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Thread subject: (Quand) faut-il indiquer le "vrai" start de l'ORF ?

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(Quand) faut-il indiquer le "vrai" start de l'ORF ?
AnaisE
19 Mar 2021 0:47
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Bonjour,

 

Si l'on déduit de manière claire grâce aux alignements BLAST initiaux où commence réellement notre ORF, peut-on déjà le prendre en compte, ou doit-on faire toute l'analyse avec notre ORF trop long et indiquer cela seulement dans la conclusion ?

 

Je pense notamment à la case "début d'ORF", où je ne sais pas s'il vaut mieux indiquer le début réel (45 dans mon cas) ou hypothétique (30 dans mon cas) :

 

 

Merci pour votre aide.

Meglecz20CTES
19 Mar 2021 12:42
Game master

Bonjour Anaïs,


Il est préférable à faire les analyses avec l’ORF un peu trop long au début et rectifier la position de début à l’alignement multiple. À ce moment vous pouvez faire référence à vos observations de BLAST.


Bon travail,
Emese Meglecz

 

AnaisE
19 Mar 2021 13:58
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D'accord, merci beaucoup.