Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: Comment choisir les homologues ?

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Comment choisir les homologues ?
nanais
11 Mar 2012 17:18
Non evaluated contribution
Bonjour,
Nous nous posions une question concernant le choix des homologues protéiques ?
Après avoir effectué un BLASTP classique contre NR avec 500 match visibles, nous nous retrouvons avec de très nombreuses séquences qui matchent. Comment choisir la plus "proche" sachant que les premières E-value sont très proches ? Faut-il recouper avec les domaines protéiques identifiés précédement (BaxI_1) ?

Merci pour vos réponses !

Team Nanais
C_Brochier_12
13 Mar 2012 14:42
Game master
Bonjour,

Je pense que le cours de ce matin à du clarifier cette question. Si ce n'est pas le cas, n'hésitez pas à me solliciter de nouveau via le forum.

Céline Brochier