Forum "Recherche d'ORF"

Thread subject: Nombre différent de résultats dans la recherche d'ORF avec SMS et NCBI

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Nombre différent de résultats dans la recherche d'ORF avec SMS et NCBI
ammarweng
12 Nov 2020 14:43
Non evaluated contribution

Bonjour,

 

Nous avions une question par rapport à la recherche d'ORF avec SMS et NCBI ORF Finder.

Est-ce normal de ne pas trouver le même nombre d'ORF avec les deux sites ? 

Sachant que nous avons mis dans les deux cas les mêmes paramètres de recherche. 

Nous trouvons avec SMS 6 ORF et 24 ORF avec NCBI.

 

Bien cordialement.

 

 

D_Gautheret_20
12 Nov 2020 17:45
Game master

Oui car les paramètres sont différents:

- taille min des ORF

- exigence ou non début ATG

- 3 cadres/6 cadres.

Cordialement,

DG