Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: groupe externe

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groupe externe
levana
23 Nov 2023 20:00
Non evaluated contribution

Bonjour,

 

-Dans mon tableau 4, je trouve les alphaproteobacteries en premier (qui comportent mon groupe d'étude), puis les gamma, les beta, et juste apres il ya encore quelques alphaproteobacteries. Comment ce fait-il ? Et est ce que je les considere comme faisant tt de même partie de mon groupe externe (alphaproteobacteries non-candidatus pelagibacteriales) ? Ca joue pour déterminer la plus faible e value 

-Autre question: De combien d'ordres de grandeur est le differenciel entre 0.0 et une autre E-valeur plus grande (2e-119 par ex) ?

 

Merci,

levana

Meglecz23-4CTES
23 Nov 2023 20:24
Game master

Bonjour,


En effet c’est étrange, mais ne me semble pas très grave dans votre cas.

On affiche l’Evaleur comme 0.0 si c’est plus petite que 1e-182.  Il a donc au moins 38 ordres de grandeur de différence entre les meilleurs hits des premières deux lignes.

 

Bon travail,
Emese Meglecz