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Pas de séquence homologue à mon ORF trouvées... :( |
BrothTeam
5 Feb 2011 7:54
Contribution non évaluée |
J'ai fait un blastp de mon ORF sur NR puis Swissprot en mettant query subrange from 230 to 955.
Et ça m'a dit qu'il n'y avait pas de résultats... Alors qu'avec interpro j'avais trouvé des domaines conservés potentiels avec des bonnes e-values... |
C_Brochier_11
5 Feb 2011 9:20
Maître de jeu |
Bonjour,
Qu'avez-vous copier/coller comme séquence pour faire votre blast?
Pourquoi avoir mentionné "query subrange from 230 to 955" ?
Céline Brochier |
BrothTeam
5 Feb 2011 10:51
Contribution non évaluée |
J'ai fait un blastp avec
>lcl|Sequence 1 ORF:230..955 Frame +2
MRITIELKKNVNSDLVISDLYKKTSLQTNFGAIFLALIDGKPVQLSLKEYLKQFLEFREITVLKRTKHFL
ELTEEKLEILQGFALAVKNIKRIIEIVQNSENTIEAKSSLEQKLNLTSKQSNAVLSMPIKKLTNLERIQI
DQNIIDLKVKKESLSKILNERTVLLNILEEELKSLKDKYNTKRSTKIVKNINIDDENKVINKQILNELIN
NKAKISIDNKFNIKNLLINNYKKLIENDNKLI
Pour "query subrange from 230 to 955" j'ai voulu faire le connaisseur j'aurais pas dû apparemment! Je croyais qu'il fallait mettre quelque chose. Donc j'ai mis les bornes de mon ORF.
Yoann Pesenti
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BrothTeam
5 Feb 2011 10:58
Contribution non évaluée |
C'est réglé merci |