Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Sujet de discussion: problème d'alignement multiple

[ Retour aux forums ]
problème d'alignement multiple
amel
18 Mar 2012 13:05
Contribution non évaluée
Bonjour, j\'ai un problème concernant l\'alignement multiple (séquence GOS_3081010.73)
En effet, au début l\'arbre ne sortait meme pas, j\'ai donc enlevé des séquences courtes mais malgré cela je n\'ai que 13 positions retenus, ce qui est fort peu , que dois-je faire ? merci

amel
amel
18 Mar 2012 13:50
Contribution non évaluée
puis j'ai refait (toujours sans les séquences courtes ) mais en cochant les paramètres de stringence 1 et 3 et là je n'ai plus que 6 positions retenues ...
Que faire ? merci
Amel
R_Bourgeas_12
21 Mar 2012 9:02
Maître de jeu
Vous avez des séquences trop courtes encore (voire non homologues).
Je vous donne la principale : gi|2885752
Enlevez celle-ci, et si ce n'est pas assez, regardez quelle autre séquence vous devriez enlever.
En espérant que cela vous aide.

Raphaël