Bonjour,

Nous sommes face à une difficulté d'interprétation de notre arbre. Dans notre rapport taxonomique, nous avions 3 "groupes" qui semblent bien représentés les gammma-protéobactéries, les firmicutes et les high-gc-percent. Nous avons choisit des firmicutes en groupe extérieur et les gamma-protéobactéries, or dans les gamma-protéobactéries, on ne retrouve que peu d'espèces différentes.

Dans l'arbre on se rend compte que les groupes ne semblent pas très bien séparés et on voit que les 3 espèces de protéobactéries qui sont "éloignées" sont celle qui possèdent le plus faible score ? Cependant, on ne peut pas les éliminer sinon on perd la diversité des gamma-protéobactéries. Alors comment expliquer cette branche dans notre arbre ?

Cordialement,

Team Nanais

Bonjour,

Ce que vous dites est en agrément avec les remarques que je vous ai faites lors de la première correction. Vous devez réfléchir aux explications biologiques pouvant expliquer vos observations (ainsi que mes remarques).

Bonne continuation,

Céline Brochier