Bonjour

Je n'arrive pas a avoir de resultat quand je colle le format test de Blastp contre NR dans le programme "Definition List"... cela m'affiche "gateway time-out". J'ai essayer avec les resultats du Blastp contre swissprot, et cela marche etrangement.

Pourriez vous m'aider a trouve ou est l'erreur ?

Bien cordialement, 

Bonjour,

Cela me semble une surcharge de serveur. Comme il y a moins de hits à swissport, ça passe, mais ça coince avec 5000 hits de nr.

Dites-moi si le problème persiste pour que je puisse alerter la personne qui s’occupe d’annotathon.

Bon travail,
Emese Meglecz

Bonjour,

Apres plusieurs nouveaux essais, je n'ai toujours pas de resultats...

Cordialement,

Bonjour,

Je viens de faire le BLAST avec votre ORF et j’ai fait tourner l’outil Definition list. Ça prend un peu de temps (1-2 min), mais ça passe sans problème.

Êtes-vous sûr que vous avez copié que le tableau des listes de hits et rien d’autre (par exemple des alignements) ?

Regardez, SVP le vidéo suivant pour vois si vous ne faites pas une erreur de copier-coller quelque part :
https://ametice.univ-amu.fr/pluginfile.php/6315726/mod_resource/content/1/Copier-coller_BLAST.mp4

Bon courage,
Emese Meglecz

Bonjour, 

Il me semble que ce soit mon ordinateur qui ne coopère pas, j'ai beau avoir tout fait comme il faut, cela affiche toujours le même message d'erreur... Ça m'embête beaucoup, d'autant plus que cela m'empêche d'avancer plus loin dans mon analyse... Auriez vous une solution a me proposer ?

Bien cordialement,

Bonjour, 

Il me semble que ce soit mon ordinateur qui ne coopère pas, j'ai beau avoir tout fait comme il faut, cela affiche toujours le même message d'erreur... Ça m'embête beaucoup, d'autant plus que cela m'empêche d'avancer plus loin dans mon analyse... Auriez vous une solution a me proposer ?

Bien cordialement,

Bonjour,

Hier, L'Annotathon a été bloqué. Peut-être le dysfonctionnement de Definition list était un signe avant-coureur de ce problème.
Retentez, SVP, et essayez différents navigateurs (Chrome, firefox..)
De mon côté, j’ai fait suivre le problème à l’administrateur de serveur.

Bon travail,
Emese Meglecz

Pouvez-vous copier dans le bloc-note les infos que vous avez copiées dans l’outil Definition list ?

Merci !

Bonsoir,

Voici les infos que j'avais mis (voir dans le bloc note)

Merci beaucoup pour votre aide,

Bien cordialement, 

Finalement j'ai reussi a trouver une solution, merci !

Apres avoir utiliser "quick go" cela m'affiche ces resultats, differents de ceux dans votre video... comment dois-je les lire et interpreter ?

Bonjour,

Je suis content que ça a marché. Pourriez-vous me dire quelle était votre solution, pour que cela aide aux étudiants s’ils ont le même type de problème ?

Pour l’affichage interpo, vous trouverez les explications dans le cours 'Recherche de la fonction, Recherche du groupe taxonomique'.

La seule différence par rapport au schéma du cours, c’est qu’il y a une bifurcation. C’est assez autoexplicatif. La fonction ‘peptide hormone binding’ fait partie à la fois deux fonctions plus générales » : hormone binding et peptide binding.

Bon travail,
Emese Meglecz