Pour les alignements obtenus par blastp contre refseq prot toutes les e value sont égales à 0, contre swiss prot  la e value min est à 6e-146

J'ai continué pour faire le rapport taxonomique mais la table de synthèse montre des e value égales à 0 pour tous les groupes ; je ne vois pas comment déterminer un groupe extérieur

Faut'il renoncer à cette séquence ?

D'autre part , je n'arrive pas à coller les tableaux excel "correctement"  sur annotathon, y a t'il une manipulation à faire pour le copier coller (autre que ctrl C et  ctrl V) ?

Merci de votre aide

Bonjour,

Vous pouvez tenter de terminer le groupe d’étude sur base des scores à la place des E-valeurs, mais ceci n’est pas le plus pratique.
Il sera plus simple de prendre à peu près la moitié de l’ORF pour faire le BLAST. Comme cela les alignements seront plus courts, et les E-valeurs plus hautes.

Attention, si ça marche, il faut bien inclure l’ORF complète dans l’alignement multiple. La version raccourcie est seulement pour le BLAST pour augmenter artificiellement les E-valeurs.

Pour le copier-coller le tableau à partir d’Excel je n’ai pas de problème. C’est bizarre, que ça ne marche pas chez vous.

Bon travail,

Emese Meglecz