Bonjour,

Nous avons un doute sur le choix de nos groupes. Nous pensions choisir les Cyano en groupe d'étude et les Protéo en groupe externe mais nous nous demandons si prendre les Cyano Prochlorales en étude et les autres Cyano en externe ne serait pas jouable au vue du différentiel de E-Value : Prochorales vont de 8e-179 à 9e-15 (un seul est à 9e-15 sinon les autres s'arrêtent à e-30) et les autres Cyano vont de 9e-82 à 9-17.

Nous vous remercions.

Dans ce cas, la deuxième solution semble la plus judicieuse car en effet le différentiel de E-value est absolument gigantesque (quasi 100 logs!!!) entre les Prochorales et les meilleurs hits des autres Cyano ce qui augure d'un excellent alignement multiple et d'un très robuste groupe extérieur. Pourquoi aller chercher encore plus loin un groupe extérieur alors qu'avec un tel panorama des hits BLAST, on peut très raisonablement s'attendre que dans votre arbre votre ORF emergera de la branche des Prochorales?