Forum: Alignement multiple: CLUSTALW

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Messages Readers Subject
23 Nov 2023 20:33 Cate L3-PGF-CTES-2023-24
3
15 Arbre
23 Nov 2023 17:09 avigail L3-PGF-CTES-2023-24
7
70 phylogénie
9 Nov 2023 21:31 Yael L3-PGF-CTES-2023-24
7
72 séquences qui commencent en amont de mon ORF
29 May 2023 10:14 wuhan_killers WutAMU2023
2
24 Changer le nombre d'INDELS.
12 May 2023 0:28 Varly L3-PGF-CTES-2023
2
12 Nombres de séquences
28 Apr 2023 17:11 B_Wirth_23 Bioch2023
1
7 Trouver les résidus importants pour la fonction/activité de notre famille de protéines
14 Apr 2023 16:14 Printemps2023 L3-PGF-CTES-2023
1
11 ORF beaucoup plus court que les homologues
14 Apr 2023 13:57 Quentacio Bioch2023
2
27 Construction de l'arbre
31 Mar 2023 13:21 noapardo L3-PGF-CTES-2023
6
68 Choix de groupe d'étude
17 Mar 2023 0:28 AMIRA L3-PGF-CTES-2023
4
32 Choix des groupes extérieurs
3 Mar 2023 22:27 AMIRA L3-PGF-CTES-2023
4
54 Choix de groupe d'étude
2 Mar 2023 9:39 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023
4
64 resultats alignements multiples
28 Feb 2023 10:46 LEVY L3-PGF-CTES-2023
6
87 choisir des séquences
28 Apr 2022 11:41 B_Wirth_22 Bioch2022
1
13 Nombre d'aa manquants aux extrémités : /Blast et /clustalW
21 Apr 2022 15:08 SofiaOuarriche L3-PGF-CTES-2021
2
28 annalyse de l'orf
13 Apr 2022 11:32 soleneA L3-PGF-CTES-2021
2
31 Nombre de gap internes
12 Apr 2022 18:34 Anna L3-PGF-CTES-2021
4
55 Pourcentage identité faible dans l'alignement
5 Apr 2022 14:35 MaeBinaud L3-PGF-CTES-2021
4
88 Choix du groupe d'étude et du groupe extérieur
1 Apr 2022 17:13 maellejarnoux L3-PGF-CTES-2021
5
80 Choix du groupe d'étude
20 Oct 2021 10:28 Benameur L3-PGF-2021
2
36 SITE D INSERTION FCS
20 Oct 2021 10:17 Rahma L3-PGF-2021
2
29 FCS
19 Oct 2021 21:02 Soline1 L3-PGF-2021
2
28 MSA insertion FCS
19 Oct 2021 20:47 CHANGKE L3-PGF-2021
1
14 FCS dans certains CoV
19 Oct 2021 19:08 Lucas17 L3-PGF-2021
1
15 FCS
19 Oct 2021 17:20 JulietteR L3-PGF-2021
1
16 MSA de RdRP
19 Oct 2021 16:16 manonmtz30 L3-PGF-2021
1
19 MSA de RdRP sous format Gblocks montrant conversation des acides aminés
18 Oct 2021 23:57 thibaultbrunet L3-PGF-2021
1
16 MSA de RdRp illustrant les acides aminées conservées
18 Oct 2021 23:20 manonmtz30 L3-PGF-2021
2
31 MSA de spike montrant l'insertion de FCS dans SC2
18 Oct 2021 15:04 Ma-thilde L3-PGF-2021
2
33 Problème d'alignement multiple
18 Oct 2021 15:04 Ma-thilde L3-PGF-2021
1
10 Problème d'alignement multiple
17 Oct 2021 23:21 camr L3-PGF-2021
1
10 MSA de spike qui montre l'insertion de FCS dans SC2
17 Oct 2021 22:41 BulavkaOlha1 L3-PGF-2021
1
8 MSA de Spike avec observation d'insertion d'un FCS dans SC2
17 Oct 2021 22:39 antoinedewitte L3-PGF-2021
2
25 MSA de RdRp avec observation d'une très forte conservation des aa
17 Oct 2021 20:13 Chloe_llk L3-PGF-2021
1
11 MSA de spike avec observation d'insertion d'un FCS dans SC2
17 Oct 2021 19:07 JulietteR L3-PGF-2021
1
12 FCS dans SC2
17 Oct 2021 15:12 antoinedewitte L3-PGF-2021
1
14 MSA de Spike avec observation du FCS dans SC2
