Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: Qu'un ordre par classe de protéobactérie

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Qu'un ordre par classe de protéobactérie
Printemps2023
13 Apr 2023 17:34
Contribution non évaluée

Bonjour

 

J'obtiens qu'un ordre pour chacune des classes de protéobactérie, est-ce problématique pour réaliser mon arbre phylogénétique ? 

 

Taxonomy synthesis table

Classification nb lines nb hits min E-value max E-value max Score min Score
LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Alphaproteobacteria 2101 8635 2e-143 3e-56 431 202
LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Gammaproteobacteria 54 122 3e-123 2e-56 380 203
LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Betaproteobacteria 2 5 9e-90 4e-63 292 221
LUCA:Bacteria:Cyanobacteria:Cyanophyceae 1 2 2e-78 2e-78 248 248
LUCA:Bacteria:Thermodesulfobacteria:Desulfobacteria 5 8 9e-69 1e-56 236 203
LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Actinobacteria 2 4 2e-63 8e-58 222 206
LUCA:Eukaryota:Metazoa:Chordata

 

 

Poutant il y avait beaucoup de résiultats pour BLAST Taxonomic Report (5000 hits analysed).....

 

Merci d'avance,

 

 

Printemps2023
13 Apr 2023 17:59
Contribution non évaluée

J'ai trouvé, il y a tout simplement un réglage pour lister plus d'ordres il suffit de cliquer sur '5 Family' dans l'outil taxonomy synthesis. 

 

Si cela peut être utile à d'ordres personnes ...

Meglecz23CTES
14 Apr 2023 7:46
Maître de jeu

Oui. C'est ça. Merci d'avoir partagé l'info!