Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: nombre d'alignement BLAST

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nombre d'alignement BLAST
aminaza
24 Mar 2021 11:00
Non evaluated contribution

bonjour , pour ORF 2 j'ai trouvé 245 alignement , est ce que c'est suffisant ? cordialement

Meglecz20CTES
24 Mar 2021 11:27
Game master

Bonjour Amina,


C’est un peu limite, mais s’il répond aux autres critères, vous pouvez l’utiliser.
Vous avez que 3 séquences dans votre panier. Je garderais cette séquence en réserve et essayerais de tester rapidement plusieurs d’autre par BLASTx (https://amupod.univ-amu.fr/video/2346-recherche-rapide-de-la-sequence-a-annoter/) .

 

Cordialement,
Emese Meglecz