Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: Uniprot

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Uniprot
Spoon
20 Nov 2023 13:14
Non evaluated contribution

Bonjour,

J'aimerai savoir s'il est normal qu'en utilisant Uniprot avec le BDD UniRef90, la page affichée me dit qu'il n'y a pas des résultats...

 

 

 

 

Merci ,

Cordialement

Sarah Spingarn 

Meglecz23-4CTES
20 Nov 2023 17:19
Game master

Bonjour, 


ça dépend. Si vous faites un BLAST dans NCBI et vous avec des résultats, vous devrez obtenir des résultats aussi dans UniRef90 aussi. Si vous testez un ORF qui est faux positive, c’est normal.


Bon travail,
Emese Meglecz

 

Spoon
20 Nov 2023 17:54
Non evaluated contribution

Merci pour votre réponse. 

Et combien de hits doit-on séléctionner dans Uniprot étant donné qu'on peut en choisir seulement jusqu'à 1000 ?

Merci beaucoup,

Bonne soirée. 

Meglecz23-4CTES
20 Nov 2023 18:02
Game master

1000

J'ai testé votre ORF, ça marche.