Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Thread subject: Absence de résultats pour la recherche de domaines protéiques

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Absence de résultats pour la recherche de domaines protéiques
VinJenni
18 Feb 2012 12:02
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Bonjour,

nous travaillons actuellement sur le fragment GOS_2865030.15. Lorsque nous entrons la séquence protéique résultante de l'ORF que nous avons sélectionné, pour la recherche de domaines protéiques, INTERPRO ainsi que PROSITE ne trouvent pas de résultats. Est ce normal?

Cordialement, VinJenni.
R_Bourgeas_12
18 Feb 2012 12:10
Game master
Bonjour,

J'ai refait les analyses et elles sont bonnes : vous avez choisi le bon ORF, mais effectivement, il n'existe
R_Bourgeas_12
18 Feb 2012 12:13
Game master
Bonjour,\r\n\r\nJ\'ai refait les analyses et elles sont bonnes : vous avez choisi le bon ORF, mais effectivement, il n\'existe aucun domaine protéique répertorié qui y correspond. Ce n'est pas grave, cela peut arriver, continuez l'annotation normalement.

Il est à noter que PROSITE est intégré dans INTERPRO, donc si vous aviez fait la recherche sur INTERPRO et n'avez rien trouvé, il n'est pas nécessaire de faire de recherche dans PROSITE.

Raphaël
VinJenni
18 Feb 2012 12:40
Non evaluated contribution
Bonjour,

Merci de nous avoir répondu aussi rapidement.

VinJenni