Forum "Analyse phylogénétique"

Thread subject: Lineage report VS TaxList : E-valeur

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Lineage report VS TaxList : E-valeur
AnaisE
18 Mar 2021 13:09
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Bonjour,

 

Dans mon rapport taxonomique, je vois au début 129 hits chez les Gammaproteobacteria avec une E-valeur min de 9e-122 :

 

 

Dès que le passe mes résultats dans TaxList, l'E-valeur min des Gammaproteobacteria passe à 60 hits et 2e-110 :

 

 

Pourquoi cela se produit-il et quel rapport doit-on croire ?

Cela changerait mon groupe d'étude, même s'il me semble que mes résultats pour cette séquence sont dans tous les cas trop mauvais pour arriver au bout de l'analyse sans encombre.

Meglecz20CTES
19 Mar 2021 13:01
Game master

Ce n’est pas normal du tout. Je signale le souci aux personnes qui entretient l’Annotathon et je reviens vers vous avec la réponse… ou plutôt quand le bug sera corrigé.


Emese Meglecz

 

AnaisE
19 Mar 2021 14:09
Non evaluated contribution

D'accord, merci, tenez-moi informée. J'ai vu plusieurs lignes "disparaître" ainsi et je pensais qu'elles n'étaient pas reconnues par TaxList ou que cela faisait partie des remaniements normaux de leur programme. Je vous dirais si je constate des problèmes similaires avec la séquence que j'annote actuellement (OMRGCv2_9702170).