Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: determination des groupes d'étude et exterieur

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determination des groupes d'étude et exterieur
louss_riquet
10 Apr 2009 17:06
Contribution non évaluée
loussouarn margot
riquet élodie

bonjour,
Nous avons un petit problème pour déterminer notre groupe extérieur puisque il nous semble que les scores pour les bactéries et pour les eucaryotes sont relativement proches et élevés. De plus au sein même d'un groupe les scores sont très différents. pourriez vous nous expliquer comment cela est possible?

merci
cordialement
Brochier09
13 Apr 2009 19:56
Maître de jeu
Bonjour,

Ce que vous avez copier/coller dans la case rapport taxonomique n'est pas ce qui est attendu (voir les règles du jeu). Ce que vous avez pris pour des scores sont en fait le nombre de HSP trouvés.

Cordialement,

Céline Brochier

louss_riquet
16 Apr 2009 10:35
Contribution non évaluée
LOUSSOUARN Margot
RIQUET Elodie

Bonjour,

Je viens de comprendre que le blast et le rapport taxonomique, bien que séparé, sont ensemble et donc lorsque dans les règles du jeu et la FAQ vous nous demandez de mettre la partie lineage report du taxonomy report, il faut la mettre dan sle rapport taxonomique et non dans le blast. Je n'avais pas compris cela comme ça d'où mon erreur.
Par contre ma question était posée à paritr des données du lineage report que j'ai copié dans la partie blast. Mais il me semble avoir reglé mon problème.

Merci,

Cordialement,

Loussouarn Margot et Riquet Elodie