Forum: Recherche d'ORF

Messages Readers Subject 29 May 2023 17:06 princesses WutAMU2023 1 4 Modifier la classification de ORF2 13 Apr 2023 15:07 Printemps2023 L3-PGF-CTES-2023 4 36 statut 3' incomplet 30 Mar 2023 20:05 Varly L3-PGF-CTES-2023 2 22 ORf 12 Mar 2023 19:35 noapardo L3-PGF-CTES-2023 4 48 Choix d'ORF 27 Feb 2023 18:33 noapardo L3-PGF-CTES-2023 2 34 Determiner les ORF individuellement 21 Feb 2023 19:24 retenodus L3-PGF-CTES-2023 3 52 ORF non complet / classification 30 Jan 2023 10:27 Veronica L3-PGF-CTES-2023 3 48 ORFs sans homologue sur Swiss Prot 30 Jan 2023 10:18 Veronica L3-PGF-CTES-2023 3 66 Choix ORFs 16 Oct 2022 19:47 Lesboss BioCell2022 1 42 diagramme orf 5 Oct 2022 15:17 LILYROSEPGF L3-PGF-2022 2 36 Gènes absents 15 Apr 2022 15:43 miyuka Bioch2022 4 40 Choix de l'ORF KNOWN 14 Apr 2022 15:34 AshleyRusso L3-PGF-CTES-2021 2 29 ORF codant ? Pertinent pour annotation ? 11 Apr 2022 15:32 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021 3 45 choix de l'ORF 9 Apr 2022 13:57 mongeoussada Bioch2022 4 60 ORF complet ou incomplet 2 Apr 2022 18:00 Faiznaleann Bioch2022 1 12 choix de l'ORF 31 Mar 2022 14:13 Emilie20 L3-PGF-CTES-2021 2 34 Recherche Faux Positif 30 Mar 2022 14:16 MaeBinaud L3-PGF-CTES-2021 5 111 ORF complet ou non 11 Mar 2022 18:40 AgatheB L3-PGF-CTES-2021 7 148 Erreur codon stop 9 Mar 2022 10:41 MarinePapot L3-PGF-CTES-2021 6 121 fin ORF 6 Mar 2022 14:20 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021 5 95 questions sur sequence + diagramme 22 Apr 2021 11:59 MUTABAZI Brazza21 1 7 ORF 13 Apr 2021 14:33 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020 4 74 Codon stop 11 Apr 2021 16:43 esther L3-PGF-CTES-2020 4 42 POYPEPTIDE SIZE 1 Apr 2021 15:09 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020 4 84 Homologues 23 Mar 2021 21:31 Hope L3-PGF-CTES-2020 2 58 Choix de l'orf 22 Mar 2021 12:05 AlexTom L3-PGF-CTES-2020 5 78 Problème de résultat comparatif sur ORF SMS et NCBI 21 Mar 2021 17:05 lea19 L3-PGF-CTES-2020 2 38 compréhension des pourcentages d'identités 21 Mar 2021 15:27 AlexTom L3-PGF-CTES-2020 3 46 NCBI utilisation 21 Mar 2021 14:49 Julien051 L3-PGF-CTES-2020 4 92 <50% d'identité et hypothetic protein 21 Mar 2021 10:58 Julien051 L3-PGF-CTES-2020 4 87 Codon STOP dans la séquence. 20 Mar 2021 16:14 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020 5 82 Fonction 19 Mar 2021 0:47 AnaisE L3-PGF-CTES-2020 3 40 (Quand) faut-il indiquer le "vrai" start de l'ORF ? 18 Mar 2021 10:15 ElisaM L3-PGF-CTES-2020 9 155 Choix ORF 18 Mar 2021 9:22 aminaza L3-PGF-CTES-2020 7 87 OFR 16 Mar 2021 21:59 AnaisE L3-PGF-CTES-2020 4 64 ORF complet ou incomplet ? Position du dernier nucléotide. 16 Mar 2021 10:27 Meglecz20CTES L3-PGF-CTES-2020 1 15 Choix de l’outil ORFinder 5 Mar 2021 11:23 Fatima L3-PGF-CTES-2020 4 59 ORF Finder results 5 Mar 2021 11:05 pierre_gerenton BISM21 2 38 ORF sans codon d'initiation 5 Mar 2021 11:03 Fatima L3-PGF-CTES-2020 3 40 ORF Finder results 4 Mar 2021 16:59 sterna L3-PGF-CTES-2020 2 36 ORF KNOWN ou NOVEL 4 Jan 2021 15:41 Meglecz20CTES L3-PGF-CTES-2020 6 92 test 21 Dec 2020 16:55 Team_IUT UCA_20_21 1 33 ORF 26 Nov 2020 17:07 Emistien UCA_20_21 1 58 ORFs 18 Nov 2020 15:54 NoelGrafenstein M1_Orsay_2020 2 23 Chevauchement alors que même fonctions chez homologue ? 