Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: choix du groupe extérieur

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choix du groupe extérieur
anabe
26 Nov 2007 11:37
Contribution: Pertinent
il y  a une question que je me pose depuis le début : j'ai défini le groupe d'étude comme étant les
protéobactéries ( avec à l'intérieur des alpha, beta et gammaproteo afin de représenter au mieux l'ensemble
de ce groupe). mais je n'arrive pas à choisir le groupe extérieur : doit-il comporter 1 seul groupe ou
plusieurs ; en d'autres termes, le groupe extérieur peut il être composé des firmicutes cyanobactéries
actinobactéries ... ou seulement représentatif d'un seul groupe comme les firmicutes?
Vous remerciant d'avance...
byuuu
26 Nov 2007 12:44
Contribution: Constructive
En fait je pense que le mieu c'est de choisir par exemple les firmicutes
en tant que groupe extérieur puis de rajouter les cyano et les actino dans ton
arbre afin d'être sûr que ton groupe d'étude ne comprend pas les cyano ni les
actino.