Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: Difficultés d'analyse de l'arbre phylogénétique

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Difficultés d'analyse de l'arbre phylogénétique
alcam
23 Apr 2012 18:22
Contribution non évaluée
Bonjour,
Nous avons un problème avec notre arbre phylogénétique. En effet, il semblerait que notre groupe extérieur (b-proteobacteria) et groupe d'étude (g-proteobacteria) soient mélangés. De plus notre séquence est très similaire à celle d'une Shewenella ( g-proteobacteria), mais leur ancêtre commun est partagé avec des Ralstonia solanacearum (groupe extérieur). Comment doit on interpréter cet arbre ?
Merci
C_Brochier_12
24 Apr 2012 10:50
Maître de jeu
Bonjour,

Si vous pensez que les relations de parentés que vous observez entre vos séquences ne sont pas le résultats d'erreurs de manip, vous devez les interpréter du point de vue biologique. Vous avez deux explications biologiques possibles (à n'invoquer que si vous êtes sur de ne pas avoir fait d'erreur): les duplications suivies de pertes de gènes, ou les transferts horizontaux de gènes.

Bonne continuation

Céline Brochier