Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Sujet de discussion: Analyse résultats (GOS_2883010.73)

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Analyse résultats (GOS_2883010.73)
quentlude
28 Feb 2012 12:46
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Bonjour, (encore nous)
Nous voila un peu perdus pour l'étape où il s'agit d'analyser les résultats bruts de l'alignement multiple avant et après curation. Des pistes seraient les bienvenues.
Merci d'avance
quentlude
29 Feb 2012 13:05
Contribution non évaluée
S'il vous plait...
R_Bourgeas_12
29 Feb 2012 13:25
Maître de jeu
Vous n'avez pas du bien écouter en cours, on vous a dit que l'alignement multiple permet
1) de préparer l'information nécessaire à la construction de l'arbre phylogénétique, donc : L'information présente dans votre alignement multiple est-il de bonne qualité ? (régions conservés importantes, attention, les régions ou toutes les séquences sont identiques n'apportent pas d'information ; longueur de l'alignement suffisant,...)
2) Les informations donnée par l'alignement multiple doivent être croisées avec les informations précédentes pour répondre à plusieurs questions : Les domaines protéiques sont ils bien conservés ? Est-ce que mon ORF commence et se finit bien en accord avec les autres séquences, et ce que je sais de son start et de son stop ?
Vous trouverez encore d'autres informations que l'alignement multiple peut vous fournir en allant voir dans les REGLES DU JEU. On ne vous le dira jamais assez, vous avez pratiquement toute l'information nécessaire inscrite sur les différents supports que vous avez, notamment le tableau à la fin des règles du jeu.

Raphaël Bourgeas
quentlude
29 Feb 2012 13:39
Contribution non évaluée
D'accord, merci beaucoup.