18 Apr 2011 14:47 meljess Biochimie 2011
2
16 pAS d'homologues
30 Mar 2011 19:54 vanedia2 Biochimie 2011
2
21 tblastn ne trouve pas d'homologues
18 Mar 2011 23:36 gp1DRET Biochimie 2011
2
30 Déterminer le score seuil d'homologie
10 Mar 2011 19:31 gp1TEYCHENEY Biochimie 2011
2
38 séquence métagénomique
1 Mar 2011 11:46 MARFE Biochimie 2011
6
115 Détermination de la valeur seuil
25 Feb 2011 16:03 samiahafsoi Biochimie 2011
4
60 alignement multiples
23 Feb 2011 21:03 reneejenni Biochimie 2011
2
33 Une seule séquence homologue
14 Feb 2011 11:05 samiahafsoi Biochimie 2011
2
44 comment faire l'alignement 2 à 2
13 Feb 2011 20:28 omarissem Biochimie 2011
2
44 blastP,blastN
13 Feb 2011 19:24 omarissem Biochimie 2011
9
193 sample env
13 Feb 2011 17:56 samiahafsoi Biochimie 2011
2
41 comment faire le BLAST
5 Feb 2011 7:54 BrothTeam Biochimie 2011
4
96 Pas de séquence homologue à mon ORF trouvées... :(
17 Dec 2010 14:47 FannyFlo BioCell2010
3
66 Utilisation de Swissprot
17 Dec 2010 9:44 FannyFlo BioCell2010
2
49 Homologues - e-value seuil
12 Dec 2010 19:41 samiraophelie BioCell2010
2
72 determination valeur seuil et groupes
9 Nov 2010 11:13 bimisi BioCell2010
2
89 Pas de groupe exterieur
2 May 2010 16:53 leaman Biochimie 2010
2
22 Blastp contre enviro
2 May 2010 11:43 jenmag Biochimie 2010
6
81 détermination du score seuil
1 May 2010 19:45 tdinfo10 Biochimie 2010
2
18 blast p sur environemental
30 Apr 2010 20:21 adecam Biochimie 2010
3
37 recherche du score seuil
23 Apr 2010 11:53 marineoral Biochimie 2010
10
297 choix du des groupes intérieurs et extérieurs
22 Apr 2010 11:45 luminien Biochimie 2010
2
34 peu de séquences homologues
21 Apr 2010 22:54 sofy Biochimie 2010
10
162 Homologues
16 Apr 2010 0:13 christhea Biochimie 2010
2
40 grp exterieur
14 Apr 2010 12:09 K-RoW Biochimie 2010
6
158 Définition du score seuil
14 Apr 2010 11:53 Fabien Biochimie 2010
4
84 Alignement 2 à 2/ seuil
14 Apr 2010 10:42 lad2010 Biochimie 2010
14
420 blast
12 Apr 2010 23:24 oralbre Biochimie 2010
24
656 pas d'homologue
12 Apr 2010 14:59 oralbre Biochimie 2010
10
336 valeur seuil
9 Apr 2010 13:35 MSdu83 Biochimie 2010
4
89 BLASTp contre env_NR
8 Apr 2010 17:28 jenni Biochimie 2010
4
85 seuil
3 Apr 2010 22:49 ameliane Biochimie 2010
5
63 Score tblastn
1 Apr 2010 15:54 vincent Biochimie 2010
10
254 Blast
1 Apr 2010 14:34 vincent Biochimie 2010
3
72 Seuil
14 Dec 2009 15:58 ppbio BioCell2009
2
23 Re : problème d'explication de saut
14 Dec 2009 15:08 ppbio BioCell2009
2
29 Problème d'explication d'un saut sur BLAST
14 Dec 2009 14:38 ASMA BioCell2009
2
25 nbre de hits
8 Dec 2009 15:00 ppbio BioCell2009
2
36 Définition des groupes d'étude et externe
7 Dec 2009 16:04 DamLau BioCell2009
2
37 blastn ou tblastx
26 Nov 2009 14:57 famar BioCell2009
2
44 Groupe extérieur/groupe d'étude
17 Nov 2009 15:45 sonia2hayiri BioCell2009
