Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: Enracinement de l'arbre

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Enracinement de l'arbre
Varly
23 May 2023 22:37
Contribution non évaluée

 

 

Bonjour,

Voici ma  version ameliore de mon arbre :

Après de nombreuses tentatives, je me demande si mon arbre est optimal? . Est-ce que sa construction est optimale ou devrais-je l'améliorer avant de passer a la suite  ?

Merci pour votre retour.

Cordialement 

 

Meglecz23CTES
24 May 2023 8:39
Maître de jeu

Bonjour,


Dans l’arbre actuel, la racine ne sépare pas le groupe d’étude et le groupe extérieur. Donc l’arbre n’est pas bien enraciné.
Trouvez le nœud qui est l’ancêtre le plus récent des Pelagibacterales, et identifiez les deux branches qui en descendent. Prenez une séquence de chacune de ces branches pour que l’outil newick tree manipulation puisse placer la racine correctement.


Bon travail,
Emese Meglecz