Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: détermination des paralogues/orthologues/xénologues

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détermination des paralogues/orthologues/xénologues
tyler
23 Mar 2007 13:59
Contribution non évaluée
Bonjour, nous souhaiterions avoir des précisions sur la méthode de détermination
des organismes orthologues,
paralogues ou xénologues.

Merci d'avance.

Pierre, Alexandre, Clémence
Brochier_B07
24 Mar 2007 8:54
Maître de jeu
Bonjour,
Sont homologues des gènes qui ont une origine évolutive commune. On distingue 3 sortes d'homologues en fonction de l'événement évolutif qui est à l'origine des séquences considérées. Cet événement est ce que vous placez sur l’arbre au niveau du nœud qui correspond à l’origine commune des séquences
Si l’événement est un événement de transfert horizontal => les deux séquences résultantes sont des xénologues
Si l’événement est un événement de duplication (un gène => deux gènes dans un génome) => les deux séquences résultantes sont des paralogues
Si l’événement est un événement de spéciation (deux lignées évolutives d’organismes se séparent) => les deux séquences résultantes sont des orthologues
Pour les schémas je vous renvoie au cours.
Si vous avez besoin de plus de précisions essayez de poser des questions concrètes vis à vis de votre arbre
Cordialement,
Céline Brochier