16 Oct 2021 18:32 thibaultbrunet L3-PGF-2021
1
12 MSA de spike avec observation d'insertion d'un FCS dans SC2
18 May 2021 11:58 Belmont L3-PGF-CTES-2020
1
9 Potentiel piste
14 May 2021 12:45 Belmont L3-PGF-CTES-2020
2
19 C-terminal
22 Apr 2021 11:15 rachel L3-PGF-CTES-2020
4
48 alignement bizarre
22 Apr 2021 11:14 rachel L3-PGF-CTES-2020
1
10 alignement bizarre
22 Apr 2021 11:06 rachel L3-PGF-CTES-2020
1
5 alignement bizarre
16 Apr 2021 10:01 ElisaM L3-PGF-CTES-2020
2
26 Pause D'AA
16 Apr 2021 10:01 ElisaM L3-PGF-CTES-2020
1
10 Pause D'AA
14 Apr 2021 22:56 lea19 L3-PGF-CTES-2020
3
45 alignement
11 Apr 2021 19:27 sterna L3-PGF-CTES-2020
8
106 positions conservées inf 100
11 Apr 2021 17:15 NAOMIE L3-PGF-CTES-2020
6
84 Alignement multiple erreur
11 Apr 2021 1:12 Hope L3-PGF-CTES-2020
2
26 a.multiple
10 Apr 2021 23:29 Hope L3-PGF-CTES-2020
2
26 nombre de position
7 Apr 2021 17:38 aminaza L3-PGF-CTES-2020
2
27 alignement
23 Mar 2021 10:15 Benjii936 L3-PGF-CTES-2020
8
159 homologie plutot faible
7 Nov 2020 20:15 Fanny_Smahan PGF-2020
2
21 alignement
29 Oct 2020 14:11 HajarIslem PGF-2020
2
18 un souci avec l'alignement
21 Mar 2020 15:50 YasmineMyriam Bioch2020
2
41 questions TP
21 Mar 2020 15:36 YasmineMyriam Bioch2020
2
40 questions TP
17 Mar 2020 19:31 NimboKami Bioch2020
8
225 les Blocs
21 May 2019 20:43 ramonapojar L3-PGF-CTES-2018
3
27 deux protéines dans le meme ORF ?
10 May 2019 23:12 Krystel L3-PGF-CTES-2018
4
69 Gaps à l'intérieur de l'alignement
26 Apr 2019 16:57 nicomine Bioch2019
2
26 Positions conservées et arbres phylogénétique
16 Apr 2019 12:16 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
24 Déterminer la fonction de l'ORF
15 Apr 2019 22:14 teamNN Bioch2019
2
108 analyse attendue
4 Apr 2019 22:01 hayafarouz L3-PGF-CTES-2018
7
157 GROUPE D'etude imprecis mais forte e value
2 Apr 2019 15:03 JulieP L3-PGF-CTES-2018
5
105 Alignement me semblant mauvais
5 Dec 2018 12:30 cocodmt PGF-2018
3
64 Incompréhension
10 May 2018 21:56 sania Bioch2018
3
17 Bug de Gblocks
28 Apr 2018 15:10 MissDia95 Bioch2018
2
10 Protocole
14 May 2017 15:16 ClaraSophie Bioch2017
4
53 Faute dans le cours matrice de programmation dynamique. Chapitre 2
30 Mar 2017 13:50 Vincent-Marine Bioch2017
2
12 Problème de format
28 Oct 2016 15:07 estana BioCell2016
2
49 groupe extérieur/ étude
9 Dec 2015 19:18 Pilgrim BioCell2015
2
30 Erreur d'annotation pour la séquence avec le meilleur alignement
5 Dec 2015 11:49 JuSzLuCi BioCell2015
2
33 Pertes de positions conservés
4 Dec 2014 8:40 ELPO BioCell2014
2
25 Problème d'alignement avec les choix des groupes
4 Nov 2014 20:55 ioanaetlobna BioCell2014
2
76 problème au niveau de l'alignement multiple
31 Oct 2014 15:28 SoulaNin BioCell2014
2
52 Alignement multiple avec GBlocks
21 May 2012 16:14 Bonaiti Biochimie 2012
3
42 error alignement multiple
15 May 2012 9:35 gpe2-roche Biochimie 2012
2
23 Dans le cas d'un second arbre...
11 May 2012 15:26 clemshe Biochimie 2012
3
80 urgent erreur phylogeny.fr
5 May 2012 22:37 gp1sogno Biochimie 2012
4
68 nombre de positions conservées cohérent?
