Loussouarn Margot
Riquet Elodie

Bonjour,
J\'ai fait des blastp contre NR en prenant les groupes du vivant séparement.
Pour les eucaryotes, j\'obtiens 39 resultats avec au début une séquence avec un score de 151 et une e-value de 3.10^-35 puis les sequences suivantes ont toutes des scores inférieurs à 40 et des e-values supérieures à 0,10. J\'obtiens à peu près les mêmes résultats pour les archaea sauf que j\'obtiens trois séquences de 177 à 150 avec des e-values basses puis il y a un gros saut de score, les e-values sont supérieures à 0,05.
ma question est: est-ce qu\'on doit considérer comme homologue les premiers resultats avec des scores élevés?

Merci

Bonjour,

Pour savoir si vos séquences sont homologues, regardez la qualité des alignements locaux obtenus. Si ils vous paraissent suffisamment convaincants alors vous pouvez les considrer comme homologues.

Cordialement,

Céline Brochier