12 Nov 2020 14:43 ammarweng M1_Orsay_2020 2 20 Nombre différent de résultats dans la recherche d'ORF avec SMS et NCBI 4 Nov 2020 19:09 NoelGrafenstein M1_Orsay_2020 2 24 Question 4 Nov 2020 17:14 BOUTAMAGAN M1_Orsay_2020 1 16 Résultat première recherche d'ORF 4 Nov 2020 16:27 sana-jiaying M1_Orsay_2020 3 48 Recherche d'ORF 18 Oct 2020 12:36 ChaDev Master-Mer-2020 12 168 Analyse des résultats 23 Aug 2020 12:18 mrsingh L3-PGF-CTES-2019 5 100 Résultats bruts 14 Aug 2020 8:51 mrsingh L3-PGF-CTES-2019 6 12 Bonjour Mme Meclecz, Je souhaiterai vous identifier des séquences ORF 14 Aug 2020 8:44 mrsingh L3-PGF-CTES-2019 2 4 Bonjour Mme Meclecz, 16 Apr 2020 17:43 AgnesB L3-PGF-CTES-2019 5 52 Taux dimilarité>90% mais protéine hypothétique 16 Apr 2020 17:34 AgnesB L3-PGF-CTES-2019 6 76 Pas de codon START 20 Mar 2020 12:02 ouno Bioch2020 4 85 Poids Moleculaire 20 Nov 2019 12:44 anloiret UCA_19_20 1 45 1ère analyse 23 Oct 2019 12:45 carand0224 UCA_19_20 1 47 1ère analyse 23 Oct 2019 9:02 Mars UCA_19_20 1 47 ORFFinder 15 Apr 2019 10:04 sheina L3-PGF-CTES-2018 3 54 Choix final 14 Apr 2019 20:40 sheina L3-PGF-CTES-2018 3 30 Cas particulier 11 Apr 2019 11:25 sheina L3-PGF-CTES-2018 3 28 Nombre à virgule 9 Apr 2019 13:42 sheina L3-PGF-CTES-2018 9 142 plus explications 9 Apr 2019 13:41 sheina L3-PGF-CTES-2018 1 13 plus explications 8 Apr 2019 21:56 sheina L3-PGF-CTES-2018 3 48 Ai-je bien compris? 8 Apr 2019 15:06 DebB L3-PGF-CTES-2018 2 22 Message ERROR 6 Apr 2019 19:41 Leacauchois18 L3-PGF-CTES-2018 2 31 l'ORF contient un codon STOP 5 Apr 2019 13:58 DJABER-HOU L3-PGF-CTES-2018 3 46 Lecture du séquençage indirect 17 Mar 2019 14:52 teamNN Bioch2019 1 31 problème ORF Novel ou ORF Faux positif 18 Oct 2018 10:17 matali2018 UCA_2018 2 124 Recherche ORF 18 Oct 2018 10:17 matali2018 UCA_2018 1 57 Recherche ORF 26 Apr 2018 12:52 Rosonp Bioch2018 3 36 INTERPRO problème - sélection de séquences 20 Mar 2018 15:24 Rosonp Bioch2018 4 148 Choix de l'ORF, codon d'initiation 14 Feb 2018 19:29 GRP1_HEURTEL BISM2018 4 140 Quels ORFs à mettre dans le tableau d'illustration 6 Nov 2017 16:10 Anonymous01 BioCell2017 2 102 Erreur de copier/coller 14 May 2017 19:19 ClaraSophie Bioch2017 2 35 Cours Annotation Génome 28 Feb 2017 13:56 lasserve_aitou UCA_2016 1 74 ORF FINDER 31 Jan 2017 16:19 ClaraSophie Bioch2017 3 211 Search of ORF 3 Nov 2016 11:53 Bio3 BioCell2016 4 84 2 OFR avec des homologues 18 Nov 2015 14:46 lun BioCell2015 2 29 problème d'ORF 24 Oct 2015 14:53 JuSzLuCi BioCell2015 4 122 ORF en sens indirecte prennant la totalité de la séquence. 10 Apr 2015 19:45 M_LIinot OBI 3 54 ORF bizares ;) 30 Mar 2015 18:05 tuxx Bioch2015 1 13 Question 5 Nov 2014 17:38 genouxcagneux BioCell2014 2 37 Recherche d'ORF avec atg, gtg, ctg, ttg 5 Oct 2014 9:38 MarvinOstagh BioCell2014 2 82 choix de L'ORF 11 May 2012 10:33 SoMe Biochimie 2012 5 90 Choix de l'ORF 10 Apr 2012 17:37 jash AMIG 5 95 Séquence non codante mais grand ORF 29 Feb 2012 19:47 win_mel Biochimie 2012 3 81 Choix de l'ORF 22 Apr 2011 1:36 bach Biochimie 2011 2 25 Taille de l'orf 7 Apr 2011 10:39 matir Biochimie 2011 1 18 choix ORF! 6 Apr 2011 18:01 matir Biochimie 2011 5 86 choix d'ORF 4 Apr 2011 0:21 reneejenni Biochimie 2011 2 30 Correction de l'ORF sélectionné lors de la première annotation 25 Mar 2011 15:56 BrothTeam Biochimie 2011 2 33 Long ORF, mais pas d'homologues 1 Mar 2011 10:49 reneejenni