Bonjour,

Suite à votre correction, vous nous avez dit que nos groupes d'étude et extérieur étaient faux, or cela nous a été conseillé par l'une des personnes qui vous accompagne.
Nous pensions vous demander conseil aujourd'hui, mais vous n'êtes pas là.

En espérant avoir une réponse rapide de votre part,
Cordialement

Léa et Franck

Finalement, nous avons répondu à nos problèmes mais apparemment ce soucis est arrivé dans d'autre groupes comme tuxx et LaurieNoemie.

Je vous avais mis les indications dans la correction, je pense...
Vous avez effectivement affaire à un des cas particuliers...
Que choisissez vous finalement comme groupe d'etude et externe ?

BW

Bonjour,

Effectivement vous nous avez donnés des instructions. Pour le groupe d'étude il comprendrait les cyanobactéries et les eucaryotes photosynthétiques. Le fait qu'on se base sur la théorie endosymbiotique, nous permet-il de dire que il s'agit bien d'un groupe monophylétique ?
Dans ce groupe d'étude, est-ce que nous devons prendre 10 séquences de cyanobactéries et 10 séquences eucaryotes ? Faut-il les choisir équitablement en fonction de chaque classe ou faut-il les équilibrer en fonction du nombre de fois ou elles apparaissent (si une classe a 44 séquences et l'autre 9 par exemple, on prendrait plus de celle où il y en a 44 par rapport à la classe où il n'y a que 9 séquences) ?

Merci,
Léa et Franck

Bonjour,

- Groupe d'étude : cyanobactéries et eucaryotes photosynthétiques ==> Oui
- la théorie endosymbiotique... nous permet-il de dire que il s'agit bien d'un groupe monophylétique
==> oui, ces séquences eucaryotes chloroplastiques ont une origine commune avec les cyanobactéries, elles sont apparentées aux séq de cyano- du fait de l'endosymbiose.
- 10 séquences de cyanobactéries et 10 séquences eucaryotes
==> Non, représentez les différents sous-groupes de cyanobactéries de manière homogène + qq séq eucaryotes. Autant que pour les différents sous-groupes de cyano- par exemple.
- Faut-il les choisir équitablement en fonction de chaque classe ou faut-il les équilibrer en fonction du nombre de fois ou elles apparaissent (si une classe a 44 séquences et l'autre 9 par exemple, on prendrait plus de celle où il y en a 44 par rapport à la classe où il n'y a que 9 séquences) ?
==> Représentez les différents sous-groupes de cyanobactéries de manière homogène : autant de séq pour chaque sous-groupe. C'est pour voir si vous retrouvez les différents sous-groupes sur vos arbres, et pour voir si votre séq s'insère bien dans un sous-groupe en particulier, ce qui permettra de préciser votre assignation taxonomique.

Bon travail,
BW