Pour notre orf nous avons effectué un Blast P contre nr et les resultats montrent peu de sequences homologues
(score le plus élevé 151, puis le suivant est de 65.9) et surtout quasiment que des "hypotetical protein".
devons nous effectuer un autre type de Blast, ou travailler à partir de ces résultats?

Vu que vous n'avez qu'un seul ORF couvrant la totalité de votre ADN un BLASTx est inutile.

Les hits sont en effet limite au delà du premier; seul une aln multiple des quelques meilleurs pourra suggérer si vous avez une famille d'homologues avec lesquels travailler.

Enfin vous pourrez éventuellement trouver des homologues supplémentaires en faisant un BLAST contre le banque ENV(ironnementale), même si ce ces homologues là ne pourront pas vous aider à préciser l'origine taxonomique de votre ADN.