Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: SOS

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SOS
marmoh
20 Nov 2008 14:01
Contribution: Pertinent
Bonjour,
Nous n'arrivons pas à utiliser la méthode de parcimony pour faire notre arbre. En effet le lien Phylip/Parcimonie à Infobiogen ne marche pas.
Comment faire la méthode par parcimony alors?
Merci par avance
Mohamed Belhocine et Marion Leblanc (binôme: marmoh)

Herrmann_BC08
20 Nov 2008 14:13
Maître de jeu
Bonjour,

utilisez donc le site http://www.phylogeny.fr/phylo_cgi/alacarte.cgi , comme indiqué dans les règles du jeu, pour faire l'arbre par parcimonie; choisissez "à la carte" dans l'onglet Phylogeny analysis, décochez "Multiple alignment" et "Visualization...", choisissez step by step, puis choisissez ProtPars/DnaPars ou ProtDist/DnaDist-Neighbor ; puis copier-collez votre alignement multiple dans la fenêtre suivante.

Voilà!