1 May 2012 13:28 groupe2rolland Biochimie 2012
3
91 curation impossible
30 Apr 2012 15:22 clemshe Biochimie 2012
1
8 erreur
18 Mar 2012 13:05 amel Biochimie 2012
3
71 problème d'alignement multiple
2 Mar 2012 11:12 DRAMALOVE Biochimie 2012
3
66 taxonomy report
2 Mar 2012 10:39 Sarahanais Biochimie 2012
3
87 question sur l'alignement multiple
28 Feb 2012 23:24 imane-hafsoi Biochimie 2012
3
135 Rapport taxonomique
28 Feb 2012 12:46 quentlude Biochimie 2012
4
108 Analyse résultats (GOS_2883010.73)
22 Feb 2012 19:25 B_Wirth_12 Biochimie 2012
1
5
22 Feb 2012 19:05 amel-faiza Biochimie 2012
2
47 alignement multiple SI BLASTp vs nr-env
22 Feb 2012 13:25 meline13 Biochimie 2012
6
384 alignement multiple
24 Apr 2011 22:50 reneejenni Biochimie 2011
2
9 entérobactéries introuvables
24 Apr 2011 22:47 reneejenni Biochimie 2011
2
24 définition d'un groupe d'étude
22 Apr 2011 14:40 lakisemedo Biochimie 2011
2
8 vraisemblance du codon start
18 Apr 2011 15:16 meljess Biochimie 2011
2
21 croisement avec INTERPRO
28 Feb 2011 13:42 reneejenni Biochimie 2011
4
88 alignement multiple de séquences protéiques et nucléiques ensemble?
24 Feb 2011 15:54 samiahafsoi Biochimie 2011
10
89 Recherche de groupes d'étude et groupes exterieurs
5 May 2010 21:59 sacha IS-UBP-2010
2
34 info sur le format de fichier a utiliser pour Gblocks
7 Apr 2010 23:15 oralblandine Biochimie 2010
3
69 avec ou sans groupe extérieur?
5 Apr 2010 17:03 soufvinc Biochimie 2010
6
776 Groupes d'étude et groupe externe
2 Apr 2010 11:18 hakuna IS-UBP-2010
8
241 Problème avec le site phylogeny
24 Nov 2009 12:52 sonia2hayiri BioCell2009
4
128 incohérence entre résultats du blast et alignement multiple
21 Nov 2009 8:35 NAME BioCell2009
3
43 probleme de chargement
9 May 2009 11:32 CALAMARS Biochimie 2009
4
59 Les zones de conservation des alignement multiples
2 May 2009 0:17 lorguais Biochimie 2009
2
32 Résultat après GBLOCKS
25 Apr 2009 23:18 marinedalila Biochimie 2009
4
72 G-BLOOK
20 Apr 2009 18:14 RAJESS Biochimie 2009
2
26 paramètre pour l'lignement multiple
2 Apr 2009 15:46 CALAMARS Biochimie 2009
3
113 CLUSTAL W utilisation de la fonction CURATION gblocks
30 Mar 2009 18:04 catnat Biochimie 2009
4
166 problème d'alignement
19 Dec 2008 20:17 casan BioCell2008
9
154 T-Coffee / 3D-Coffee
19 Dec 2008 14:43 Emiso BioCell2008
5
74 Alignement avec t coffee
18 Dec 2008 14:46 Emiso BioCell2008
2
25 mitochondrie
16 Dec 2008 14:56 marmoh BioCell2008
1
11 etiquette 2
16 Dec 2008 13:41 marmoh BioCell2008
4
113 Enlever une séquence ou non !?
16 Dec 2008 10:59 marmoh BioCell2008
6
65 Etiquette
7 Dec 2008 17:46 fowen BioCell2008
2
140 orf complet en 5\'?
26 Nov 2008 23:17 eniyro BioCell2008
11
525 Groupe d'étude et groupe exterieur
29 Nov 2007 9:56 milou BioCell 2007
2
66 groupe exterieur
13 Apr 2007 18:13 giraudaguerre Biochimie 2007
2
52 alignement multiple et HSP
24 Mar 2007 11:17 vleonet1 Biochimie 2007
2
52 Problème dans l'arbre
16 Mar 2007 15:54 sophmon Biochimie 2007
2
53 fonctionnement