Bonjour,

Suite à mon étude taxonomique je ne trouve qu'au total 24 homologues (en mettant la query coverage min à 40% car à 50% il n'y en avait qu'un seul), comment alors créer deux groupes de 20 et 15 homologues pour els groupes d'études et externes ?

Merci d'avance

Pingeon ophelie.

Bonjour,

Ces nombres sont indicatifs. Si vous n'avez pas suffisamment de séquences ou si vous ne pouvez pas définir de groupe d'étude ou de groupe extérieur, alors, il vous devez adapter votre approche (travailler sans groupe extérieur) ou travailler avec moins de séquences.

Concernant la séquence étudiée ici, vous pouvez/devez vous interroger sur le fait que les séquences détectées par blast sont réellement des homologues ou non à votre séquence. Comem vous l'avez remarqué, la séquence étudiée s'aligne de manière très partielle avec les séquences détectées dans la banque. Par ailleurs, les séquences de la banque sont de très grande taille. Il vous faudra être très prudent dans l'interprétation des résultats et la suite des analyses.

Bien cordialement,

Céline Brochier