Bonjour, 

Nous avions choisi les eukaryota comme groupe extérieur or vous nous avez corrigé en nous disant que cela est faux. Nous n'arrivons donc pas à identifier le groupe externe et le groupe d'intéret.  

Merci par avance de nous éclairer sur ce point.

PRAT Rosalie et VALLANTIN Pierre

Bonjour,

c'est visiblement la sélection des séq du groupe d'étude + externe qui posait problème, car elle était totalement incohérente avec ce que vous aviez annoncé dans l'analyse des résultats.

Reprenez votre analyse des résultats :

- qu'avez-vous annoncé comme groupe d'étude ? Et vérifiez TOUTES les séq sélectionnées pour le groupe d'étude. Est-ce que ça correspond à ce qui a été annoncé ? Ces séq forment-elles bien un groupe monophylétique ?

- qu'avez-vous annoncé comme groupe externe ? Et vérifiez les séq sélectionnées pour ce groupe. Est-ce que ça correspond à ce qui a été annoncé ?

De plus, comment doit-être le groupe externe ? comment le choisit-on ? cf Document Phylogénie déposé dans la section TP sur AMETICE.

Pour Rappel :

1/ Définir le groupe d’étude de telle sorte qu’il représente une lignée taxonomique réelle. Ce doit être un groupe monophylétique. ⇒ Choisir les séquences parmi l’ensemble de ces lignées de telle sorte que l’ensemble des lignées soit représentées.

2/ Définir un groupe extérieur constitué de l’ensemble des lignées de même niveau taxonomique que le groupe d’étude. ⇒ Choisir les séquences parmi l’ensemble de ces lignées de telle sorte que l’ensemble des lignées soit représentées.

==> Vos séq sélectionnées pour le groupe externe (EuK), sont-elles bien de même niveau taxonomique que le groupe d'étude annoncé ?

N'hésiez pas si vous avez d'autres questions.

Bon travail

BW