Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: Groupe d'étude / Groupe extérieur

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Groupe d'étude / Groupe extérieur
vleonet1
24 Mar 2007 0:06
Contribution non évaluée
Bonsoir, on a un gros soucis concernant le lot 2 !!

On n 'arrive pas à déterminer les groupes d'études et les groupes exterieurs
on a essayé de suivre vos instructions mais nous avons des arbres qui ne signifient rien on a essayé plusieurs stratégies,
mais nous avons un gros soucis car à chaque arbre que nous faisons notre séquence ORF se trouve dans le groupe extèrieur
mais malgrès tout la séquence se retrouve dans nos groupes exterieur on ne comprends pas on a tout essayé:
arbres effectués avec la methode des parcimonie, méthode du neighborn joining, on a meme essayé de faire des arbres à partir de la banque swissprot.

On est desespérée.

Cordialement. Melle Leonetti  
Brochier_B07
24 Mar 2007 8:46
Maître de jeu
Bonjour,
Avant toute chose, regarder le message que Pascal Hingamp a posté le 23 mars concernant l'utilisation du forum.
Votre message n'aurait jamais du être posté (i) en tant que réponse à un message et (ii) dans la rubrique où vous l'aviez mis.
Soyez vigilante car la prochaine fois il sera purement et simplement supprimé du forum !
Ensuite concernant votre question. Il faut impérativement que vous soyez précis !
- Indiquez le numéro réel de votre ORF (c’est à cela que serve les identifiants) sinon comment peut-on savoir de laquelle il s’agit ?
- J’ai regardé vos lots et n’ai pu voire aucun arbre. Donc en absence d’indications plus précises, je suis dans l’impossibilité de vous aider. Vous dites que vous avez des problèmes pour définir groupe d’étude et groupe extérieur… encore faudrait-il que vous nous expliquiez quel groupe extérieur avez-vous défini ? quel groupe interne ? que donne le ou les arbre(s)…
=> Donnez moi plus de précisions pour que je puisse vous répondre
Cordialement
Céline Brochier