2
46 problème de définition des homologues
4 Nov 2009 9:24 phytram BioCell2009
2
43 traduction de l'ORF et protéine putative
29 Oct 2009 13:40 NAME BioCell2009
2
53 BLAST pour des séquences de 200 nucléotides
29 Oct 2009 10:56 ASMA BioCell2009
2
59 scores faibles pour blast p nr
23 Oct 2009 14:11 NAME BioCell2009
3
85 E VALUE de 8e-08
22 Oct 2009 11:26 NAME BioCell2009
2
59 Rien dans le BLAST P environnemental
15 May 2009 16:36 sweet Biochimie 2009
1
8 domaine putatif conservé
14 May 2009 21:35 sweet Biochimie 2009
2
13 seuil
12 May 2009 14:58 anacora Biochimie 2009
2
20 swissprot
9 May 2009 9:18 louss_riquet Biochimie 2009
2
32 hit et HSP
3 May 2009 13:45 Poulpe Biochimie 2009
2
30 Problémes avec le Rapport Taxonomique
30 Apr 2009 12:05 louss_riquet Biochimie 2009
2
20 recherche d'homologue
29 Apr 2009 20:38 sweet Biochimie 2009
2
24 probleme de blast et d'analyse phylogénique
26 Apr 2009 17:18 yoshi Biochimie 2009
3
41 Aucun homologue n'est trouvé
20 Apr 2009 22:55 pascaleceline Biochimie 2009
2
35 Détermination du seuil
19 Apr 2009 20:32 RAJESS Biochimie 2009
2
28 choix du groupe d'étude et du groupe extèrieur
10 Apr 2009 17:06 louss_riquet Biochimie 2009
3
38 determination des groupes d'étude et exterieur
3 Apr 2009 11:53 CALAMARS Biochimie 2009
4
86 Score seuil
31 Mar 2009 19:32 anacora Biochimie 2009
2
48 A quoi correspondent les hits?
31 Mar 2009 13:51 Adrien2 Biochimie 2009
2
56 Blast swissprot et nr
30 Mar 2009 16:15 lorguais Biochimie 2009
6
219 Interprétation du résultat
16 Mar 2009 14:18 CALAMARS Biochimie 2009
7
218 choix du groupe extérieur
9 Mar 2009 10:33 Adrien2 Biochimie 2009
6
146 Choix groupe extérieur
16 Dec 2008 10:52 marmoh BioCell2008
1
24 A l'intention de Monsieur Talla
6 Dec 2008 12:03 marmoh BioCell2008
2
38 Message pour monsieur Hingamp
5 Dec 2008 18:33 magorne BioCell2008
2
45 Score seuil Evalue
30 Oct 2008 17:27 alexetmahe BioCell2008
2
96 Score seuil
22 Apr 2008 18:54 nimes Biochimie 2008
2
25 tblastn
22 Apr 2008 18:40 nimes Biochimie 2008
2
26 score seuil
10 Apr 2008 19:28 orus Biochimie 2008
2
34 tblastn
18 Mar 2008 21:09 bioinfo Biochimie 2008
5
163 recherche du score seuil
2 Dec 2007 11:06 delcha BioCell 2007
4
97 groupe(s) extérieur(s)...
30 Nov 2007 17:26 original BioCell 2007
3
54 tblastn contre banque nucléique environnementale
29 Nov 2007 22:04 mavio BioCell 2007
2
48 hypothetical protein
26 Nov 2007 11:37 anabe BioCell 2007
2
55 choix du groupe extérieur
21 Nov 2007 12:36 Hingamp_BC07 BioCell 2007
1
30 Le métagénome marin révèle l'existence de primates microscopiques?
21 Nov 2007 12:03 Marco BioCell 2007
3
383 Probleme au niveau du blast
9 Nov 2007 13:03 Brochier_BC07 BioCell 2007
1
30 Tblastn obtenus sur la banque environnementale nucléique
17 Mar 2007 18:46 nisa Biochimie 2007
4
94 Difficultés rencontrées lors du processus (Blast)