Biochimie 2011 7 341 Analyse de résultats sur les ORF signicatifs ou insignifiants 1 Mar 2011 8:21 gp2PESENTI Biochimie 2011 2 48 Traduction par l\'annotathon surprenante 16 Feb 2011 22:20 BrothTeam Biochimie 2011 2 42 Filtre ORF Finder NCBI 15 Feb 2011 22:11 reneejenni Biochimie 2011 2 63 Problême avec "any codon" par rapport à la grille d'évaluation 13 Feb 2011 11:19 matir Biochimie 2011 8 194 peut on utiliser Expasy pour chercher les ORF? 8 Feb 2011 19:00 meljess Biochimie 2011 2 65 Détermination des ORF 8 Feb 2011 12:50 BrothTeam Biochimie 2011 2 39 "Pas de superposition d'ORF possibles"... 7 Feb 2011 21:06 BrothTeam Biochimie 2011 5 125 ORF sur plusieurs cadres 7 Feb 2011 16:14 omarissem Biochimie 2011 4 111 ORF Finder ne trouve ni stop ni start 4 Feb 2011 17:23 BrothTeam Biochimie 2011 16 699 [ Warning ] 3' incomplete: following codon is not a STOP 4 Feb 2011 17:00 BrothTeam Biochimie 2011 6 143 Résultats différents avec les 2 types d'ORF finder -> ?? 17 Dec 2010 12:00 MELO BioCell2010 2 40 SMS DNASTAT 4 May 2010 12:43 a20700687 Biochimie 2010 2 36 choix de l'ORF 2 May 2010 16:45 luminien Biochimie 2010 2 36 problème d'interprétation de la position de l'ATG 1 May 2010 20:48 luminien Biochimie 2010 2 17 étude à refaire avec codon atg 18 Apr 2010 20:10 marineoral Biochimie 2010 4 126 recherche d'ATG 8 Apr 2010 13:17 oralbre Biochimie 2010 4 89 ATG 19 Mar 2010 23:23 christhea Biochimie 2010 3 109 poids moleculaires 10 Mar 2010 22:16 dragonballz Biochimie 2010 4 172 Problème au niveau de la recherche d'ORF 2 Dec 2009 11:47 famar BioCell2009 2 56 pas de domaines protéiques 18 Nov 2009 12:13 ipbm BioCell2009 2 42 Nombreux codons stop sur l'ORF. 10 Nov 2009 17:36 NAME BioCell2009 2 56 codon STOP 29 Apr 2009 14:46 CALAMARS Biochimie 2009 2 36 problem pour définir l'orf 29 Apr 2009 14:38 mayanes Biochimie 2009 2 29 problème dans le choix de l'ORF 2 Apr 2009 8:56 warrios Biologie 2009 1 33 recherche ORF sens indirect cadre lecture1,2,3 31 Mar 2009 15:47 Adrien2 Biochimie 2009 3 161 ORF finder : fonctionnement 10 Mar 2009 15:37 lbfm Biochimie 2009 2 58 choix d'ORF 5 Mar 2009 12:10 catnat Biochimie 2009 4 141 ORF sans codon d'initiation et sans codon stop 17 Dec 2008 15:23 chalia BioCell2008 2 48 Poids moléculaire 15 Dec 2008 18:15 ci_co BioCell2008 4 84 Problème pour dénombrer des aa manquants ! 28 Mar 2008 21:38 bioinfo Biochimie 2008 3 93 correction 26 Mar 2008 11:21 meilu Biochimie 2008 2 69 Début D'ORF sans codon d'initiation 1 Dec 2007 16:43 TAMT BioCell 2007 2 144 ORF...??? 30 Nov 2007 17:31 djcorse BioCell 2007 5 150 ORF contient des codon(s) STOP (*)! 29 Nov 2007 10:05 vitalic BioCell 2007 5 215 CODON STOP DANS ORF 24 Nov 2007 15:00 NikOri BioCell 2007 2 60 Problème de choix d'ORF : 2 ORF pertinentes ! 23 Nov 2007 14:57 cheikh BioCell 2007 4 122 any codon ou ATG 22 Nov 2007 20:59 original BioCell 2007 2 67 annotation 1 8 Nov 2007 0:14 emilu BioCell 2007 2 62 pertinence orf 29 Oct 2007 16:02 cheikh BioCell 2007 4 127 CODON STOP 17 Oct 2007 18:24 luluemmy BioCell 2007 3 93 recherche d'orf avec sms 10 Jun 2007 15:58 azerty13 Accès Libre 1 19 recherche d'ORF 23 May 2007 9:29 gwe ESIL biotech 1 9 ORF_GP19890.1 23 May 2007 9:24 hel ESIL biotech 2 21 ORF_CX19900 8 Apr 2007 17:33 mtadjdet Biochimie 2007 1 23 codon stop! 8 Apr 2007 17:32 mtadjdet Biochimie 2007 2 34 codon stop!