Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: phylogeny.fr --> format newick incomplet

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phylogeny.fr --> format newick incomplet
ivan-fay
9 May 2023 23:00
Contribution non évaluée

Bonjour,

 

Je suis en train d'essayer de revoir mon groupe d'étude et mon groupe extérieur.
Cette fois mon groupe d'étude est Bacteria;Proteobacteria;Alphaproteobacteria;Pelagibacterales

Le groupe externe est tout les alphaproteobacteria sauf les non-pelagibacterales

Le probleme est que phylogeny.fr coupe les informations y compris dans le format newick et s'arrete à alphaproteobacteria ...

 

Pouvez vous m'aider? Je vous ai mis des capture d'écran pour essayer de vous expliquer...j'espère que se sera clair

 

merci 

 

ci-dessous l'arbre sur phylogeny.fr 

 

puis le format newick:

 

 

 

le problème est que je ne peux pas travaillé avec l'arbre que j'obtiens (je n'ai pas les infos) manque les groupe aprés alphaproteobacteria:

 

 

 

 

 

Phylogeny.fr fournit une table pour les taxons mais ne les intègre pas dans le format newick ..: